MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 7992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016911	ATTTA	2	10	534877	534886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016911	T	6	6	535756	535761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016911	TA	3	6	536174	536179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_016911	TAA	2	6	536206	536211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_016911	TTA	2	6	536235	536240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_016911	ATT	2	6	536258	536263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016911	GATA	2	8	536278	536285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_016911	T	7	7	536297	536303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_016911	ATTTT	2	10	536312	536321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016911	CAAT	2	8	537367	537374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_016911	TAA	2	6	537379	537384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016911	AAT	2	6	537400	537405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016911	TAA	2	6	537411	537416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016911	AAT	2	6	537418	537423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016911	GTG	2	6	537459	537464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_016911	T	6	6	538228	538233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016911	AATA	2	8	538267	538274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016911	ATT	2	6	538295	538300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016911	GAG	2	6	539005	539010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016911	ACA	2	6	539053	539058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_016911	ATTAA	2	10	539087	539096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016911	A	6	6	540562	540567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016911	T	6	6	540572	540577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016911	AAC	2	6	540630	540635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_016911	TAG	2	6	540641	540646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_016911	CAA	2	6	540673	540678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3028	NC_016911	CTT	2	6	543699	543704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_016911	ATGTC	2	10	543724	543733	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3030	NC_016911	A	6	6	543801	543806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016911	TAG	2	6	543849	543854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016911	GCGA	2	8	544874	544881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_016911	TTG	2	6	544891	544896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016911	GTTT	2	8	544901	544908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016911	A	7	7	544966	544972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016911	ATA	2	6	547597	547602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016911	ATA	2	6	547638	547643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016911	AATA	2	8	547650	547657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_016911	ATT	2	6	547665	547670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016911	TTA	2	6	547677	547682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016911	AATTTA	2	12	547702	547713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016911	ATAA	2	8	547714	547721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016911	T	6	6	547727	547732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016911	ATT	2	6	547735	547740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016911	TAT	2	6	547744	547749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_016911	TAA	2	6	547777	547782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_016911	ATA	2	6	547809	547814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_016911	AAC	2	6	547824	547829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_016911	AAG	2	6	547830	547835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016911	TAT	2	6	548854	548859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_016911	TAT	2	6	548865	548870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_016911	TTC	2	6	548890	548895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_016911	T	8	8	548968	548975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016911	CGT	2	6	548998	549003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016911	CTC	2	6	549015	549020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_016911	ATG	3	9	549024	549032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_016911	GCA	2	6	549046	549051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_016911	A	6	6	551054	551059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016911	TAGTTT	2	12	551070	551081	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016911	CTG	2	6	551120	551125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_016911	ATC	2	6	551127	551132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_016911	ACT	2	6	551133	551138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_016911	TAA	2	6	551139	551144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016911	TAT	2	6	551208	551213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_016911	TTA	2	6	552235	552240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_016911	TAA	2	6	552281	552286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016911	ATTT	2	8	552373	552380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_016911	CAG	2	6	552415	552420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_016911	TTTAG	2	10	552462	552471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_016911	CAA	2	6	552490	552495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_016911	TTG	2	6	552521	552526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_016911	T	6	6	552551	552556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_016911	TAA	2	6	552562	552567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_016911	GTAAT	2	10	552644	552653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_016911	CAA	2	6	552660	552665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_016911	CTA	2	6	552670	552675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_016911	TTTA	2	8	552703	552710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_016911	ATA	2	6	552724	552729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016911	TAT	2	6	552752	552757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_016911	TAA	2	6	552792	552797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016911	ATA	2	6	552828	552833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016911	TA	3	6	552840	552845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_016911	TAA	2	6	552849	552854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016911	A	6	6	552874	552879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_016911	AAGA	2	8	552886	552893	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_016911	TTTG	2	8	552927	552934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_016911	TA	3	6	552935	552940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_016911	ATT	2	6	552947	552952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_016911	AAT	2	6	552976	552981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016911	TGT	2	6	554397	554402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016911	TAG	2	6	554438	554443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016911	A	6	6	554451	554456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016911	T	6	6	554461	554466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016911	ATTT	2	8	554471	554478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016911	AT	3	6	554485	554490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016911	TATTAA	2	12	554498	554509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_016911	GTT	2	6	554511	554516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016911	T	6	6	554515	554520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_016911	AG	3	6	555170	555175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_016911	CGTAG	2	10	555212	555221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3101	NC_016911	ATTTTA	3	18	555296	555313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_016911	CGT	2	6	555608	555613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_016911	CGCTC	2	10	555649	555658	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3104	NC_016911	T	6	6	555733	555738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_016911	AATT	2	8	555741	555748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016911	ATA	2	6	557262	557267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_016911	T	6	6	557274	557279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016911	ACA	2	6	559761	559766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_016911	AAT	2	6	559791	559796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016911	TTAA	2	8	559797	559804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016911	TAT	2	6	559844	559849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_016911	TGC	2	6	559952	559957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_016911	TCT	2	6	559966	559971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_016911	TCC	2	6	559978	559983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_016911	TTA	2	6	559984	559989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016911	TAA	2	6	560010	560015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016911	AAT	2	6	560025	560030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_016911	AT	3	6	560732	560737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016911	TGATA	2	10	560749	560758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016911	TAT	2	6	560781	560786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_016911	TTA	2	6	560787	560792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016911	TTA	2	6	560830	560835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016911	ATG	2	6	561254	561259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_016911	ATT	2	6	561490	561495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016911	TAAA	2	8	563673	563680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016911	GTA	2	6	563683	563688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016911	CAT	2	6	563704	563709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_016911	ATATTA	2	12	563750	563761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_016911	CTT	2	6	563799	563804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_016911	GCA	2	6	564204	564209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_016911	TA	3	6	564255	564260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_016911	ATAA	2	8	564286	564293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016911	TTTAC	2	10	564315	564324	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3134	NC_016911	GGTA	2	8	564338	564345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_016911	AGT	2	6	564423	564428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_016911	TAG	3	9	564515	564523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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