MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 7994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016914	AGG	2	6	265987	265992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016914	AGT	2	6	265997	266002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016914	AAGC	2	8	266026	266033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_016914	GCT	2	6	266058	266063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_016914	GAA	2	6	266100	266105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016914	AT	4	8	266118	266125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016914	TGC	2	6	266192	266197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_016914	TGA	2	6	266201	266206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016914	TGC	2	6	266294	266299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_016914	GGT	2	6	266301	266306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016914	TA	3	6	266437	266442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016914	ATA	2	6	266558	266563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016914	TTA	2	6	266581	266586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016914	ATC	2	6	266594	266599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_016914	ATA	2	6	266839	266844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016914	A	6	6	266847	266852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016914	A	6	6	267076	267081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016914	A	6	6	267109	267114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016914	T	9	9	267130	267138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016914	T	6	6	267140	267145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016914	GCT	2	6	267168	267173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_016914	ATA	2	6	267225	267230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016914	T	6	6	269708	269713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016914	TA	4	8	270093	270100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016914	TA	4	8	270107	270114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016914	T	6	6	272407	272412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016914	AT	3	6	272434	272439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016914	A	7	7	272448	272454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016914	ATC	2	6	273068	273073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_016914	AGC	2	6	273080	273085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_016914	ATA	2	6	273112	273117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016914	ATGACG	2	12	273160	273171	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1533	NC_016914	ATA	2	6	275217	275222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016914	A	7	7	275237	275243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016914	AGG	2	6	275615	275620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016914	TTA	2	6	275624	275629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1538	NC_016914	ATG	2	6	275706	275711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016914	AAAAC	2	10	275742	275751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1540	NC_016914	ATTC	2	8	275760	275767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_016914	TC	3	6	275766	275771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_016914	CT	3	6	275827	275832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_016914	TAA	2	6	275857	275862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016914	AT	3	6	275888	275893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016914	TAAA	2	8	275905	275912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016914	ATT	2	6	275940	275945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016914	T	6	6	275998	276003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1550	NC_016914	AAT	2	6	276344	276349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016914	GAA	2	6	276401	276406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016914	CTA	2	6	276456	276461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016914	ACT	2	6	276464	276469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_016914	A	6	6	277098	277103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016914	TTA	2	6	277121	277126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016914	GA	3	6	277162	277167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016914	ATTGCA	2	12	277201	277212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1558	NC_016914	A	6	6	277224	277229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016914	AT	3	6	277237	277242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016914	TGA	2	6	277248	277253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016914	CAA	2	6	277256	277261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_016914	TAC	2	6	277326	277331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_016914	TAT	2	6	277359	277364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016914	TGC	2	6	277646	277651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_016914	A	7	7	277685	277691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016914	A	6	6	277734	277739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016914	TAT	2	6	277809	277814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016914	TAG	2	6	277858	277863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016914	TAT	2	6	277905	277910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016914	ACC	2	6	277943	277948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_016914	GGT	2	6	277965	277970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016914	AGC	2	6	278148	278153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_016914	AAT	2	6	278178	278183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016914	AT	3	6	278188	278193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016914	GTC	2	6	278245	278250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_016914	A	6	6	278371	278376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016914	CAA	2	6	278417	278422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1582	NC_016914	TAT	2	6	278498	278503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016914	TAT	2	6	278509	278514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016914	TCA	2	6	281352	281357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1587	NC_016914	CAA	2	6	281449	281454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016914	AGC	2	6	281464	281469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_016914	ATA	2	6	281496	281501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016914	TTA	2	6	281555	281560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016914	C	8	8	281586	281593	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1592	NC_016914	A	9	9	281594	281602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_016914	ATT	2	6	281775	281780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016914	ATT	2	6	282003	282008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016914	TGTT	2	8	282027	282034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016914	TA	3	6	282060	282065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016914	AT	3	6	282067	282072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016914	TTG	2	6	282608	282613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016914	TAA	2	6	282967	282972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016914	ATT	2	6	283035	283040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016914	ATT	3	9	283162	283170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1608	NC_016914	GAA	2	6	283177	283182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016914	T	6	6	283191	283196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016914	TA	3	6	283214	283219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016914	TG	3	6	283252	283257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016914	AT	3	6	283265	283270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016914	TAA	2	6	283274	283279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016914	CCT	2	6	283719	283724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1616	NC_016914	TAT	2	6	283771	283776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_016914	ATT	2	6	283789	283794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016914	ATT	2	6	283805	283810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016914	TAT	2	6	283826	283831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016914	CTTT	2	8	283861	283868	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_016914	ATTAAA	2	12	283892	283903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016914	TAT	3	9	285358	285366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016914	A	6	6	285377	285382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016914	TAAT	2	8	285471	285478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016914	TAG	2	6	285515	285520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016914	ATG	2	6	285521	285526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016914	TTA	2	6	285620	285625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016914	TGA	2	6	285774	285779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016914	ATT	2	6	285807	285812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016914	CAG	2	6	285860	285865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_016914	TTTG	2	8	285894	285901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016914	TAAAAT	2	12	286012	286023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016914	ATC	2	6	286069	286074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_016914	ATA	2	6	286147	286152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1791	NC_016914	CTG	2	6	308369	308374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1803	NC_016914	AT	3	6	310025	310030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1832	NC_016914	A	6	6	319786	319791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1875	NC_016914	TAA	2	6	325464	325469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1907	NC_016914	TAA	2	6	332967	332972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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