MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017042	AT	3	6	643582	643587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017042	CTA	2	6	643598	643603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017042	ACTT	2	8	643767	643774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_017042	GCG	2	6	643816	643821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017042	AAAT	2	8	643884	643891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017042	GAT	2	6	643902	643907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017042	TAG	2	6	643928	643933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017042	CTA	2	6	643946	643951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017042	TTTG	2	8	643976	643983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017042	GTC	2	6	644016	644021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017042	GGTT	2	8	644055	644062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017042	ACATA	2	10	644121	644130	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_017042	GTA	2	6	644173	644178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017042	AAC	2	6	644181	644186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017042	ATAA	2	8	644224	644231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017042	TGC	2	6	644310	644315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017042	ACT	2	6	644362	644367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_017042	CAT	2	6	644372	644377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017042	AAGG	2	8	644477	644484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017042	AAT	2	6	644496	644501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017042	CAT	2	6	644579	644584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_017042	ATATTA	2	12	644623	644634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017042	CTT	2	6	644672	644677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_017042	TAGTAT	2	12	644699	644710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017042	GTT	2	6	644714	644719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017042	GCG	2	6	644762	644767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017042	TAT	2	6	644772	644777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017042	ATC	2	6	645220	645225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017042	TTA	2	6	645227	645232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017042	TAC	2	6	645388	645393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017042	ATAG	2	8	645406	645413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017042	TTAATA	2	12	645440	645451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017042	CGGT	2	8	645554	645561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_017042	TAT	2	6	645611	645616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017042	TGC	2	6	645618	645623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017042	TTG	2	6	645660	645665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017042	GCA	2	6	645698	645703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017042	TA	3	6	645749	645754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017042	ATAA	2	8	645780	645787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017042	TTTAC	2	10	645809	645818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4041	NC_017042	GGTA	2	8	645832	645839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017042	GCT	2	6	645852	645857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017042	AGT	2	6	645917	645922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017042	TCG	2	6	645964	645969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017042	TAG	3	9	646009	646017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017042	TAA	2	6	646159	646164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017042	TA	3	6	646565	646570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017042	CTT	2	6	646677	646682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017042	TCA	2	6	646688	646693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017042	GCT	2	6	646823	646828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017042	ATG	3	9	646852	646860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017042	TAA	2	6	646879	646884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017042	TATCAA	2	12	646901	646912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4054	NC_017042	ATT	2	6	646920	646925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017042	CTG	2	6	646965	646970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017042	TGT	2	6	646971	646976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017042	TAA	2	6	647041	647046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017042	ATT	2	6	647629	647634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017042	TAA	2	6	647718	647723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017042	GGA	2	6	647845	647850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017042	ATT	3	9	647854	647862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017042	AAT	2	6	647874	647879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017042	AGT	2	6	647887	647892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017042	AGA	2	6	647945	647950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017042	AT	3	6	647975	647980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017042	AAAT	2	8	648031	648038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017042	ATTA	2	8	648053	648060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017042	TAT	2	6	648106	648111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017042	T	6	6	648111	648116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017042	AACT	2	8	648118	648125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_017042	TAA	2	6	648141	648146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017042	TCAC	2	8	648208	648215	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4074	NC_017042	T	7	7	649352	649358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017042	T	6	6	649370	649375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017042	T	6	6	649466	649471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017042	T	6	6	649527	649532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017042	AAT	2	6	649533	649538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017042	TCT	2	6	649566	649571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017042	TTA	2	6	649644	649649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017042	TGATC	2	10	649725	649734	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4083	NC_017042	T	6	6	649742	649747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017042	AATAA	2	10	649755	649764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017042	ATA	2	6	649953	649958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017042	AGC	2	6	649981	649986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017042	TA	3	6	650176	650181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017042	TCA	2	6	650182	650187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017042	GAG	2	6	652311	652316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017042	A	7	7	652349	652355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017042	CAA	2	6	652440	652445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017042	CCT	2	6	652448	652453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_017042	ATG	2	6	652458	652463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017042	A	6	6	652478	652483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017042	CAAAAA	2	12	652485	652496	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4096	NC_017042	TAT	2	6	657255	657260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017042	TTA	2	6	657314	657319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017042	ATTT	2	8	657346	657353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017042	AAT	2	6	657360	657365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017042	T	6	6	657416	657421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017042	GAA	2	6	657452	657457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017042	TAT	2	6	657488	657493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017042	TGA	2	6	658092	658097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017042	TA	3	6	658139	658144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017042	A	7	7	658149	658155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017042	TCTA	2	8	660774	660781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_017042	TAT	2	6	660802	660807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017042	T	6	6	660807	660812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017042	ATT	2	6	660862	660867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017042	GTT	2	6	660878	660883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017042	ACC	2	6	660938	660943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_017042	A	7	7	660954	660960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017042	GTA	3	9	660961	660969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017042	ACT	2	6	660979	660984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017042	TGC	2	6	661015	661020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_017042	ATT	2	6	661047	661052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017042	TTA	2	6	661143	661148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017042	TAT	2	6	661165	661170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017042	CCA	2	6	661183	661188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_017042	TCT	3	9	661226	661234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017042	TAAC	2	8	661248	661255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_017042	T	7	7	661316	661322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017042	TAAT	2	8	661355	661362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017042	TAA	2	6	661515	661520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017042	AAT	2	6	662159	662164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017042	GTT	2	6	662165	662170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017042	A	8	8	662224	662231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017042	A	6	6	662234	662239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017042	ACA	2	6	662270	662275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_017042	TGC	2	6	663938	663943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_017042	CAT	2	6	663959	663964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_017042	CT	3	6	664042	664047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_017042	TTTAA	2	10	666197	666206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017042	A	7	7	666205	666211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4136	NC_017042	GAG	2	6	667291	667296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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