MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 8039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016929	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016929	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016929	TGT	2	6	878	883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016929	A	6	6	897	902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016929	TGC	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016929	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016929	TAAATT	2	12	955	966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016929	AAT	2	6	1016	1021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016929	ATTT	2	8	1384	1391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016929	TGT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016929	TCC	3	9	2227	2235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016929	TTA	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016929	AGT	2	6	6214	6219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016929	AAC	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016929	AT	3	6	6321	6326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016929	TGG	3	9	8614	8622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016929	ATA	2	6	8693	8698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016929	AGAA	2	8	8743	8750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016929	AT	3	6	8769	8774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016929	ATTT	2	8	8841	8848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016929	TTTTAT	2	12	9859	9870	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016929	AT	4	8	9872	9879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016929	TAAG	2	8	9891	9898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016929	AAT	2	6	9904	9909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016929	GTT	2	6	9968	9973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016929	TAG	2	6	10014	10019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016929	TCT	2	6	10096	10101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016929	A	6	6	10102	10107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016929	TAAA	2	8	10109	10116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016929	TAAA	2	8	10136	10143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016929	TA	4	8	10159	10166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016929	TA	3	6	10236	10241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016929	GAA	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016929	T	6	6	10308	10313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016929	AGAA	2	8	10319	10326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016929	T	6	6	10335	10340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016929	AGATA	2	10	10341	10350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016929	AT	3	6	10359	10364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016929	T	7	7	10372	10378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016929	GTT	2	6	11674	11679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016929	AAAGT	2	10	11745	11754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016929	AT	3	6	12984	12989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016929	ATT	2	6	13025	13030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016929	TAAT	2	8	13045	13052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016929	A	7	7	13243	13249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016929	A	7	7	13257	13263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016929	TA	3	6	13299	13304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016929	GCA	2	6	13326	13331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016929	ATT	2	6	13333	13338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016929	TA	3	6	13368	13373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016929	AAGC	2	8	13409	13416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016929	A	6	6	13426	13431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016929	AGTA	2	8	13453	13460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016929	GAA	2	6	13469	13474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016929	TAC	2	6	13484	13489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016929	ATG	2	6	13500	13505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016929	AATA	2	8	13522	13529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016929	TAAG	2	8	13597	13604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016929	AT	3	6	13663	13668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016929	TAT	2	6	13682	13687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016929	ATGA	2	8	13705	13712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016929	TAA	2	6	13736	13741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016929	TAA	2	6	13754	13759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016929	TGC	2	6	13770	13775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016929	CTAC	2	8	13807	13814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016929	AAT	2	6	13820	13825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016929	TAA	2	6	13878	13883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016929	GTA	2	6	13891	13896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016929	ACT	2	6	13912	13917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016929	GTCA	2	8	13963	13970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016929	TG	3	6	14010	14015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016929	TAC	2	6	14051	14056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016929	T	6	6	14122	14127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016929	ATT	2	6	14137	14142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016929	TAC	2	6	14146	14151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016929	GTC	2	6	14154	14159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016929	ATT	2	6	14206	14211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016929	ATT	2	6	14438	14443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016929	CTT	2	6	14452	14457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016929	T	6	6	14461	14466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016929	TA	3	6	14506	14511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016929	ATA	2	6	14522	14527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016929	CAA	2	6	14532	14537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016929	TAAT	2	8	14557	14564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016929	AT	3	6	14577	14582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016929	TTAT	2	8	14602	14609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016929	TAAT	2	8	14639	14646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016929	TA	3	6	19126	19131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016929	ACC	2	6	19237	19242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016929	ATT	2	6	19311	19316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016929	TAA	2	6	19321	19326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016929	TTA	2	6	19327	19332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016929	AAT	2	6	19337	19342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016929	A	7	7	19375	19381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016929	ATA	2	6	19395	19400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016929	TAA	2	6	19409	19414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016929	A	6	6	19428	19433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016929	TAA	2	6	19478	19483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016929	T	7	7	19518	19524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016929	ATCT	2	8	19558	19565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016929	ATT	2	6	19633	19638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016929	AAC	2	6	19751	19756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016929	TTAT	2	8	19757	19764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016929	ATT	2	6	19817	19822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016929	ATAA	3	12	19857	19868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016929	CTA	2	6	19897	19902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016929	ACTT	2	8	19916	19923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016929	GTG	2	6	20175	20180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016929	A	7	7	20238	20244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016929	ATA	2	6	20248	20253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016929	AAG	2	6	20304	20309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016929	CTA	2	6	20319	20324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016929	ATA	2	6	20327	20332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016929	AGT	2	6	20342	20347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016929	TA	3	6	20430	20435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016929	CCT	2	6	20456	20461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_016929	TTA	2	6	20478	20483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016929	TAA	2	6	20530	20535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016929	AGA	2	6	20591	20596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016929	GAA	2	6	20600	20605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016929	TTA	2	6	20617	20622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016929	GAA	2	6	20701	20706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016929	ATA	2	6	20710	20715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016929	ATT	2	6	20778	20783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016929	ATC	2	6	20803	20808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016929	TA	3	6	20809	20814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016929	TAA	2	6	20829	20834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016929	AT	3	6	20838	20843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016929	AAT	2	6	20863	20868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016929	TAC	2	6	20869	20874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016929	ATA	2	6	20880	20885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016929	TGA	2	6	20893	20898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016929	AAT	2	6	20941	20946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016929	AT	3	6	20945	20950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016929	GA	3	6	20952	20957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016929	TAA	2	6	20980	20985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016929	ATT	2	6	21043	21048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016929	T	6	6	21094	21099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016929	T	8	8	21108	21115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016929	ATT	2	6	21122	21127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016929	AAT	2	6	21146	21151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016929	GAA	2	6	21217	21222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016929	A	6	6	21238	21243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016929	ATA	2	6	21306	21311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016929	AAG	2	6	21315	21320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016929	TAA	2	6	21350	21355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016929	TTA	2	6	21362	21367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016929	ATT	2	6	21394	21399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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