MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 7954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_016909	ATT	2	6	1184445	1184450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_016909	AT	3	6	1184518	1184523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_016909	ATA	2	6	1185414	1185419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_016909	TA	3	6	1185434	1185439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_016909	AGC	2	6	1185467	1185472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_016909	AAT	2	6	1185482	1185487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_016909	TAT	2	6	1185522	1185527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_016909	AT	3	6	1185532	1185537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_016909	T	7	7	1185537	1185543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_016909	TGT	2	6	1186368	1186373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_016909	CTAT	2	8	1186378	1186385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7512	NC_016909	TTG	2	6	1186403	1186408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_016909	A	6	6	1186417	1186422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_016909	TTTA	2	8	1186567	1186574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_016909	TTG	2	6	1188575	1188580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_016909	CTA	2	6	1188602	1188607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_016909	GTT	2	6	1188629	1188634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_016909	A	6	6	1188687	1188692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_016909	T	7	7	1188697	1188703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_016909	ACA	2	6	1188788	1188793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_016909	AAT	2	6	1188820	1188825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_016909	T	6	6	1188846	1188851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_016909	A	6	6	1188897	1188902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_016909	ATA	2	6	1188916	1188921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_016909	ACAA	2	8	1188979	1188986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7526	NC_016909	A	7	7	1188985	1188991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_016909	TAA	2	6	1189000	1189005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_016909	GTT	2	6	1189823	1189828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_016909	ATA	2	6	1189846	1189851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_016909	A	6	6	1189879	1189884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_016909	ACC	2	6	1189936	1189941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7532	NC_016909	T	11	11	1189956	1189966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_016909	TTA	2	6	1190007	1190012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_016909	AT	3	6	1190026	1190031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_016909	AAT	2	6	1190730	1190735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_016909	AT	3	6	1190755	1190760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_016909	ATATT	2	10	1190764	1190773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_016909	T	6	6	1190772	1190777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_016909	ATA	2	6	1190809	1190814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_016909	TTA	2	6	1190821	1190826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_016909	ATAAA	2	10	1190836	1190845	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_016909	TGAA	2	8	1190875	1190882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_016909	ATTC	2	8	1190894	1190901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7544	NC_016909	ATTT	3	12	1193415	1193426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_016909	ATT	2	6	1193487	1193492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_016909	AAT	2	6	1193509	1193514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_016909	TTA	2	6	1193572	1193577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_016909	TA	3	6	1193580	1193585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_016909	AG	3	6	1193593	1193598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_016909	TAT	2	6	1194146	1194151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_016909	GCT	2	6	1194178	1194183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_016909	ATA	2	6	1194486	1194491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_016909	A	7	7	1194501	1194507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_016909	CGG	2	6	1194510	1194515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_016909	T	7	7	1194549	1194555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_016909	TGA	2	6	1194588	1194593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_016909	GCA	2	6	1194651	1194656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_016909	ATC	2	6	1194679	1194684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_016909	TAA	2	6	1194727	1194732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_016909	TATT	2	8	1194739	1194746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_016909	TC	3	6	1195529	1195534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7562	NC_016909	TTA	2	6	1195536	1195541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_016909	TAT	2	6	1195562	1195567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_016909	TAT	2	6	1195648	1195653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_016909	TCATTT	2	12	1195668	1195679	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7566	NC_016909	TTG	2	6	1195694	1195699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_016909	TAA	2	6	1195729	1195734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_016909	CTG	2	6	1195755	1195760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_016909	GTCA	2	8	1195803	1195810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7570	NC_016909	TAT	2	6	1195820	1195825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_016909	CAA	2	6	1195835	1195840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_016909	CTTA	2	8	1195941	1195948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7573	NC_016909	TGT	2	6	1195957	1195962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7577	NC_016909	TTG	2	6	1196048	1196053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_016909	TTG	2	6	1196081	1196086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7581	NC_016909	ATTT	2	8	1196212	1196219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_016909	ATA	2	6	1196233	1196238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7585	NC_016909	TAT	3	9	1196591	1196599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7599	NC_016909	ATT	2	6	1197499	1197504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7602	NC_016909	TA	3	6	1197623	1197628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_016909	TCACT	2	10	1200517	1200526	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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7606	NC_016909	GTA	2	6	1200559	1200564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7611	NC_016909	TAA	2	6	1202339	1202344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_016909	TAA	2	6	1202349	1202354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_016909	CA	3	6	1202414	1202419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7614	NC_016909	TAG	2	6	1202568	1202573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7617	NC_016909	TA	3	6	1202648	1202653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7620	NC_016909	TAG	2	6	1202705	1202710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_016909	GTTT	2	8	1202728	1202735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7623	NC_016909	ATT	2	6	1203124	1203129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_016909	ATT	2	6	1203192	1203197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7630	NC_016909	ATA	2	6	1203567	1203572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7631	NC_016909	A	6	6	1203585	1203590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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