MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_016915	TTA	2	6	1055753	1055758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_016915	TAT	2	6	1055775	1055780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_016915	AAT	2	6	1055786	1055791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_016915	ATT	2	6	1056191	1056196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_016915	A	6	6	1056201	1056206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_016915	T	6	6	1056361	1056366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_016915	TA	3	6	1056473	1056478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_016915	ATT	2	6	1056542	1056547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_016915	AC	3	6	1056807	1056812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_016915	T	7	7	1057733	1057739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_016915	AATA	2	8	1058264	1058271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_016915	ATT	2	6	1058504	1058509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_016915	ACC	2	6	1058557	1058562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_016915	ATTA	2	8	1058679	1058686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_016915	TAA	2	6	1058757	1058762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_016915	TCT	2	6	1058791	1058796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_016915	GT	3	6	1058818	1058823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_016915	AT	4	8	1058839	1058846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_016915	ATT	2	6	1058865	1058870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_016915	ATA	2	6	1058888	1058893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_016915	CA	3	6	1058909	1058914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7023	NC_016915	T	7	7	1061090	1061096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_016915	TGT	2	6	1061102	1061107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_016915	ATC	2	6	1061119	1061124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7031	NC_016915	TAAA	2	8	1063237	1063244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7036	NC_016915	CTT	2	6	1064399	1064404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_016915	TTTC	2	8	1064422	1064429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7039	NC_016915	T	6	6	1064574	1064579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_016915	ATA	2	6	1064589	1064594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_016915	CAGCT	2	10	1064786	1064795	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7042	NC_016915	T	6	6	1064810	1064815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_016915	GTC	2	6	1064823	1064828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_016915	TTC	2	6	1064835	1064840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_016915	TA	3	6	1064853	1064858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7048	NC_016915	AT	3	6	1065220	1065225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_016915	GAC	2	6	1065248	1065253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7051	NC_016915	TTA	2	6	1065288	1065293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7054	NC_016915	TTTA	2	8	1065423	1065430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_016915	TCT	2	6	1065700	1065705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7057	NC_016915	ATT	2	6	1065759	1065764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_016915	TCT	2	6	1065781	1065786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7062	NC_016915	TGACC	2	10	1067849	1067858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7063	NC_016915	TGT	2	6	1067862	1067867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_016915	CAA	2	6	1067934	1067939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_016915	T	8	8	1068149	1068156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_016915	TA	3	6	1068179	1068184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_016915	AAT	2	6	1068212	1068217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7069	NC_016915	TAATA	2	10	1068858	1068867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7076	NC_016915	TA	3	6	1069763	1069768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_016915	ATA	2	6	1069771	1069776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7083	NC_016915	A	7	7	1071087	1071093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_016915	AT	3	6	1071119	1071124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7089	NC_016915	TAA	2	6	1071208	1071213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7101	NC_016915	ACCA	2	8	1072985	1072992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7102	NC_016915	AAC	2	6	1072999	1073004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_016915	ATA	2	6	1073637	1073642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_016915	ATTT	2	8	1073696	1073703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_016915	GTAG	2	8	1074976	1074983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_016915	ACG	2	6	1074984	1074989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7111	NC_016915	TGT	2	6	1081090	1081095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_016915	TAT	2	6	1081096	1081101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_016915	TA	3	6	1081104	1081109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_016915	TAT	2	6	1082514	1082519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_016915	ATC	2	6	1082532	1082537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7117	NC_016915	CCT	2	6	1082598	1082603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_016915	AAG	2	6	1082680	1082685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7120	NC_016915	A	6	6	1082738	1082743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_016915	ATC	2	6	1082764	1082769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7123	NC_016915	ATTT	2	8	1082794	1082801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_016915	ATTA	2	8	1082850	1082857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_016915	GTT	2	6	1084176	1084181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_016915	TA	4	8	1084218	1084225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_016915	ATG	2	6	1084228	1084233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7129	NC_016915	TTA	2	6	1084382	1084387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_016915	ACC	2	6	1084420	1084425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7131	NC_016915	GGT	2	6	1084444	1084449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7133	NC_016915	TCA	2	6	1084525	1084530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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