MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016931	AAT	2	6	241947	241952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016931	TAG	2	6	241991	241996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016931	TTCT	2	8	242145	242152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_016931	TTTA	2	8	242175	242182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016931	T	6	6	242199	242204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016931	AAC	2	6	242214	242219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016931	CTT	2	6	242315	242320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_016931	TAG	3	9	242408	242416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016931	GCT	2	6	242438	242443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_016931	TC	3	6	242480	242485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_016931	TCA	2	6	242506	242511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_016931	TTC	2	6	242523	242528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016931	ATT	2	6	242676	242681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016931	GTT	3	9	242724	242732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016931	TAT	2	6	242744	242749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016931	TGC	2	6	244440	244445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_016931	TAA	2	6	245219	245224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016931	GGA	2	6	245317	245322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016931	TACC	2	8	245401	245408	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_016931	TC	3	6	245530	245535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_016931	ATT	2	6	245707	245712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016931	ATA	2	6	245713	245718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016931	TGGAG	2	10	245730	245739	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016931	TAAA	2	8	245761	245768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016931	TGA	2	6	246950	246955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016931	CA	3	6	246984	246989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_016931	GAC	2	6	247009	247014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_016931	T	7	7	248922	248928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016931	TAT	2	6	248933	248938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016931	TTC	2	6	250485	250490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_016931	AT	3	6	250503	250508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016931	TGT	2	6	250523	250528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016931	TTA	2	6	250530	250535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016931	AGT	2	6	250585	250590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016931	TG	3	6	250610	250615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016931	TTG	2	6	250662	250667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016931	ATAC	2	8	250673	250680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_016931	AGC	2	6	250697	250702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_016931	ATA	2	6	250729	250734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016931	A	6	6	250789	250794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016931	CAC	2	6	250806	250811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_016931	TCC	2	6	250837	250842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_016931	TAAT	2	8	250848	250855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016931	A	6	6	250904	250909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016931	T	8	8	250914	250921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016931	T	6	6	250924	250929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016931	A	6	6	250932	250937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016931	CAC	2	6	250963	250968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_016931	TGA	2	6	250976	250981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016931	AG	3	6	250985	250990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016931	A	6	6	251001	251006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016931	TTA	2	6	251012	251017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016931	ATG	2	6	251046	251051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016931	TAA	2	6	251086	251091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016931	ATG	2	6	251103	251108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016931	AACA	2	8	251124	251131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_016931	A	6	6	251139	251144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016931	AT	3	6	251358	251363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016931	TAT	3	9	251361	251369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016931	AGA	2	6	251408	251413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016931	AGA	2	6	251421	251426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016931	A	6	6	251445	251450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016931	AAT	2	6	251460	251465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016931	AG	3	6	251553	251558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016931	TAA	2	6	251564	251569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016931	A	6	6	251568	251573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016931	TAA	2	6	252002	252007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016931	TTA	2	6	252047	252052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016931	TTA	2	6	252066	252071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016931	TAA	2	6	252082	252087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016931	ATT	2	6	252094	252099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016931	TTA	2	6	252132	252137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016931	A	6	6	252142	252147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016931	GAG	2	6	253678	253683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016931	AAG	2	6	254360	254365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016931	ATA	2	6	254366	254371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016931	A	7	7	254371	254377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016931	TAA	2	6	254381	254386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016931	TAT	2	6	254387	254392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016931	TGA	2	6	254402	254407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016931	T	7	7	254418	254424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016931	T	7	7	254427	254433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016931	T	6	6	254435	254440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016931	T	6	6	254450	254455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016931	TAA	2	6	254461	254466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016931	ACA	3	9	254505	254513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_016931	TAA	2	6	254547	254552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016931	CAA	2	6	254600	254605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_016931	ATT	2	6	254618	254623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016931	TA	3	6	254632	254637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016931	AAT	2	6	254645	254650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016931	TAA	3	9	254680	254688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016931	TA	3	6	254722	254727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_016931	AAT	3	9	254756	254764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016931	TATT	2	8	254768	254775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016931	ATTA	2	8	255760	255767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016931	AT	3	6	255775	255780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016931	TA	4	8	255794	255801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016931	ATT	2	6	255814	255819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016931	T	6	6	255818	255823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016931	ATT	2	6	255832	255837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016931	A	6	6	256230	256235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016931	TTA	2	6	256236	256241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016931	TATTT	2	10	256278	256287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016931	TGT	2	6	256296	256301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016931	CT	3	6	256380	256385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_016931	GACAA	2	10	256426	256435	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1608	NC_016931	TAA	2	6	256457	256462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016931	CAA	2	6	256646	256651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_016931	TAATTA	2	12	257293	257304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016931	TAT	2	6	257333	257338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016931	A	6	6	258254	258259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016931	CTACA	2	10	258277	258286	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1614	NC_016931	AAAT	2	8	258310	258317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016931	GAT	2	6	258356	258361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016931	AG	3	6	258362	258367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016931	AAT	2	6	258369	258374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016931	TTAT	2	8	258671	258678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016931	TAT	2	6	258714	258719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016931	ATA	2	6	258770	258775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016931	AAAT	2	8	258812	258819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016931	TAA	2	6	258828	258833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016931	ATAG	2	8	258865	258872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016931	AAT	2	6	259044	259049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016931	AGC	2	6	259413	259418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_016931	AG	3	6	259441	259446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016931	AAGGA	2	10	259463	259472	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016931	AGA	2	6	259494	259499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016931	AAG	2	6	259574	259579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016931	TA	4	8	259624	259631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016931	CAA	2	6	259639	259644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_016931	GAAT	2	8	259660	259667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016931	AAT	2	6	259701	259706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016931	GCA	3	9	259780	259788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_016931	TGG	2	6	259818	259823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_016931	AGT	2	6	259824	259829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_016931	AGA	2	6	259905	259910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1783	NC_016931	GTA	2	6	281769	281774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1820	NC_016931	GTT	2	6	282969	282974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1836	NC_016931	AGC	2	6	286530	286535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1907	NC_016931	TAAAG	2	10	301744	301753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1912	NC_016931	ATTA	2	8	301843	301850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_016931	ATA	2	6	304534	304539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_016931	TA	4	8	304572	304579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_016931	ATT	2	6	304599	304604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1944	NC_016931	TA	5	10	305702	305711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_016931	A	6	6	305724	305729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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