MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 7992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_016911	TTAT	2	8	1173077	1173084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_016911	ACA	2	6	1173215	1173220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_016911	ACT	2	6	1173378	1173383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_016911	GTC	2	6	1173393	1173398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_016911	A	6	6	1173473	1173478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_016911	TAA	2	6	1173492	1173497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_016911	A	6	6	1173502	1173507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_016911	T	6	6	1173675	1173680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_016911	AGTA	2	8	1173685	1173692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_016911	ATT	2	6	1173693	1173698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_016911	A	6	6	1173702	1173707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_016911	TAAAT	2	10	1173712	1173721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_016911	A	6	6	1173743	1173748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_016911	ACA	2	6	1173755	1173760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_016911	T	8	8	1175273	1175280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_016911	TG	3	6	1175289	1175294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_016911	AGC	2	6	1175316	1175321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7519	NC_016911	T	6	6	1176994	1176999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_016911	AAGT	2	8	1177035	1177042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_016911	CTC	2	6	1177089	1177094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7522	NC_016911	A	6	6	1177128	1177133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_016911	TA	3	6	1177137	1177142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_016911	TA	3	6	1177150	1177155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_016911	T	7	7	1177159	1177165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_016911	T	6	6	1183986	1183991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_016911	TAT	2	6	1184000	1184005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7529	NC_016911	GAT	2	6	1184019	1184024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_016911	TAA	2	6	1184201	1184206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_016911	CAT	3	9	1184207	1184215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_016911	ATA	2	6	1184220	1184225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_016911	AAT	2	6	1184248	1184253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_016911	TAAT	2	8	1184320	1184327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_016911	GT	3	6	1184335	1184340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7538	NC_016911	AT	3	6	1184545	1184550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_016911	T	6	6	1184625	1184630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7541	NC_016911	A	6	6	1184703	1184708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_016911	ATT	2	6	1187024	1187029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_016911	AT	3	6	1187097	1187102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_016911	ATA	2	6	1187993	1187998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_016911	TA	3	6	1188013	1188018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_016911	AGC	2	6	1188046	1188051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7548	NC_016911	TAT	2	6	1188101	1188106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_016911	AT	3	6	1188111	1188116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_016911	T	7	7	1188116	1188122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_016911	TGT	2	6	1188947	1188952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_016911	CTAT	2	8	1188957	1188964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7553	NC_016911	TTG	2	6	1188982	1188987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_016911	A	6	6	1188996	1189001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_016911	TTTA	2	8	1189146	1189153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_016911	TTG	2	6	1191154	1191159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_016911	CTA	2	6	1191181	1191186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7560	NC_016911	T	7	7	1191276	1191282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7562	NC_016911	AAT	2	6	1191399	1191404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_016911	T	6	6	1191425	1191430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_016911	A	6	6	1191476	1191481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_016911	ATA	2	6	1191495	1191500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7567	NC_016911	A	7	7	1191564	1191570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_016911	TAA	2	6	1191579	1191584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_016911	GTT	2	6	1192402	1192407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7572	NC_016911	ACC	2	6	1192515	1192520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7573	NC_016911	T	9	9	1192535	1192543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_016911	TTA	2	6	1192584	1192589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7576	NC_016911	AAT	2	6	1193307	1193312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_016911	AT	3	6	1193332	1193337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_016911	ATATT	2	10	1193341	1193350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7581	NC_016911	TTA	2	6	1193398	1193403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_016911	ATAAA	2	10	1193413	1193422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_016911	TGAA	2	8	1193452	1193459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_016911	ATTC	2	8	1193471	1193478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7585	NC_016911	ATTT	3	12	1195992	1196003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7588	NC_016911	TTA	2	6	1196149	1196154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_016911	TA	3	6	1196157	1196162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7597	NC_016911	TGA	2	6	1197165	1197170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7601	NC_016911	TATT	2	8	1197316	1197323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_016911	TC	3	6	1198106	1198111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7603	NC_016911	TTA	2	6	1198113	1198118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_016911	TAT	2	6	1198139	1198144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_016911	TAT	2	6	1198225	1198230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7611	NC_016911	TAT	2	6	1198397	1198402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_016911	CAA	2	6	1198412	1198417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_016911	CTTA	2	8	1198518	1198525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7614	NC_016911	TGT	2	6	1198534	1198539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7619	NC_016911	TTG	2	6	1198658	1198663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7621	NC_016911	TC	3	6	1198782	1198787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7622	NC_016911	ATTT	2	8	1198789	1198796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_016911	ATA	2	6	1198810	1198815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_016911	TCT	2	6	1198821	1198826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7625	NC_016911	ATA	2	6	1199130	1199135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_016911	TAT	3	9	1199168	1199176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_016911	T	6	6	1199209	1199214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_016911	ATTT	2	8	1199222	1199229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_016911	TCT	2	6	1199230	1199235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7630	NC_016911	TTC	2	6	1199241	1199246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7631	NC_016911	CTG	2	6	1199324	1199329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7632	NC_016911	ATTTA	2	10	1199336	1199345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7896	NC_016911	T	6	6	1254861	1254866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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