MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 1256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016835	CTG	2	6	370812	370817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016835	TAA	2	6	370867	370872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016835	GAT	2	6	373342	373347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016835	GGC	2	6	373355	373360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_016835	GCA	2	6	373361	373366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_016835	CTT	2	6	373386	373391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_016835	T	6	6	373390	373395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016835	T	6	6	374357	374362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016835	GCAG	2	8	374366	374373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_016835	T	6	6	374384	374389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016835	ATAA	2	8	374407	374414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016835	T	7	7	374489	374495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016835	GTCA	2	8	374501	374508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_016835	TTC	2	6	376383	376388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016835	T	8	8	376424	376431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016835	GAA	2	6	376436	376441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016835	TAA	2	6	376456	376461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016835	ATT	2	6	376481	376486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016835	TCATTT	2	12	376511	376522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1020	NC_016835	GCGT	2	8	376770	376777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_016835	TACA	2	8	376785	376792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_016835	GGT	2	6	376825	376830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016835	TTC	2	6	377750	377755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_016835	G	7	7	377836	377842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016835	T	6	6	377899	377904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016835	TTC	2	6	377940	377945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_016835	TAC	3	9	378005	378013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_016835	TCA	2	6	381387	381392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_016835	T	6	6	381400	381405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016835	T	6	6	381434	381439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016835	GCC	2	6	381571	381576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_016835	TGA	2	6	383229	383234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016835	ATG	2	6	385431	385436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016835	T	6	6	385468	385473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016835	CTT	2	6	385714	385719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_016835	CTG	2	6	385756	385761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016835	TTA	2	6	387053	387058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016835	TTC	2	6	387079	387084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_016835	TAAA	2	8	387713	387720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016835	TTAA	2	8	387728	387735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016835	TA	3	6	387790	387795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016835	GAAA	2	8	387823	387830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016835	GGC	2	6	387850	387855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_016835	T	6	6	387858	387863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016835	GAT	2	6	388425	388430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016835	CTG	2	6	388500	388505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016835	GAAA	2	8	389183	389190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016835	ACGC	2	8	389201	389208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_016835	TA	3	6	389629	389634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016835	CAT	2	6	389662	389667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016835	GCG	2	6	389687	389692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_016835	ATA	2	6	389708	389713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016835	A	6	6	389858	389863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016835	TAC	2	6	389913	389918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_016835	GAT	2	6	391796	391801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016835	AAC	2	6	391860	391865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016835	TGC	2	6	394420	394425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_016835	CAT	2	6	396679	396684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_016835	TGAA	2	8	396701	396708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016835	AAT	2	6	396760	396765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016835	GGT	2	6	396779	396784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016835	AGT	2	6	397561	397566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016835	GCT	2	6	397600	397605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_016835	AG	3	6	401440	401445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016835	T	6	6	401447	401452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016835	TA	3	6	401494	401499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016835	ATGA	2	8	401506	401513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016835	CAG	2	6	401542	401547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_016835	AC	3	6	401602	401607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_016835	GGTC	2	8	401802	401809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_016835	AAT	2	6	402816	402821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016835	GTT	2	6	402857	402862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016835	CTGA	2	8	402922	402929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_016835	TGA	2	6	402964	402969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016835	CAT	2	6	402986	402991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_016835	TGA	2	6	403058	403063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016835	CAG	2	6	403069	403074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_016835	TC	3	6	403887	403892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_016835	T	6	6	403919	403924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016835	GCG	2	6	405326	405331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_016835	GGCT	2	8	405333	405340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_016835	AT	3	6	405353	405358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016835	ATT	2	6	405379	405384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016835	AAC	2	6	405388	405393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016835	TGA	2	6	405394	405399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016835	TAA	2	6	406621	406626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016835	TCGT	2	8	406651	406658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_016835	CATT	2	8	406662	406669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_016835	TCA	2	6	406676	406681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_016835	CAAT	2	8	406691	406698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_016835	TCC	2	6	406744	406749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_016835	ATG	2	6	406757	406762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016835	CA	3	6	406769	406774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_016835	TAA	2	6	406778	406783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016835	AAC	2	6	410106	410111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_016835	TGA	2	6	410179	410184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016835	GT	3	6	410968	410973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016835	ATC	2	6	410990	410995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_016835	T	7	7	411025	411031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016835	GCT	2	6	412496	412501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_016835	ATT	2	6	413454	413459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016835	CTT	2	6	413467	413472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_016835	T	8	8	413555	413562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016835	TAT	3	9	413593	413601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016835	TCG	2	6	413602	413607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_016835	CG	3	6	413630	413635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_016835	GTTT	2	8	413641	413648	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016835	A	7	7	414095	414101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016835	TC	4	8	414197	414204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_016835	T	6	6	418048	418053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016835	TAAA	2	8	418058	418065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016835	TTA	2	6	418109	418114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016835	GTATT	2	10	418127	418136	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016835	ATGAA	2	10	418163	418172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016835	TTTC	2	8	418750	418757	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_016835	AT	4	8	418779	418786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016835	ATG	2	6	419601	419606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016835	ATG	2	6	419615	419620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016835	ATG	2	6	419668	419673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016835	TTTA	2	8	419679	419686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016835	TGA	2	6	419770	419775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016835	TTA	2	6	419782	419787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016835	TA	4	8	419786	419793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016835	ATT	3	9	419801	419809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016835	AG	3	6	419871	419876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016835	AT	3	6	419890	419895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016835	TGA	2	6	419906	419911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016835	TCA	2	6	419920	419925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016835	CGCCA	2	10	419936	419945	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1130	NC_016835	T	6	6	419958	419963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016835	GCA	2	6	420008	420013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_016835	CTGC	2	8	420027	420034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_016835	GC	3	6	420033	420038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_016835	AAAC	2	8	426779	426786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_016835	T	7	7	426808	426814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_016835	AAAC	2	8	426842	426849	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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