MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016818	ATA	2	6	4417530	4417535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_016818	TGC	2	6	4417572	4417577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_016818	TAC	2	6	4417588	4417593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_016818	AAT	2	6	4418295	4418300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_016818	GCA	2	6	4418301	4418306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_016818	GAC	2	6	4418312	4418317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_016818	CCCCG	2	10	4419267	4419276	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11508	NC_016818	GGA	2	6	4419296	4419301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_016818	ATT	2	6	4419385	4419390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_016818	GA	3	6	4419397	4419402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_016818	GTAC	2	8	4420326	4420333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_016818	A	6	6	4420334	4420339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_016818	CTC	2	6	4420356	4420361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11514	NC_016818	GAG	2	6	4420418	4420423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_016818	T	6	6	4422299	4422304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_016818	TGT	2	6	4422319	4422324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_016818	TTA	2	6	4422377	4422382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_016818	ATC	2	6	4422403	4422408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_016818	A	7	7	4425578	4425584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_016818	GCC	2	6	4426850	4426855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11521	NC_016818	CGGTG	2	10	4426934	4426943	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11522	NC_016818	CAA	2	6	4427683	4427688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_016818	AAAG	2	8	4427705	4427712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_016818	ATT	2	6	4427732	4427737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_016818	AGG	2	6	4427797	4427802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_016818	TCC	2	6	4428804	4428809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11527	NC_016818	CAT	2	6	4428812	4428817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_016818	ACA	2	6	4430260	4430265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_016818	TGT	2	6	4430288	4430293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_016818	TGA	2	6	4430877	4430882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_016818	GCA	2	6	4430953	4430958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_016818	CAC	2	6	4430963	4430968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11533	NC_016818	ACA	2	6	4431013	4431018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_016818	TTC	2	6	4431099	4431104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_016818	CGG	2	6	4431145	4431150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_016818	ATG	2	6	4431186	4431191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_016818	TTTG	2	8	4434085	4434092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_016818	ACTGC	2	10	4435910	4435919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11539	NC_016818	TCCTT	2	10	4437137	4437146	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11540	NC_016818	TTC	2	6	4438171	4438176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_016818	ATC	2	6	4438217	4438222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_016818	GTA	2	6	4440610	4440615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_016818	GCA	2	6	4440621	4440626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_016818	TC	3	6	4448732	4448737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11545	NC_016818	GTG	2	6	4448775	4448780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_016818	TTTG	2	8	4448783	4448790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_016818	T	6	6	4448794	4448799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_016818	A	6	6	4448823	4448828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_016818	T	6	6	4448843	4448848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_016818	TCA	2	6	4448874	4448879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_016818	TGTC	2	8	4450632	4450639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11552	NC_016818	AAT	2	6	4450666	4450671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_016818	GTGA	2	8	4450736	4450743	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_016818	CAAC	2	8	4450747	4450754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_016818	GCA	3	9	4450755	4450763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_016818	TTGGT	2	10	4451991	4452000	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_016818	A	6	6	4452072	4452077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_016818	TGT	2	6	4452089	4452094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_016818	CATC	2	8	4452182	4452189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_016818	GTT	2	6	4452988	4452993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_016818	TAAC	2	8	4452997	4453004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11562	NC_016818	T	6	6	4453016	4453021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_016818	ATA	3	9	4453683	4453691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_016818	TAAT	2	8	4453711	4453718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_016818	CACG	2	8	4453743	4453750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_016818	ATT	2	6	4453794	4453799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_016818	ATTC	2	8	4453823	4453830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_016818	ATA	2	6	4453831	4453836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_016818	AAAT	2	8	4453864	4453871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_016818	A	6	6	4454434	4454439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_016818	T	6	6	4454478	4454483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_016818	ATT	2	6	4456404	4456409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_016818	AGC	2	6	4456418	4456423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_016818	A	6	6	4456512	4456517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_016818	ATT	2	6	4457976	4457981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_016818	CG	3	6	4458039	4458044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11577	NC_016818	A	6	6	4458145	4458150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_016818	A	6	6	4459163	4459168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_016818	GAC	2	6	4459210	4459215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_016818	CTG	2	6	4459235	4459240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_016818	TG	3	6	4459290	4459295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_016818	TGA	2	6	4459308	4459313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_016818	CTG	2	6	4459328	4459333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_016818	A	6	6	4459371	4459376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_016818	T	7	7	4459462	4459468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_016818	CAGC	2	8	4459481	4459488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11587	NC_016818	TAA	2	6	4459787	4459792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_016818	ATAA	2	8	4459862	4459869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_016818	TTGA	2	8	4459870	4459877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_016818	A	6	6	4459887	4459892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_016818	ACGA	2	8	4459905	4459912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11592	NC_016818	GTA	2	6	4459924	4459929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_016818	GCC	2	6	4461044	4461049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11594	NC_016818	TCG	2	6	4461154	4461159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_016818	AAT	2	6	4461180	4461185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_016818	ATG	2	6	4461196	4461201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_016818	ACG	2	6	4461765	4461770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_016818	GAA	2	6	4461779	4461784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_016818	CTG	2	6	4461842	4461847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_016818	TAG	2	6	4462170	4462175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_016818	TTA	2	6	4462216	4462221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_016818	TAA	2	6	4462278	4462283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_016818	GCC	2	6	4462316	4462321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_016818	AGTAAC	2	12	4462322	4462333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11605	NC_016818	GGC	2	6	4462401	4462406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_016818	GTT	2	6	4463113	4463118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_016818	TA	3	6	4463138	4463143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_016818	GCG	2	6	4463672	4463677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_016818	A	6	6	4466221	4466226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_016818	T	6	6	4466241	4466246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_016818	T	7	7	4466261	4466267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_016818	TTA	2	6	4468260	4468265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_016818	A	6	6	4468310	4468315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_016818	TTTA	2	8	4468341	4468348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_016818	GGC	2	6	4468393	4468398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_016818	TAAG	2	8	4468426	4468433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_016818	AATA	2	8	4470157	4470164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_016818	CG	3	6	4470350	4470355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11619	NC_016818	AGA	2	6	4470371	4470376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_016818	GGA	2	6	4470401	4470406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_016818	GCG	2	6	4470438	4470443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_016818	ATC	2	6	4470449	4470454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_016818	GGCA	2	8	4470462	4470469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11624	NC_016818	GTA	2	6	4470558	4470563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_016818	T	7	7	4472093	4472099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_016818	ACA	2	6	4472117	4472122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_016818	T	7	7	4478979	4478985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_016818	GAT	2	6	4480064	4480069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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