MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 8856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_017042	TGT	2	6	1146890	1146895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017042	ATTT	2	8	1147848	1147855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017042	TTA	2	6	1147954	1147959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017042	TAT	2	6	1147986	1147991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017042	TTA	2	6	1148016	1148021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017042	AT	3	6	1148078	1148083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017042	TAA	2	6	1148110	1148115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017042	AT	3	6	1148118	1148123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017042	T	10	10	1148178	1148187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017042	T	6	6	1149803	1149808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017042	GAA	2	6	1149912	1149917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017042	TGAGGC	2	12	1149965	1149976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8014	NC_017042	AAC	2	6	1149997	1150002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_017042	AG	3	6	1150013	1150018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017042	T	6	6	1150067	1150072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_017042	TAT	2	6	1150077	1150082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_017042	TAC	2	6	1150095	1150100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_017042	A	6	6	1150107	1150112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017042	GAT	2	6	1150118	1150123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017042	A	6	6	1150147	1150152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017042	AAT	2	6	1150167	1150172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017042	T	6	6	1150742	1150747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017042	ATA	2	6	1150800	1150805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017042	AC	3	6	1151157	1151162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8026	NC_017042	T	7	7	1152083	1152089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017042	TGAA	2	8	1152612	1152619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017042	ATT	2	6	1152849	1152854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017042	ACC	2	6	1152903	1152908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8030	NC_017042	ACCTC	2	10	1152911	1152920	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8031	NC_017042	TCT	2	6	1153138	1153143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_017042	GT	3	6	1153165	1153170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017042	AT	4	8	1153186	1153193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017042	ATT	2	6	1153212	1153217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017042	ATA	2	6	1153235	1153240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_017042	CA	3	6	1153256	1153261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_017042	T	8	8	1155437	1155444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017042	TGT	2	6	1155450	1155455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017042	AGT	3	9	1156229	1156237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017042	GGAGC	2	10	1156266	1156275	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8041	NC_017042	GAC	3	9	1156311	1156319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_017042	AAT	2	6	1156669	1156674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017042	TCT	2	6	1156678	1156683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_017042	AT	3	6	1157549	1157554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017042	TAAA	2	8	1157576	1157583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8047	NC_017042	GTTT	2	8	1157618	1157625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017042	ATA	2	6	1157978	1157983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017042	T	6	6	1158049	1158054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017042	A	6	6	1158106	1158111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017042	ATC	2	6	1158165	1158170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_017042	ATG	2	6	1158183	1158188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017042	CTT	2	6	1158346	1158351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_017042	TTC	2	6	1158383	1158388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_017042	T	7	7	1158409	1158415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017042	T	6	6	1158427	1158432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017042	TAG	2	6	1158464	1158469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017042	TTAAA	2	10	1158494	1158503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017042	AT	3	6	1158514	1158519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_017042	AAAAT	2	10	1158580	1158589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017042	CTT	2	6	1158596	1158601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_017042	AT	3	6	1158620	1158625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_017042	AG	3	6	1158628	1158633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017042	GAA	2	6	1158665	1158670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_017042	AGA	2	6	1158735	1158740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_017042	CTT	2	6	1158746	1158751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_017042	TTTC	2	8	1158767	1158774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8071	NC_017042	ATA	2	6	1158935	1158940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8075	NC_017042	GAC	2	6	1159210	1159215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8081	NC_017042	GTT	2	6	1162104	1162109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8083	NC_017042	CAA	2	6	1162211	1162216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_017042	GAT	2	6	1162234	1162239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_017042	TAATA	2	10	1163132	1163141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8097	NC_017042	ATA	2	6	1164049	1164054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_017042	ATTTA	2	10	1165297	1165306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8103	NC_017042	AT	3	6	1165398	1165403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8106	NC_017042	TATT	2	8	1165469	1165476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017042	TA	3	6	1165480	1165485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017042	TAA	2	6	1165487	1165492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017042	CTAT	2	8	1165507	1165514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8111	NC_017042	TAC	2	6	1166166	1166171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8113	NC_017042	A	6	6	1166189	1166194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017042	TAAC	2	8	1166195	1166202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8115	NC_017042	CT	3	6	1166293	1166298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8116	NC_017042	TAA	2	6	1167226	1167231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8119	NC_017042	CTT	2	6	1167510	1167515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8121	NC_017042	T	6	6	1169087	1169092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017042	TGA	2	6	1169123	1169128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017042	TTA	2	6	1169147	1169152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017042	CT	3	6	1169171	1169176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_017042	TA	3	6	1172125	1172130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_017042	T	6	6	1174580	1174585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017042	TA	3	6	1174589	1174594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017042	ATT	2	6	1174600	1174605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8131	NC_017042	A	7	7	1175404	1175410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_017042	TAT	2	6	1175411	1175416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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