MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 7867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016908	AG	3	6	265108	265113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016908	AAGGA	2	10	265130	265139	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016908	AGA	2	6	265161	265166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016908	AAG	2	6	265241	265246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016908	GAAT	2	8	265325	265332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016908	AAT	2	6	265366	265371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016908	AGC	2	6	265380	265385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_016908	CAG	3	9	265442	265450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_016908	TGG	2	6	265482	265487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016908	AGT	2	6	265488	265493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016908	GTA	2	6	265495	265500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016908	CTG	2	6	265505	265510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016908	GCACCG	2	12	265609	265620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_016908	TTA	2	6	265625	265630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016908	GAA	2	6	265666	265671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016908	AG	3	6	265686	265691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016908	TGA	2	6	265725	265730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016908	GAT	3	9	265735	265743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016908	GAA	2	6	265753	265758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016908	ATG	2	6	265769	265774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016908	TATAA	2	10	265777	265786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016908	TAG	2	6	265815	265820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016908	AAAT	2	8	265824	265831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016908	AAG	2	6	265889	265894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016908	AGG	2	6	265895	265900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016908	AGT	2	6	265905	265910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016908	AAGC	2	8	265934	265941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_016908	GCT	2	6	265966	265971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_016908	GAA	2	6	266008	266013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016908	AT	4	8	266026	266033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016908	TGC	2	6	266100	266105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_016908	TGA	2	6	266109	266114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016908	TGC	2	6	266202	266207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016908	GGT	2	6	266209	266214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016908	ATA	2	6	266465	266470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016908	TTA	2	6	266488	266493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016908	ATC	2	6	266501	266506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_016908	ATA	2	6	266746	266751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016908	A	6	6	266754	266759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016908	A	6	6	266983	266988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016908	A	6	6	267016	267021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016908	T	9	9	267037	267045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016908	T	6	6	267047	267052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016908	GCT	2	6	267075	267080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_016908	ATA	2	6	267132	267137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016908	T	6	6	269615	269620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016908	TA	4	8	270000	270007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016908	TA	4	8	270014	270021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016908	T	6	6	272314	272319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016908	AT	3	6	272341	272346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016908	A	7	7	272355	272361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016908	ATC	2	6	272975	272980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016908	AGC	2	6	272987	272992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_016908	ATA	2	6	273019	273024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016908	ATGACG	2	12	273067	273078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1556	NC_016908	ATA	2	6	275124	275129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016908	A	7	7	275144	275150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016908	AGG	2	6	275522	275527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016908	TTA	2	6	275531	275536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016908	TCGC	2	8	275565	275572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_016908	ATG	2	6	275613	275618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016908	AAAAC	2	10	275649	275658	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1563	NC_016908	ATTC	2	8	275667	275674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_016908	TC	3	6	275673	275678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_016908	CT	3	6	275734	275739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_016908	TAA	2	6	275764	275769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016908	AT	3	6	275795	275800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016908	TAAA	2	8	275812	275819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016908	ATT	2	6	275847	275852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016908	T	6	6	275905	275910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016908	AGT	2	6	276046	276051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016908	TAA	2	6	276156	276161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016908	AAT	2	6	276251	276256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016908	GAA	2	6	276308	276313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_016908	TTA	2	6	277028	277033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016908	GA	3	6	277069	277074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016908	ATTGCA	2	12	277108	277119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1581	NC_016908	A	6	6	277131	277136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016908	AT	3	6	277144	277149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016908	TGA	2	6	277155	277160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016908	CAA	2	6	277163	277168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_016908	TAC	2	6	277233	277238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_016908	TAT	2	6	277266	277271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016908	TGC	2	6	277553	277558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016908	A	7	7	277592	277598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016908	A	6	6	277641	277646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016908	TAT	2	6	277716	277721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016908	TAG	2	6	277765	277770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016908	TAT	2	6	277812	277817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_016908	AT	3	6	278095	278100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016908	GTC	2	6	278152	278157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_016908	A	6	6	278226	278231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016908	TA	3	6	278264	278269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016908	A	6	6	278278	278283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016908	CAA	2	6	278324	278329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_016908	GCA	2	6	278336	278341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_016908	GAAA	2	8	278395	278402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016908	TAT	2	6	278405	278410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016908	TAT	2	6	278416	278421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016908	TCA	2	6	281259	281264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_016908	GAG	2	6	281269	281274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016908	TTG	2	6	281278	281283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016908	CAA	2	6	281356	281361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_016908	AGC	2	6	281371	281376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_016908	ATA	2	6	281403	281408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016908	TTA	2	6	281462	281467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016908	C	7	7	281493	281499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1615	NC_016908	A	8	8	281500	281507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016908	CT	3	6	281542	281547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_016908	ATA	2	6	281548	281553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016908	T	8	8	281595	281602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016908	ACT	2	6	281603	281608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1622	NC_016908	TAT	2	6	281730	281735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016908	TCTA	2	8	281802	281809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_016908	ATT	2	6	281823	281828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016908	ATT	2	6	281839	281844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016908	TGT	2	6	281865	281870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_016908	ATT	2	6	281909	281914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016908	TGTT	2	8	281933	281940	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016908	TA	3	6	281966	281971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016908	AT	3	6	281973	281978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016908	TTG	2	6	282514	282519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_016908	ATT	2	6	282941	282946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_016908	T	6	6	283075	283080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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