MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 7954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016909	ATAA	2	8	181324	181331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016909	TA	3	6	181341	181346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016909	ATT	2	6	181380	181385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016909	TAA	2	6	181413	181418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016909	TTA	2	6	181437	181442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016909	A	8	8	181450	181457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016909	TGA	2	6	181460	181465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016909	ATT	2	6	181494	181499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016909	TCAG	2	8	181550	181557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_016909	A	6	6	185712	185717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016909	T	6	6	185722	185727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016909	GAG	2	6	185834	185839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016909	TA	3	6	185913	185918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016909	GTC	2	6	190097	190102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016909	A	6	6	190207	190212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016909	ATT	2	6	191652	191657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016909	A	6	6	191690	191695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016909	ATAA	2	8	191771	191778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016909	ATA	2	6	191797	191802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016909	GTC	2	6	193356	193361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_016909	AGC	2	6	193368	193373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_016909	TTAC	2	8	193423	193430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_016909	ATG	2	6	193445	193450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016909	A	6	6	193452	193457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016909	AT	5	10	194365	194374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016909	AAGAG	2	10	194403	194412	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016909	TA	3	6	194908	194913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016909	TAA	2	6	194928	194933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016909	TGT	2	6	196764	196769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016909	ATG	2	6	196775	196780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016909	A	7	7	196877	196883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016909	TAA	2	6	196927	196932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016909	CAA	2	6	197023	197028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_016909	GTT	2	6	199186	199191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016909	TCA	2	6	199208	199213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_016909	T	7	7	199274	199280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016909	ATT	2	6	199281	199286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016909	T	6	6	199285	199290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016909	ATG	2	6	199323	199328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016909	A	6	6	199478	199483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016909	ATA	2	6	200267	200272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016909	T	6	6	200294	200299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016909	TAA	2	6	201051	201056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016909	AGTA	2	8	201063	201070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016909	TTA	2	6	201154	201159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016909	ACG	2	6	201161	201166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016909	T	6	6	201222	201227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016909	TAA	2	6	201237	201242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016909	A	6	6	201273	201278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016909	GCA	2	6	201290	201295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016909	A	6	6	201295	201300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016909	AAT	2	6	202503	202508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016909	TTG	2	6	202555	202560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016909	GTA	2	6	202596	202601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016909	CAA	2	6	202685	202690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_016909	GCT	2	6	202699	202704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016909	TTA	2	6	206002	206007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016909	GTC	2	6	206070	206075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_016909	TTTAT	2	10	206150	206159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016909	A	6	6	206166	206171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016909	T	6	6	206184	206189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016909	TTA	2	6	206201	206206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016909	ACC	2	6	206212	206217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_016909	CTTT	2	8	206223	206230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_016909	T	7	7	206228	206234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016909	T	6	6	206236	206241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016909	AT	3	6	206250	206255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016909	TTG	2	6	206521	206526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016909	TTG	2	6	206577	206582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016909	CTG	2	6	206598	206603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_016909	ATT	2	6	206644	206649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016909	T	6	6	206654	206659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016909	CAA	2	6	206722	206727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_016909	CAA	2	6	206760	206765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_016909	TTTA	2	8	207354	207361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_016909	ATT	2	6	207521	207526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016909	GCT	2	6	207553	207558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1082	NC_016909	ACA	2	6	207618	207623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016909	AATTA	2	10	210257	210266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016909	TAAAT	2	10	210274	210283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016909	TAA	2	6	210289	210294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016909	AT	3	6	210300	210305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016909	TAAAA	2	10	210309	210318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016909	A	6	6	210315	210320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016909	TATT	2	8	210352	210359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016909	ATA	2	6	210380	210385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016909	TATTTA	2	12	210400	210411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016909	ATA	2	6	210416	210421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016909	TGAT	2	8	210428	210435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016909	TTA	2	6	210436	210441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016909	ATT	2	6	210703	210708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016909	AAG	2	6	210730	210735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016909	TA	3	6	210771	210776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016909	TA	3	6	210785	210790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016909	T	6	6	210794	210799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016909	CAA	2	6	210802	210807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_016909	A	6	6	210843	210848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016909	GTTTT	2	10	210853	210862	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016909	GTT	2	6	210910	210915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016909	TAA	2	6	210994	210999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016909	TGC	2	6	211016	211021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_016909	TATT	2	8	211033	211040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016909	ATG	2	6	211280	211285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016909	A	6	6	211291	211296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016909	TAA	2	6	211920	211925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016909	TTA	2	6	211957	211962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016909	TTG	3	9	211976	211984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016909	T	6	6	211996	212001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016909	TC	4	8	212011	212018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_016909	TAT	2	6	212060	212065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016909	T	6	6	212086	212091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016909	T	6	6	212140	212145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016909	ATA	2	6	212202	212207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016909	T	7	7	212229	212235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016909	ATT	2	6	212284	212289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016909	AGA	2	6	212341	212346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016909	ATTAT	2	10	212432	212441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016909	CGA	2	6	212485	212490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_016909	A	6	6	212516	212521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016909	CTT	2	6	214909	214914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_016909	ATTTA	2	10	214919	214928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016909	ATA	2	6	214980	214985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016909	AAT	2	6	215047	215052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016909	CTAA	2	8	215064	215071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_016909	TAAT	2	8	215084	215091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016909	TAG	2	6	215103	215108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016909	ATA	2	6	215109	215114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016909	AGCA	2	8	215123	215130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_016909	TAA	2	6	216234	216239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016909	ATT	2	6	216240	216245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016909	TCG	2	6	216280	216285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_016909	AAATT	2	10	216374	216383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_016909	TAT	2	6	216902	216907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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