MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016818	AAT	2	6	218298	218303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016818	AATGAT	2	12	218318	218329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016818	TAT	2	6	218330	218335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016818	AGCC	2	8	218425	218432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_016818	T	9	9	218445	218453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016818	TG	3	6	218517	218522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016818	T	6	6	218623	218628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016818	A	6	6	219520	219525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016818	T	6	6	219544	219549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016818	CAA	2	6	219701	219706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016818	ATA	2	6	219724	219729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016818	T	6	6	223924	223929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016818	GACTA	2	10	223974	223983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
514	NC_016818	GAG	2	6	223995	224000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016818	CAAAAG	2	12	224717	224728	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_016818	T	6	6	224748	224753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016818	CAT	2	6	224755	224760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_016818	ATA	2	6	226041	226046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016818	TATT	2	8	226068	226075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016818	TCT	2	6	226235	226240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016818	TC	3	6	230439	230444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_016818	GCA	2	6	230452	230457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016818	CT	3	6	230494	230499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_016818	G	6	6	231577	231582	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016818	TGAAC	2	10	231641	231650	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_016818	GAG	2	6	233063	233068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016818	CTG	2	6	233713	233718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016818	GCGGTC	2	12	233724	233735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016818	ACA	2	6	233761	233766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_016818	GAA	2	6	233829	233834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016818	TCT	2	6	235204	235209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016818	A	6	6	235820	235825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016818	GCT	2	6	235843	235848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_016818	CTA	2	6	235888	235893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016818	GGT	2	6	235904	235909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016818	TTC	2	6	237152	237157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016818	ATCA	2	8	237209	237216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_016818	CT	3	6	237249	237254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_016818	TTC	2	6	237284	237289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016818	TAG	2	6	237320	237325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016818	TCA	2	6	237388	237393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016818	TAAT	2	8	237511	237518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016818	CTC	3	9	247054	247062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_016818	CTCC	2	8	247097	247104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
545	NC_016818	TGGGG	2	10	247122	247131	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016818	GAG	2	6	247218	247223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016818	TCC	2	6	248782	248787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_016818	ACAA	2	8	248846	248853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_016818	TGA	2	6	248887	248892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016818	AAG	2	6	248929	248934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016818	CAGG	2	8	248993	249000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_016818	TTG	2	6	250680	250685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016818	AGG	2	6	250753	250758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016818	A	7	7	250793	250799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016818	TGA	2	6	250828	250833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016818	GGGA	2	8	250863	250870	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016818	TAG	2	6	252156	252161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016818	T	6	6	252195	252200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016818	AAT	2	6	252644	252649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016818	AGGGA	2	10	252671	252680	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016818	ATT	2	6	253470	253475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016818	TCAA	2	8	253539	253546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_016818	AAT	2	6	253554	253559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016818	GCA	2	6	253567	253572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016818	GTGA	2	8	253623	253630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016818	TA	3	6	254793	254798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016818	T	6	6	254870	254875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016818	AAG	2	6	254882	254887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016818	T	6	6	254923	254928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016818	TAT	2	6	254933	254938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016818	ATA	2	6	254942	254947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016818	CTGA	2	8	254949	254956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_016818	AAT	2	6	255033	255038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016818	GC	3	6	256932	256937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_016818	GGGA	2	8	259696	259703	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016818	TCCCC	2	10	259718	259727	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
577	NC_016818	ATAG	2	8	259762	259769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016818	CAGA	2	8	259809	259816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_016818	G	6	6	264407	264412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016818	G	6	6	264463	264468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016818	A	7	7	264498	264504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016818	CTG	2	6	264535	264540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_016818	ACT	2	6	265148	265153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016818	GT	3	6	265207	265212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016818	AGC	2	6	265214	265219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_016818	CAGA	2	8	265939	265946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_016818	T	7	7	266748	266754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016818	TTA	2	6	266827	266832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016818	CTTT	2	8	266925	266932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_016818	TGC	2	6	267244	267249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_016818	T	6	6	267280	267285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016818	GCT	2	6	267412	267417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016818	TAAC	2	8	270081	270088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_016818	CTG	2	6	272164	272169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016818	A	7	7	272195	272201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016818	T	6	6	272231	272236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016818	AAG	2	6	273220	273225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016818	AAG	2	6	273871	273876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016818	T	6	6	274881	274886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016818	GAG	2	6	276337	276342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016818	GAT	2	6	276344	276349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016818	CGC	2	6	278998	279003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_016818	AAAAG	2	10	279502	279511	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016818	TGCC	2	8	279555	279562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_016818	TGAT	2	8	279591	279598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016818	A	6	6	279627	279632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016818	A	7	7	279640	279646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016818	TCG	2	6	279668	279673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016818	T	6	6	282039	282044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016818	A	6	6	282050	282055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016818	TCA	2	6	282096	282101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016818	CA	3	6	282650	282655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_016818	AAT	2	6	282733	282738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016818	GCG	2	6	282748	282753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016818	TAA	2	6	282768	282773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016818	CAA	2	6	282834	282839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016818	CGT	2	6	288874	288879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016818	CGG	2	6	288883	288888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016818	AT	3	6	295751	295756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016818	AATG	2	8	295782	295789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016818	AATT	2	8	295798	295805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016818	T	6	6	295804	295809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016818	AAATAA	2	12	296397	296408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016818	TCA	2	6	296453	296458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_016818	TAACT	2	10	296527	296536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
626	NC_016818	AT	4	8	296548	296555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016818	ATT	2	6	296565	296570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016818	TGG	2	6	296601	296606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016818	ATT	2	6	296633	296638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016818	ATAA	2	8	296662	296669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016818	TCATT	2	10	296688	296697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
632	NC_016818	GCG	2	6	296739	296744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016818	CAA	2	6	296754	296759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016818	CGG	2	6	296781	296786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_016818	AACC	2	8	296801	296808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_016818	CTC	2	6	296824	296829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_016818	TTG	2	6	296835	296840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016818	AT	3	6	296884	296889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016818	CTGT	2	8	296901	296908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
640	NC_016818	G	8	8	299049	299056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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