MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 7829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016913	AAG	2	6	1120508	1120513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_016913	CACAT	2	10	1120520	1120529	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7003	NC_016913	GAT	2	6	1120532	1120537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_016913	ACT	2	6	1120547	1120552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_016913	ATA	2	6	1120610	1120615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_016913	TGT	3	9	1121027	1121035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_016913	GAA	3	9	1121049	1121057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_016913	ATG	3	9	1121134	1121142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_016913	TAC	2	6	1121143	1121148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_016913	CAA	2	6	1121149	1121154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_016913	GAA	2	6	1122527	1122532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_016913	TGC	2	6	1122589	1122594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_016913	T	6	6	1122605	1122610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_016913	GCA	2	6	1122645	1122650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_016913	TTA	2	6	1122665	1122670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_016913	GCT	2	6	1122698	1122703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_016913	ATT	2	6	1123089	1123094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_016913	TGC	2	6	1123111	1123116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_016913	AGTATA	2	12	1123117	1123128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_016913	CCTCT	2	10	1123550	1123559	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7021	NC_016913	TAG	3	9	1123568	1123576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_016913	TTA	2	6	1123597	1123602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_016913	AGCTTT	2	12	1123771	1123782	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7024	NC_016913	ATT	3	9	1123791	1123799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_016913	CTA	2	6	1123820	1123825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_016913	GTTA	2	8	1123866	1123873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_016913	ATTAAT	2	12	1123950	1123961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_016913	ATA	3	9	1123999	1124007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_016913	TCAT	2	8	1124053	1124060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7030	NC_016913	AGA	2	6	1124073	1124078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_016913	AAT	2	6	1124094	1124099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_016913	CCG	2	6	1124102	1124107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7033	NC_016913	AGC	2	6	1124128	1124133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_016913	TAC	2	6	1124138	1124143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_016913	A	7	7	1124166	1124172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_016913	TTA	2	6	1124181	1124186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_016913	ACTTA	2	10	1124230	1124239	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7038	NC_016913	TATT	2	8	1124255	1124262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_016913	ACG	2	6	1124264	1124269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_016913	AAT	2	6	1124273	1124278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_016913	TAA	2	6	1124279	1124284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_016913	ATTA	2	8	1124310	1124317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_016913	GTTT	2	8	1124386	1124393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_016913	GGTA	2	8	1124394	1124401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_016913	AAT	2	6	1124502	1124507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_016913	AAT	2	6	1125231	1125236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_016913	TA	3	6	1125250	1125255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_016913	TA	3	6	1125257	1125262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_016913	ATT	2	6	1126465	1126470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_016913	ATTT	2	8	1126474	1126481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_016913	ATA	2	6	1126482	1126487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_016913	AT	3	6	1126503	1126508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_016913	ATC	2	6	1126518	1126523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_016913	ATTA	2	8	1126575	1126582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_016913	TTA	2	6	1126585	1126590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_016913	T	6	6	1126603	1126608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_016913	ATT	2	6	1126617	1126622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_016913	A	6	6	1126627	1126632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_016913	ATTA	2	8	1126647	1126654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_016913	A	6	6	1126699	1126704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_016913	TAG	2	6	1126721	1126726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_016913	ACA	3	9	1126752	1126760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_016913	CAACT	2	10	1126764	1126773	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7064	NC_016913	ATA	2	6	1126815	1126820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_016913	ATG	2	6	1126856	1126861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_016913	A	6	6	1126865	1126870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_016913	GAA	2	6	1126871	1126876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_016913	TTAA	2	8	1126939	1126946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_016913	TAT	2	6	1126971	1126976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_016913	TAA	2	6	1126986	1126991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_016913	AGAA	2	8	1127015	1127022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_016913	A	7	7	1127103	1127109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_016913	TA	3	6	1127145	1127150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_016913	A	6	6	1127150	1127155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_016913	CTA	2	6	1127215	1127220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_016913	A	6	6	1127239	1127244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_016913	CTA	2	6	1127260	1127265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_016913	TAG	2	6	1127281	1127286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_016913	CAAG	2	8	1127299	1127306	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7080	NC_016913	AAT	2	6	1127308	1127313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_016913	ATT	2	6	1127332	1127337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_016913	TAA	2	6	1127388	1127393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_016913	AGCA	3	12	1127423	1127434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7084	NC_016913	GAT	2	6	1127465	1127470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_016913	ATA	2	6	1127493	1127498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_016913	AT	3	6	1127527	1127532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_016913	TAAT	2	8	1127550	1127557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_016913	AAG	2	6	1127559	1127564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_016913	AT	3	6	1127595	1127600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_016913	TAAT	2	8	1127607	1127614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_016913	TTA	2	6	1127914	1127919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_016913	AAAGAT	2	12	1127944	1127955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_016913	CAAT	2	8	1128034	1128041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7094	NC_016913	AT	5	10	1128043	1128052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_016913	A	6	6	1128058	1128063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_016913	ATA	2	6	1128111	1128116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_016913	ATT	2	6	1128121	1128126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_016913	ATA	2	6	1128177	1128182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_016913	TCAG	2	8	1128212	1128219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7100	NC_016913	CAAG	2	8	1128220	1128227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7101	NC_016913	AT	3	6	1128302	1128307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_016913	TTA	2	6	1128362	1128367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_016913	TA	3	6	1128426	1128431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_016913	CAA	2	6	1128458	1128463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_016913	CAA	2	6	1128489	1128494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_016913	GCT	2	6	1128530	1128535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_016913	TAC	2	6	1128625	1128630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_016913	AT	3	6	1128633	1128638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_016913	AAG	2	6	1128648	1128653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_016913	ATT	2	6	1128664	1128669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_016913	A	6	6	1128691	1128696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_016913	AAG	2	6	1128710	1128715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_016913	AAT	2	6	1128732	1128737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_016913	AT	3	6	1128785	1128790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_016913	A	6	6	1128794	1128799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_016913	AGA	2	6	1128849	1128854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_016913	AAT	2	6	1128912	1128917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_016913	TTC	2	6	1128918	1128923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_016913	A	6	6	1128950	1128955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_016913	AGA	2	6	1128990	1128995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_016913	TTTA	2	8	1129062	1129069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_016913	ATT	2	6	1129076	1129081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_016913	TTC	2	6	1129092	1129097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_016913	ATA	2	6	1129115	1129120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_016913	ACTAA	2	10	1129961	1129970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7126	NC_016913	ATT	2	6	1130008	1130013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_016913	TAA	2	6	1130038	1130043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_016913	TC	3	6	1130116	1130121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7129	NC_016913	CTC	2	6	1130124	1130129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7130	NC_016913	ATA	2	6	1130148	1130153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7132	NC_016913	AT	3	6	1130249	1130254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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