MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016931	AGT	2	6	1155770	1155775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_016931	ACT	2	6	1155828	1155833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_016931	TATT	2	8	1155856	1155863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_016931	TGA	2	6	1155871	1155876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_016931	TAT	2	6	1155877	1155882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_016931	ACC	2	6	1155956	1155961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_016931	CCT	2	6	1156018	1156023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_016931	GTG	2	6	1156027	1156032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_016931	CTACC	2	10	1156048	1156057	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8010	NC_016931	GAA	2	6	1156102	1156107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_016931	TAC	2	6	1156127	1156132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_016931	AGA	2	6	1156196	1156201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_016931	TAA	2	6	1156208	1156213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_016931	TAT	2	6	1156253	1156258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_016931	TAT	2	6	1156316	1156321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_016931	CAT	2	6	1156332	1156337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_016931	TTC	2	6	1156396	1156401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_016931	CAT	3	9	1156451	1156459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_016931	CCG	2	6	1156474	1156479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8020	NC_016931	TGC	3	9	1156529	1156537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_016931	T	6	6	1156542	1156547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_016931	TTTTG	2	10	1156566	1156575	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_016931	TGT	2	6	1156587	1156592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_016931	CCG	2	6	1156612	1156617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_016931	TAC	2	6	1156733	1156738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_016931	ATC	2	6	1156774	1156779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_016931	ATT	2	6	1156789	1156794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_016931	ATT	2	6	1156827	1156832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_016931	TGAAC	2	10	1156898	1156907	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8030	NC_016931	GTA	2	6	1157160	1157165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_016931	TTA	2	6	1157873	1157878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_016931	TTA	2	6	1157945	1157950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_016931	AAC	2	6	1158019	1158024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_016931	GCTA	2	8	1158067	1158074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8035	NC_016931	CAA	2	6	1158321	1158326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_016931	TTA	2	6	1158422	1158427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_016931	TAC	2	6	1158445	1158450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_016931	TAG	2	6	1158523	1158528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_016931	TAT	2	6	1158550	1158555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_016931	TGC	2	6	1158611	1158616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_016931	AAG	2	6	1158852	1158857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_016931	T	6	6	1158870	1158875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_016931	TTA	2	6	1158890	1158895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_016931	ATT	2	6	1158925	1158930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_016931	CCT	2	6	1158945	1158950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_016931	TGC	2	6	1158976	1158981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_016931	ACT	2	6	1158982	1158987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8049	NC_016931	ATT	2	6	1159237	1159242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_016931	AGT	2	6	1159252	1159257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8052	NC_016931	GCA	2	6	1159407	1159412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_016931	ATT	2	6	1159430	1159435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_016931	AT	3	6	1159448	1159453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_016931	AT	3	6	1159513	1159518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_016931	TAT	2	6	1159537	1159542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_016931	ACC	2	6	1159550	1159555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_016931	CCA	2	6	1159563	1159568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_016931	ATT	2	6	1160098	1160103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_016931	TTAAA	2	10	1160144	1160153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_016931	TGTAA	2	10	1160168	1160177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_016931	T	6	6	1160745	1160750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_016931	T	6	6	1160757	1160762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_016931	TTGAC	2	10	1160767	1160776	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8065	NC_016931	ATA	2	6	1160777	1160782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_016931	ATTA	2	8	1160829	1160836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_016931	TA	3	6	1160881	1160886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_016931	AAAT	2	8	1160916	1160923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_016931	TA	3	6	1160962	1160967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_016931	CTAT	2	8	1160994	1161001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8077	NC_016931	TAAT	2	8	1161221	1161228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_016931	TC	3	6	1161292	1161297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_016931	ATT	2	6	1162228	1162233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_016931	AATAT	2	10	1162234	1162243	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8082	NC_016931	TAA	2	6	1162799	1162804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_016931	ATA	2	6	1162815	1162820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8085	NC_016931	AAG	2	6	1162845	1162850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_016931	ATT	2	6	1163809	1163814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8090	NC_016931	A	6	6	1163901	1163906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_016931	ATTT	2	8	1163911	1163918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_016931	GAAT	2	8	1163924	1163931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_016931	ATA	2	6	1163940	1163945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_016931	TAA	2	6	1164074	1164079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_016931	TAC	2	6	1164165	1164170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8099	NC_016931	A	6	6	1164390	1164395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_016931	CAA	2	6	1164399	1164404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_016931	TTG	2	6	1164452	1164457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_016931	A	6	6	1164508	1164513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_016931	ATT	2	6	1164519	1164524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_016931	A	6	6	1164539	1164544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_016931	AT	3	6	1164549	1164554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_016931	TTAT	2	8	1165221	1165228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8111	NC_016931	CTA	2	6	1165431	1165436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_016931	TTA	2	6	1165439	1165444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_016931	ATT	2	6	1165447	1165452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_016931	T	6	6	1165451	1165456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_016931	AAT	2	6	1165464	1165469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_016931	CCA	2	6	1165471	1165476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8117	NC_016931	ACT	2	6	1165516	1165521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_016931	A	6	6	1165611	1165616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8120	NC_016931	CAT	2	6	1165644	1165649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_016931	AT	3	6	1165648	1165653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_016931	AT	3	6	1165668	1165673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_016931	TCT	2	6	1165676	1165681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8125	NC_016931	ATT	2	6	1165750	1165755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_016931	TAG	2	6	1165824	1165829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_016931	T	6	6	1165867	1165872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_016931	AGTA	2	8	1165877	1165884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_016931	ATT	2	6	1165885	1165890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_016931	A	6	6	1165894	1165899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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