MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 7954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016909	A	7	7	816187	816193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016909	CA	3	6	816271	816276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_016909	CA	3	6	816305	816310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_016909	T	6	6	816339	816344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016909	ATT	2	6	816372	816377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016909	AT	3	6	816380	816385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016909	TAC	2	6	816463	816468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_016909	TTG	2	6	816501	816506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016909	AAT	2	6	816586	816591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016909	A	6	6	816625	816630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016909	ATTAT	2	10	816637	816646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016909	ATT	2	6	816662	816667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016909	TAA	2	6	816677	816682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016909	ATTTT	2	10	816685	816694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016909	T	6	6	816691	816696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016909	ATAA	2	8	816699	816706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016909	TCAA	2	8	816781	816788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_016909	A	7	7	816809	816815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016909	A	9	9	816822	816830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016909	CCAA	2	8	816864	816871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_016909	CTT	2	6	816896	816901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_016909	AT	4	8	816943	816950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016909	AT	3	6	818389	818394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016909	AAT	2	6	818417	818422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016909	TAA	2	6	818443	818448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016909	ATA	2	6	818503	818508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016909	TGA	2	6	818560	818565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5032	NC_016909	A	6	6	820972	820977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016909	A	7	7	821016	821022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016909	T	6	6	821027	821032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5037	NC_016909	TAA	2	6	821639	821644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_016909	CTC	2	6	822283	822288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_016909	TAG	2	6	822325	822330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5041	NC_016909	TC	3	6	822369	822374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_016909	T	6	6	822390	822395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016909	TA	3	6	822623	822628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016909	T	6	6	823036	823041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5046	NC_016909	TCA	2	6	823079	823084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_016909	TATAA	2	10	823404	823413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016909	ATTAT	2	10	823421	823430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016909	T	6	6	823473	823478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016909	T	6	6	824029	824034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016909	CCA	2	6	824491	824496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_016909	GA	4	8	824535	824542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016909	T	6	6	824564	824569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016909	AGC	2	6	824570	824575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5059	NC_016909	TAT	2	6	825009	825014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016909	CAT	2	6	825044	825049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5062	NC_016909	TAT	2	6	825109	825114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016909	TAT	2	6	825122	825127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016909	TTAT	2	8	825132	825139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_016909	TCA	2	6	825276	825281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5067	NC_016909	T	6	6	825310	825315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_016909	CT	4	8	825345	825352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_016909	TTA	2	6	825359	825364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016909	GTA	2	6	825562	825567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5073	NC_016909	TCT	2	6	825612	825617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5083	NC_016909	T	7	7	825953	825959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_016909	TAT	2	6	826549	826554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_016909	GAA	2	6	827841	827846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5104	NC_016909	TAT	2	6	827965	827970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016909	T	6	6	830749	830754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_016909	ATT	3	9	830819	830827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016909	AATA	2	8	830828	830835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_016909	TA	3	6	830863	830868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_016909	GTC	2	6	831811	831816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5115	NC_016909	CA	3	6	831959	831964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5117	NC_016909	GAAC	2	8	832893	832900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5120	NC_016909	TA	3	6	836711	836716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_016909	TGTT	2	8	837944	837951	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5128	NC_016909	TAA	2	6	838154	838159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016909	TATT	2	8	839898	839905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_016909	GAAA	2	8	840093	840100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_016909	TTA	2	6	840251	840256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_016909	TCT	2	6	840619	840624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5139	NC_016909	TTA	2	6	841139	841144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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