MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016931	GATG	2	8	573250	573257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016931	CGA	2	6	573304	573309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016931	GAT	2	6	573329	573334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016931	GCA	2	6	573378	573383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_016931	GAGT	2	8	573429	573436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016931	CAG	2	6	573521	573526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_016931	GTT	2	6	573552	573557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016931	ACT	2	6	573644	573649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_016931	GTA	2	6	573660	573665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016931	GAT	2	6	573669	573674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016931	AGG	2	6	573711	573716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016931	TGG	2	6	573997	574002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016931	TTC	2	6	574024	574029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_016931	CA	4	8	574043	574050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_016931	GTC	2	6	574065	574070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_016931	TCGTG	2	10	574074	574083	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_016931	GGA	2	6	574179	574184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016931	TCA	2	6	574204	574209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_016931	AC	3	6	574398	574403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_016931	GGT	2	6	574439	574444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016931	CCT	2	6	574537	574542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_016931	TTTCT	2	10	574647	574656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_016931	T	7	7	574656	574662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016931	TCT	2	6	574676	574681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_016931	AAAG	2	8	574704	574711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016931	TA	3	6	574745	574750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016931	TAA	2	6	574829	574834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016931	TTA	2	6	574842	574847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016931	GAA	2	6	575014	575019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016931	ATT	2	6	575097	575102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016931	AT	3	6	575106	575111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016931	CTG	2	6	575127	575132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_016931	TTA	2	6	575137	575142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016931	AAT	2	6	575162	575167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016931	TTG	2	6	575173	575178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016931	CAA	2	6	575193	575198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_016931	TAT	2	6	575230	575235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016931	AATTT	2	10	575292	575301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016931	TAA	2	6	575397	575402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016931	TAA	2	6	575443	575448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016931	AC	3	6	575479	575484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_016931	A	6	6	575518	575523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016931	ATA	2	6	575543	575548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016931	AAC	2	6	575646	575651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_016931	TAA	2	6	575689	575694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016931	TCA	3	9	575767	575775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_016931	ATA	2	6	575817	575822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016931	TATTAA	2	12	575839	575850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016931	AGT	2	6	575895	575900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016931	TAA	2	6	576057	576062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016931	GAT	2	6	576064	576069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016931	TAT	2	6	576477	576482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016931	TAT	2	6	576504	576509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016931	TTAT	2	8	576512	576519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016931	ATT	2	6	576550	576555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016931	ATT	2	6	576572	576577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016931	TAT	2	6	576589	576594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016931	AGC	2	6	576611	576616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_016931	T	6	6	576672	576677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016931	TTA	2	6	576680	576685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016931	TA	3	6	576689	576694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016931	T	6	6	576700	576705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016931	T	6	6	576728	576733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016931	TTG	2	6	576754	576759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016931	A	7	7	576799	576805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016931	TAAT	2	8	576806	576813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016931	AT	3	6	576812	576817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016931	TA	3	6	576842	576847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016931	A	6	6	576862	576867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016931	CTG	2	6	576915	576920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_016931	T	7	7	576971	576977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016931	AT	3	6	576986	576991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016931	ATT	2	6	577004	577009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_016931	A	6	6	577020	577025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016931	AGT	2	6	577071	577076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_016931	AT	3	6	577089	577094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016931	ATTA	2	8	577097	577104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016931	TAA	2	6	577126	577131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016931	ATA	2	6	577135	577140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016931	AAT	2	6	577151	577156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016931	A	6	6	577160	577165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016931	AT	3	6	577179	577184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016931	TGG	2	6	577200	577205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016931	AACA	2	8	577218	577225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_016931	TCAT	2	8	577278	577285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_016931	T	6	6	577289	577294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016931	TAT	2	6	577313	577318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016931	CTT	2	6	577338	577343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_016931	CCT	2	6	577350	577355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_016931	GCAA	2	8	577423	577430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_016931	TCTT	2	8	577440	577447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_016931	AAG	2	6	577478	577483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016931	TAA	2	6	577486	577491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016931	GAA	2	6	577495	577500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016931	CAT	2	6	578622	578627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_016931	TCG	2	6	578631	578636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_016931	ATTGA	2	10	578687	578696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016931	ATT	2	6	578722	578727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016931	TAC	2	6	578729	578734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_016931	TAA	3	9	578764	578772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016931	GAA	2	6	578841	578846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016931	TA	3	6	578847	578852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016931	TAA	2	6	579215	579220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016931	T	7	7	579245	579251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016931	AGA	2	6	579276	579281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016931	TTA	2	6	579306	579311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016931	TAA	2	6	579328	579333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016931	TA	3	6	579410	579415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016931	TAA	2	6	581033	581038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016931	ATT	2	6	581047	581052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016931	GCTT	2	8	581063	581070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_016931	GTC	2	6	581085	581090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_016931	GCGA	2	8	581094	581101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_016931	GTT	2	6	581110	581115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016931	CAA	2	6	581182	581187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_016931	A	6	6	581219	581224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016931	A	6	6	581229	581234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016931	T	6	6	581249	581254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016931	CT	3	6	581453	581458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_016931	TAA	2	6	581482	581487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016931	ATT	2	6	581861	581866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016931	CGAA	2	8	582013	582020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_016931	ATTA	2	8	582028	582035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016931	ATA	2	6	582745	582750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016931	T	7	7	582752	582758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016931	T	7	7	582775	582781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016931	AATC	2	8	582806	582813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_016931	ATA	2	6	582815	582820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016931	TTA	2	6	584031	584036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016931	GCA	2	6	584045	584050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_016931	TTC	2	6	584053	584058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_016931	GCA	2	6	584078	584083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_016931	AAT	2	6	584123	584128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_016931	GAA	2	6	584164	584169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4137	NC_016931	AATT	2	8	584210	584217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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