MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016931	TAA	2	6	837355	837360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_016931	TAG	2	6	837377	837382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_016931	T	6	6	837467	837472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_016931	AGA	2	6	837505	837510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_016931	TA	3	6	837516	837521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016931	ATTTT	2	10	837565	837574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_016931	TAA	2	6	837625	837630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016931	AGA	2	6	837655	837660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_016931	TA	3	6	837662	837667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_016931	CGT	2	6	837772	837777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_016931	A	6	6	837783	837788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_016931	TAT	2	6	837815	837820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016931	A	6	6	837857	837862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_016931	ATTT	2	8	837898	837905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_016931	CTT	2	6	837941	837946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_016931	TCTA	2	8	837955	837962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_016931	TAA	2	6	838002	838007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_016931	TAA	2	6	838052	838057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016931	AATT	2	8	838094	838101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016931	GCT	2	6	838450	838455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_016931	AACC	2	8	838536	838543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_016931	ATA	2	6	838582	838587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_016931	ACC	2	6	838592	838597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_016931	TAT	2	6	838673	838678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_016931	CTA	2	6	838703	838708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_016931	GTA	2	6	838729	838734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_016931	TTA	2	6	838765	838770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_016931	TCA	2	6	838815	838820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6031	NC_016931	ATA	2	6	839323	839328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016931	TTGA	2	8	839373	839380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016931	TTACT	2	10	839395	839404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6034	NC_016931	TTAAT	2	10	839415	839424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016931	AT	3	6	839428	839433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6037	NC_016931	TA	3	6	841829	841834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6039	NC_016931	A	6	6	843003	843008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6041	NC_016931	CCT	2	6	843057	843062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_016931	ATA	2	6	844434	844439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016931	ATT	2	6	844443	844448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016931	TAT	2	6	844504	844509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016931	ACT	2	6	844520	844525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6048	NC_016931	TTA	2	6	844561	844566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_016931	AGA	2	6	844601	844606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016931	TA	3	6	844609	844614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016931	TTC	2	6	844675	844680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_016931	T	6	6	844716	844721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016931	T	7	7	844748	844754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016931	CTA	2	6	844782	844787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6057	NC_016931	ATTAT	2	10	845022	845031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_016931	CTT	2	6	845076	845081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_016931	ATTT	2	8	845086	845093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016931	A	6	6	845107	845112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_016931	TGC	2	6	845128	845133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_016931	TGC	2	6	845143	845148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_016931	AGT	2	6	845194	845199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016931	TGT	2	6	845230	845235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016931	TC	3	6	845283	845288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_016931	T	6	6	845347	845352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_016931	TCG	2	6	845393	845398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6071	NC_016931	TCA	2	6	845522	845527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_016931	TA	4	8	845535	845542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016931	CAT	2	6	845564	845569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6078	NC_016931	TAC	2	6	845708	845713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6085	NC_016931	TTA	3	9	845835	845843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_016931	ATTAA	2	10	845844	845853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6097	NC_016931	AT	3	6	849441	849446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_016931	TAT	2	6	849483	849488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_016931	AAT	3	9	849589	849597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6103	NC_016931	AT	3	6	849796	849801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_016931	TTC	2	6	849805	849810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_016931	TAC	2	6	849880	849885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_016931	ATT	2	6	849895	849900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_016931	GGCA	2	8	850093	850100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_016931	TAC	2	6	850198	850203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6112	NC_016931	CAAT	2	8	850349	850356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_016931	T	7	7	850381	850387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_016931	AT	3	6	850422	850427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016931	CTC	2	6	850435	850440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_016931	TCT	2	6	850468	850473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_016931	GAA	2	6	850514	850519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_016931	TAT	2	6	850533	850538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_016931	TAA	2	6	850608	850613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016931	TA	3	6	850651	850656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016931	TAAG	2	8	850677	850684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_016931	AT	3	6	850688	850693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016931	GA	3	6	850707	850712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016931	CTAA	2	8	851095	851102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_016931	TTTTG	2	10	851134	851143	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_016931	GTG	2	6	851144	851149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_016931	TTA	2	6	851151	851156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_016931	TAT	2	6	851159	851164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_016931	AATTA	2	10	851190	851199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_016931	TAA	2	6	851214	851219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_016931	CAA	2	6	851235	851240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_016931	T	6	6	851241	851246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_016931	TTA	2	6	851255	851260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_016931	A	6	6	851283	851288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_016931	ATT	3	9	852229	852237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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