MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016915	ACG	2	6	551210	551215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_016915	T	7	7	553741	553747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_016915	TA	3	6	553752	553757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_016915	CATTGT	2	12	553761	553772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3506	NC_016915	TCA	2	6	553799	553804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_016915	ATA	2	6	554403	554408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_016915	ATT	2	6	554434	554439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_016915	A	7	7	554475	554481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016915	T	9	9	559378	559386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016915	T	6	6	559395	559400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_016915	TTG	2	6	559433	559438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016915	TGA	2	6	559483	559488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016915	T	7	7	559521	559527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016915	ATT	2	6	559529	559534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3520	NC_016915	TAT	2	6	561692	561697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_016915	TGA	2	6	561729	561734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016915	TA	3	6	561735	561740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_016915	TAT	2	6	561958	561963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_016915	ATA	2	6	562071	562076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_016915	TA	3	6	563739	563744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_016915	ATT	2	6	563772	563777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3529	NC_016915	TAAT	2	8	563845	563852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_016915	ATTT	2	8	563867	563874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_016915	AT	3	6	563925	563930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016915	TCA	2	6	563947	563952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3534	NC_016915	ATA	2	6	563984	563989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3537	NC_016915	ATA	2	6	564044	564049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3545	NC_016915	TAA	2	6	564282	564287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3550	NC_016915	TAAAT	2	10	564509	564518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3562	NC_016915	AAT	2	6	564991	564996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016915	TTGATA	2	12	565004	565015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3565	NC_016915	CAT	2	6	565062	565067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3596	NC_016915	TA	3	6	567361	567366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3602	NC_016915	AG	3	6	569238	569243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016915	AGT	2	6	569262	569267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_016915	CA	3	6	569280	569285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_016915	TTAC	2	8	569292	569299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3612	NC_016915	ATA	2	6	570207	570212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016915	AT	3	6	570232	570237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_016915	TA	3	6	570255	570260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_016915	TAT	2	6	570962	570967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3619	NC_016915	AGA	2	6	571022	571027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_016915	GCA	2	6	571036	571041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_016915	ATA	2	6	571144	571149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_016915	TTAA	2	8	571189	571196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016915	ATT	2	6	571197	571202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_016915	TTG	2	6	571226	571231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3627	NC_016915	AATT	2	8	575245	575252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_016915	A	6	6	575255	575260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_016915	GAG	2	6	575332	575337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_016915	ACG	2	6	575380	575385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3632	NC_016915	CTA	2	6	575769	575774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_016915	CT	3	6	575818	575823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_016915	A	6	6	576473	576478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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