MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	ATG	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016818	T	6	6	151	156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016818	CAG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016818	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016818	A	6	6	436	441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016818	CTTTT	2	10	452	461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016818	T	6	6	458	463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016818	GGC	2	6	6533	6538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016818	T	8	8	6580	6587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016818	GC	3	6	6594	6599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016818	GGCT	2	8	6610	6617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016818	GAG	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016818	CCGG	2	8	8801	8808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016818	A	6	6	9262	9267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016818	AAGC	2	8	9274	9281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016818	TCTG	2	8	9340	9347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016818	ACA	2	6	9402	9407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016818	T	6	6	9414	9419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016818	T	6	6	9421	9426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016818	ACG	2	6	9466	9471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016818	AGG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016818	TTC	2	6	9495	9500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016818	TCA	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016818	GGTC	2	8	9519	9526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016818	GGA	2	6	9532	9537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016818	CAA	2	6	9543	9548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016818	ATC	2	6	10114	10119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016818	AAG	2	6	10128	10133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016818	AAAAG	2	10	10596	10605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016818	GGA	2	6	10607	10612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016818	TCC	2	6	10623	10628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016818	TGA	2	6	11936	11941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016818	CCA	2	6	11942	11947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016818	GGCAG	2	10	11958	11967	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016818	ACC	2	6	11977	11982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016818	AGC	2	6	11992	11997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016818	GAAT	2	8	12031	12038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016818	TAT	2	6	12067	12072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016818	TAA	2	6	12092	12097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016818	ATT	2	6	12133	12138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016818	T	6	6	12137	12142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016818	AT	3	6	12146	12151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016818	A	7	7	13383	13389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016818	GTT	2	6	16589	16594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016818	GAA	2	6	16678	16683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016818	GAA	2	6	16700	16705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016818	TC	3	6	17753	17758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016818	T	7	7	19149	19155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016818	AGA	2	6	21304	21309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016818	TGA	2	6	21333	21338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016818	TGA	2	6	22516	22521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016818	TTA	2	6	23224	23229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016818	CTGC	2	8	23253	23260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016818	GGA	2	6	23312	23317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016818	GCG	2	6	23328	23333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016818	GTC	2	6	24439	24444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016818	GT	3	6	24474	24479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016818	CCT	2	6	24521	24526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016818	ATT	2	6	24604	24609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016818	TC	3	6	26696	26701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016818	CT	3	6	26763	26768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016818	GC	3	6	29902	29907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016818	GTGG	2	8	29943	29950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016818	GCG	2	6	30081	30086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016818	GTT	2	6	30097	30102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016818	T	6	6	30140	30145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016818	C	6	6	30158	30163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_016818	GAA	3	9	30220	30228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016818	TGA	2	6	30990	30995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016818	T	6	6	31022	31027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016818	AAT	2	6	31047	31052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016818	AAT	2	6	31083	31088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016818	A	6	6	31089	31094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016818	T	7	7	31108	31114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016818	ATTGCC	2	12	31189	31200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016818	AAT	2	6	31300	31305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016818	GTC	2	6	31306	31311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016818	T	6	6	31321	31326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016818	TCT	2	6	31352	31357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016818	ATC	2	6	34451	34456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016818	A	6	6	35722	35727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016818	T	6	6	35734	35739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016818	TCT	2	6	36651	36656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016818	CTT	2	6	36749	36754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016818	TTC	2	6	36755	36760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016818	TGTC	2	8	37035	37042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016818	T	6	6	38645	38650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016818	C	6	6	38662	38667	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_016818	TTTCC	2	10	38705	38714	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016818	T	6	6	38732	38737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016818	AC	3	6	38747	38752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016818	TAA	2	6	38807	38812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016818	AAT	2	6	38852	38857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016818	GACG	2	8	39013	39020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016818	AAC	2	6	39050	39055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016818	TTG	2	6	41094	41099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016818	GGC	2	6	41111	41116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016818	A	6	6	43858	43863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016818	TC	5	10	45785	45794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016818	AAT	2	6	45805	45810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016818	TGCAAA	2	12	45832	45843	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016818	CTC	2	6	46337	46342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016818	AGC	2	6	46358	46363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016818	TGC	2	6	47452	47457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016818	ATA	2	6	47482	47487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016818	ACG	2	6	47515	47520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016818	ATCA	2	8	47524	47531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016818	TTTTG	2	10	47599	47608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016818	CCCA	2	8	47619	47626	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_016818	GGGA	2	8	47643	47650	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016818	GCT	2	6	48349	48354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016818	CA	3	6	48414	48419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016818	GCG	2	6	50494	50499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016818	A	6	6	50527	50532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016818	AGA	2	6	50543	50548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016818	A	6	6	50594	50599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016818	CCG	2	6	50614	50619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016818	CAT	2	6	50630	50635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016818	GGC	2	6	50649	50654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016818	GGC	2	6	51307	51312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016818	TTAA	2	8	51355	51362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016818	AAGAA	2	10	51456	51465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016818	GGTC	2	8	51479	51486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016818	AAT	2	6	51506	51511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016818	ATT	2	6	53068	53073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016818	TAA	2	6	53082	53087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016818	AT	3	6	53097	53102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016818	GAT	2	6	53113	53118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016818	GA	3	6	53207	53212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016818	GAT	2	6	54236	54241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016818	GCT	2	6	59830	59835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016818	GAG	2	6	59863	59868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016818	CTG	2	6	60595	60600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016818	AT	3	6	62178	62183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016818	T	6	6	62183	62188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016818	AT	3	6	62231	62236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016818	AAT	2	6	62250	62255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016818	CCT	2	6	62294	62299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_016818	TAT	2	6	62330	62335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016818	ATC	2	6	62379	62384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016818	TAAA	2	8	62390	62397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016818	GA	3	6	62421	62426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016818	AGA	2	6	64048	64053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016818	GAAA	2	8	72789	72796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016818	CTT	2	6	73802	73807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016818	TTTATT	2	12	73815	73826	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016818	ATTT	2	8	73833	73840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016818	GTT	2	6	73849	73854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_016818	TCA	2	6	140210	140215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_016818	ATT	2	6	140250	140255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016818	TGT	2	6	140335	140340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_016818	GGT	2	6	140443	140448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_016818	T	7	7	142503	142509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_016818	CTG	2	6	142524	142529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_016818	CAT	2	6	142588	142593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_016818	CTG	2	6	142614	142619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_016818	A	6	6	143975	143980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_016818	AGGA	2	8	144006	144013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
301	NC_016818	ATTT	2	8	144026	144033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_016818	ATA	2	6	144091	144096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_016818	ATA	2	6	144131	144136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_016818	CGAC	2	8	144234	144241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
305	NC_016818	TTG	2	6	145816	145821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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308	NC_016818	TGGGG	2	10	145864	145873	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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315	NC_016818	A	7	7	147055	147061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_016818	A	6	6	147067	147072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_016818	TGT	2	6	147341	147346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_016818	ACCTG	2	10	148426	148435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
324	NC_016818	CT	3	6	148513	148518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
325	NC_016818	CCT	2	6	148539	148544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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330	NC_016818	TCAG	2	8	153140	153147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
331	NC_016818	TGT	2	6	154324	154329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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342	NC_016818	AT	3	6	161673	161678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_016818	TAA	2	6	164967	164972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_016818	ATA	2	6	192036	192041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_016818	ACA	2	6	195825	195830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_016818	TGT	2	6	195890	195895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
427	NC_016818	AG	3	6	195935	195940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
428	NC_016818	A	7	7	195954	195960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_016818	CAG	2	6	196024	196029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_016818	CAA	2	6	196065	196070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_016818	GA	3	6	196787	196792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_016818	ATA	2	6	207907	207912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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