MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 9577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016639	TAA	2	6	219322	219327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016639	TA	3	6	219343	219348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016639	TAGC	2	8	219361	219368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_016639	GTT	2	6	219381	219386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016639	TAAA	2	8	219397	219404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016639	T	7	7	219405	219411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016639	TTA	2	6	219465	219470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016639	CTA	2	6	219496	219501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_016639	ATT	2	6	219516	219521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016639	GCC	2	6	219575	219580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_016639	ATT	2	6	219591	219596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016639	AGTT	2	8	219620	219627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016639	TAG	2	6	219628	219633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016639	AGT	2	6	219637	219642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016639	GTC	2	6	219659	219664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016639	TAA	2	6	219665	219670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016639	AT	4	8	219674	219681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016639	CTT	2	6	219712	219717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016639	TTTA	2	8	219725	219732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016639	CAGT	2	8	219787	219794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_016639	ATC	2	6	219860	219865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_016639	TA	3	6	219890	219895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016639	T	6	6	219982	219987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016639	A	6	6	219990	219995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016639	GTCAA	2	10	219997	220006	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1526	NC_016639	TAAA	2	8	220022	220029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016639	TA	3	6	220054	220059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016639	GT	3	6	221541	221546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016639	AAGGC	2	10	221549	221558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1530	NC_016639	GCT	2	6	222650	222655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_016639	TTG	2	6	222947	222952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016639	TG	3	6	222951	222956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016639	TAT	2	6	223022	223027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016639	CAA	2	6	223093	223098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016639	AAT	2	6	223110	223115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016639	CTA	2	6	223140	223145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_016639	ATT	2	6	226234	226239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016639	TA	3	6	226270	226275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016639	TA	3	6	226315	226320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016639	T	6	6	226324	226329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016639	A	6	6	226333	226338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016639	T	6	6	226346	226351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016639	TAC	2	6	226380	226385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_016639	TAATA	2	10	226490	226499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016639	TA	3	6	226503	226508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016639	A	6	6	226573	226578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016639	TAT	2	6	226591	226596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016639	TA	3	6	226606	226611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016639	A	7	7	226621	226627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016639	AAG	2	6	227003	227008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016639	TAA	2	6	227026	227031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016639	AAT	2	6	227086	227091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016639	CTT	2	6	227122	227127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_016639	ACA	2	6	227990	227995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016639	AT	3	6	227998	228003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016639	T	12	12	228014	228025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016639	ATTTA	2	10	228077	228086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016639	GTA	2	6	228117	228122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016639	TA	3	6	228121	228126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016639	TAAAT	2	10	228146	228155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016639	TATAT	2	10	229516	229525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016639	CAA	2	6	229690	229695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_016639	T	7	7	229819	229825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016639	AGT	2	6	229835	229840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016639	ATA	2	6	229841	229846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016639	TAAT	2	8	229876	229883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016639	A	6	6	229905	229910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016639	AAT	2	6	229928	229933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016639	AAGT	2	8	229990	229997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016639	TTC	2	6	230036	230041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_016639	GCT	2	6	230060	230065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016639	T	6	6	230136	230141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016639	TCT	2	6	230155	230160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_016639	AAAT	2	8	230253	230260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016639	CCG	2	6	230296	230301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_016639	TCC	2	6	230307	230312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_016639	TTA	2	6	230351	230356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016639	GA	3	6	230510	230515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016639	T	6	6	230588	230593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016639	ACA	2	6	230652	230657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_016639	TAA	2	6	230692	230697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016639	ATAG	2	8	230726	230733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016639	GGA	2	6	230736	230741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016639	TAAT	2	8	230761	230768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016639	TCT	2	6	230772	230777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_016639	TCA	3	9	230781	230789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_016639	ACA	2	6	230791	230796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016639	TAC	2	6	230870	230875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_016639	CT	3	6	230950	230955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_016639	ATA	2	6	230966	230971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016639	AGCT	2	8	230978	230985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_016639	TCT	2	6	230995	231000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_016639	AGA	2	6	231004	231009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_016639	CAA	2	6	231026	231031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_016639	ATTT	2	8	231134	231141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016639	T	6	6	231139	231144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016639	GAA	2	6	231231	231236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016639	TA	3	6	231271	231276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016639	T	6	6	231298	231303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016639	AGTC	2	8	231360	231367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_016639	ATA	2	6	231397	231402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016639	T	6	6	231481	231486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016639	A	6	6	231518	231523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016639	T	6	6	231608	231613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016639	T	6	6	231620	231625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016639	ATCC	2	8	231725	231732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_016639	TTCT	2	8	231806	231813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_016639	TCT	2	6	231897	231902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_016639	TA	3	6	231925	231930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016639	ATT	2	6	231938	231943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016639	A	6	6	231964	231969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016639	T	7	7	231988	231994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016639	ATT	2	6	231996	232001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016639	TAA	2	6	232003	232008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016639	ATTAA	2	10	232014	232023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016639	TTTA	2	8	232028	232035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016639	T	6	6	232141	232146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016639	TAA	2	6	232156	232161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016639	A	7	7	232192	232198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016639	A	6	6	232215	232220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016639	ATT	2	6	233451	233456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016639	ATT	2	6	233478	233483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016639	TAT	2	6	233486	233491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016639	A	6	6	233529	233534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016639	AT	3	6	233536	233541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016639	ATA	2	6	233612	233617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016639	TGA	2	6	233619	233624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016639	A	7	7	233628	233634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016639	AAT	3	9	233703	233711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016639	T	6	6	233726	233731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016639	GTG	2	6	233740	233745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016639	TAAT	2	8	233806	233813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016639	ATG	2	6	233859	233864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016639	AGAA	2	8	233873	233880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016639	TAA	2	6	233893	233898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_016639	TTA	2	6	233962	233967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_016639	CAT	3	9	233970	233978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1639	NC_016639	A	6	6	234027	234032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1914	NC_016639	GCT	2	6	265871	265876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1915	NC_016639	CTAC	2	8	265925	265932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1916	NC_016639	AGGAT	2	10	265934	265943	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_016639	A	8	8	266015	266022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1923	NC_016639	AAGGA	2	10	266156	266165	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1934	NC_016639	CTG	2	6	266531	266536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1945	NC_016639	TAG	2	6	266868	266873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1947	NC_016639	AAG	2	6	266942	266947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_016639	AGG	2	6	266948	266953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_016639	GAA	2	6	267061	267066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_016639	AT	3	6	267079	267084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_016639	TGC	2	6	267156	267161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1957	NC_016639	GGT	2	6	267265	267270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1974	NC_016639	TA	4	8	271067	271074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1975	NC_016639	T	6	6	273367	273372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_016639	AT	3	6	273394	273399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1977	NC_016639	A	7	7	273408	273414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1982	NC_016639	A	7	7	276197	276203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1989	NC_016639	CT	3	6	276787	276792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1998	NC_016639	CTA	2	6	277416	277421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1999	NC_016639	ACT	2	6	277424	277429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2000	NC_016639	AAAAT	2	10	277521	277530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

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