MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 7674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017043	TAA	2	6	993792	993797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017043	TAGT	2	8	993874	993881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017043	GCT	2	6	993899	993904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_017043	ATA	2	6	994025	994030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017043	AGT	2	6	994065	994070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017043	GTA	2	6	994073	994078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017043	CGA	2	6	994094	994099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_017043	GCTT	2	8	994106	994113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_017043	CAA	2	6	994180	994185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_017043	ACGAT	2	10	994235	994244	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6011	NC_017043	ACA	2	6	994250	994255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_017043	TAA	2	6	994266	994271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017043	TAG	2	6	994295	994300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017043	A	6	6	994305	994310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017043	TTA	2	6	994328	994333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017043	GA	3	6	994369	994374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017043	ATTGCA	2	12	994408	994419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6018	NC_017043	A	6	6	994431	994436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017043	AT	3	6	994444	994449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017043	TGA	2	6	994455	994460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_017043	CAA	2	6	994463	994468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_017043	CAAG	2	8	994501	994508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_017043	TAC	2	6	994533	994538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_017043	TAT	2	6	994566	994571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017043	TTC	2	6	994841	994846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_017043	TGC	2	6	994854	994859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_017043	A	6	6	994894	994899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017043	A	6	6	994942	994947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017043	TAT	2	6	995017	995022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017043	TAG	2	6	995067	995072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017043	TAT	2	6	995114	995119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017043	ACC	2	6	995152	995157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_017043	GGT	2	6	995174	995179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017043	AT	3	6	995397	995402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017043	GTC	2	6	995454	995459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_017043	TTG	2	6	995480	995485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6038	NC_017043	TA	3	6	995567	995572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017043	A	6	6	995581	995586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017043	AAT	2	6	995628	995633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017043	GAAA	2	8	995662	995669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017043	TAT	2	6	995672	995677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017043	TAT	2	6	995683	995688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017043	GTT	2	6	998452	998457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017043	GTC	2	6	998525	998530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6047	NC_017043	TTG	2	6	998545	998550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_017043	CAA	2	6	998623	998628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017043	ATA	2	6	998670	998675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017043	TTA	2	6	998736	998741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_017043	C	6	6	998767	998772	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6053	NC_017043	TAA	2	6	998817	998822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_017043	T	7	7	998867	998873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017043	ACT	2	6	998874	998879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6057	NC_017043	TC	3	6	999274	999279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_017043	TAT	2	6	999328	999333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017043	TAA	3	9	999337	999345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017043	TAG	2	6	999355	999360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_017043	TAT	2	6	999361	999366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017043	TAA	2	6	1000164	1000169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017043	ATT	2	6	1000359	1000364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_017043	T	7	7	1000363	1000369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017043	GAA	2	6	1000372	1000377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017043	T	6	6	1000386	1000391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6068	NC_017043	TG	3	6	1000451	1000456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017043	AT	3	6	1000464	1000469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017043	TAA	2	6	1000473	1000478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6072	NC_017043	CTTA	2	8	1000938	1000945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_017043	TAT	2	6	1000969	1000974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_017043	T	6	6	1000974	1000979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6081	NC_017043	TAT	3	9	1002556	1002564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_017043	AAG	2	6	1002579	1002584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017043	TAAT	2	8	1002669	1002676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_017043	TAG	2	6	1002678	1002683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_017043	ATA	2	6	1003313	1003318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_017043	AAT	2	6	1003347	1003352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017043	GTAA	2	8	1003398	1003405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_017043	ATA	2	6	1003408	1003413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_017043	TGG	2	6	1003422	1003427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6094	NC_017043	GGA	2	6	1003608	1003613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_017043	TAG	2	6	1003637	1003642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_017043	A	7	7	1003676	1003682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_017043	ACA	2	6	1003691	1003696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_017043	ACC	2	6	1003797	1003802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_017043	CT	3	6	1003818	1003823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_017043	TTAG	2	8	1004046	1004053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_017043	ACT	2	6	1004132	1004137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_017043	TCAA	2	8	1004297	1004304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_017043	CAGA	2	8	1004333	1004340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_017043	AGA	2	6	1004430	1004435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017043	AAC	2	6	1004440	1004445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_017043	AGC	2	6	1004463	1004468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_017043	CAT	2	6	1004469	1004474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_017043	AAAG	2	8	1004477	1004484	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_017043	CAA	2	6	1004522	1004527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_017043	CCTGAA	2	12	1004796	1004807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017043	GATT	2	8	1004845	1004852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_017043	GA	3	6	1004945	1004950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_017043	GAA	2	6	1004992	1004997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017043	TTA	2	6	1005057	1005062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6117	NC_017043	CGG	2	6	1005172	1005177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_017043	CGAAG	2	10	1005402	1005411	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6120	NC_017043	TGG	2	6	1005504	1005509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017043	GC	3	6	1005551	1005556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_017043	GACAA	2	10	1005629	1005638	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6123	NC_017043	GGT	2	6	1005668	1005673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_017043	TGA	2	6	1005729	1005734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017043	CGA	2	6	1005752	1005757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_017043	TCA	2	6	1005783	1005788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_017043	CGT	2	6	1005863	1005868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_017043	TGG	2	6	1005956	1005961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_017043	ACC	2	6	1006079	1006084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_017043	TG	3	6	1006117	1006122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_017043	GATT	2	8	1006146	1006153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_017043	TA	3	6	1006178	1006183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_017043	GTA	2	6	1006203	1006208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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