MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 9577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016639	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016639	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016639	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016639	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016639	GTT	2	6	1018	1023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016639	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016639	GTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016639	T	7	7	6086	6092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016639	CTT	2	6	6104	6109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016639	TCA	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016639	ATA	2	6	6131	6136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016639	TAA	2	6	6175	6180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016639	GAT	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016639	TA	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016639	AAC	3	9	6265	6273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016639	CAA	2	6	6316	6321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016639	T	7	7	6328	6334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016639	TCC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016639	TAAA	2	8	6655	6662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016639	TCT	2	6	7915	7920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016639	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016639	T	7	7	8002	8008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016639	GCT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016639	GAC	2	6	8042	8047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016639	CAA	3	9	8061	8069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016639	TA	3	6	9162	9167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016639	TAT	2	6	9179	9184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016639	CAA	2	6	9186	9191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016639	ATG	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016639	AGC	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016639	ATA	2	6	9279	9284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016639	CAA	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016639	A	7	7	9385	9391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016639	AAG	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016639	AATTA	2	10	9435	9444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016639	AT	3	6	9445	9450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016639	T	6	6	9459	9464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016639	T	6	6	9483	9488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016639	TAA	2	6	9541	9546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016639	TAA	2	6	9559	9564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016639	TAA	2	6	9807	9812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016639	AGA	2	6	9891	9896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016639	A	6	6	9967	9972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016639	GT	3	6	9993	9998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016639	TGA	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016639	TA	3	6	10094	10099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016639	A	6	6	10120	10125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016639	AGT	2	6	10136	10141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016639	TGG	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016639	AAT	2	6	10168	10173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016639	TGA	2	6	10191	10196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016639	GCA	2	6	10204	10209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016639	CCTC	2	8	10215	10222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_016639	ATA	2	6	10229	10234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016639	CAAT	2	8	10262	10269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016639	TAC	3	9	10323	10331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016639	TGT	2	6	10332	10337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016639	GTT	2	6	10388	10393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016639	TGA	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016639	ATA	2	6	10426	10431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016639	AAG	2	6	10468	10473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016639	TAA	2	6	10477	10482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016639	TAT	2	6	10578	10583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016639	AAC	2	6	10584	10589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016639	TTG	2	6	10692	10697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016639	AAT	2	6	10787	10792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016639	ATC	2	6	10823	10828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016639	GTT	2	6	10843	10848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016639	GTA	2	6	10930	10935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016639	ACT	2	6	10976	10981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016639	TTG	2	6	10991	10996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016639	CTT	2	6	11041	11046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016639	TAC	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016639	ATTA	2	8	11261	11268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016639	AAC	2	6	11316	11321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016639	ATT	2	6	11354	11359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016639	TAT	2	6	11370	11375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016639	T	6	6	11393	11398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016639	ATTA	2	8	11475	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016639	A	6	6	11487	11492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016639	TGG	2	6	11531	11536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016639	GAATT	2	10	11563	11572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016639	TTA	2	6	11747	11752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016639	ATA	2	6	11823	11828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016639	A	6	6	11865	11870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016639	TA	3	6	11903	11908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016639	AAT	2	6	11929	11934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016639	ATT	2	6	11943	11948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016639	TTA	2	6	11954	11959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016639	ATT	3	9	11973	11981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016639	T	6	6	12027	12032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016639	A	7	7	12060	12066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016639	A	6	6	12086	12091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016639	TTTA	2	8	12094	12101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016639	T	7	7	12115	12121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016639	AAT	2	6	12146	12151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016639	ATT	2	6	12208	12213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016639	AAT	2	6	12223	12228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016639	GCA	2	6	12240	12245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016639	TAA	2	6	12249	12254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016639	GCT	2	6	12266	12271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016639	T	6	6	12280	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016639	CTT	2	6	12480	12485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016639	AGC	2	6	12499	12504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016639	GATT	2	8	12536	12543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016639	AAAT	2	8	12544	12551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016639	T	6	6	12557	12562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016639	AATT	2	8	12571	12578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016639	CTT	2	6	12585	12590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016639	T	6	6	12589	12594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016639	AC	3	6	12617	12622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016639	TA	3	6	12654	12659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016639	TTC	2	6	12673	12678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016639	T	7	7	12708	12714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016639	TTA	2	6	12738	12743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016639	TTAA	2	8	12752	12759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016639	GTG	2	6	12837	12842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016639	TA	3	6	12915	12920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016639	TCG	2	6	12945	12950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016639	CGCTC	2	10	12987	12996	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_016639	TTA	2	6	13057	13062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016639	TTAG	2	8	15125	15132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016639	TAA	2	6	15137	15142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016639	GTT	2	6	15158	15163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016639	GAA	2	6	15176	15181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016639	TAACT	2	10	15375	15384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016639	TAG	2	6	15389	15394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016639	A	6	6	15448	15453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016639	TTG	2	6	18260	18265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016639	TG	3	6	18264	18269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016639	ATA	2	6	18322	18327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016639	A	7	7	18327	18333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016639	T	6	6	18349	18354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016639	GAC	2	6	18396	18401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016639	CA	3	6	18410	18415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016639	A	6	6	18447	18452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016639	TTA	2	6	18456	18461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016639	TTA	2	6	18466	18471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016639	TTA	2	6	18540	18545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016639	T	6	6	18553	18558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016639	A	6	6	18573	18578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016639	TAT	2	6	18579	18584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016639	A	6	6	18825	18830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016639	A	6	6	18838	18843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016639	CAG	2	6	18885	18890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016639	GGC	2	6	18910	18915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016639	TAT	3	9	18922	18930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016639	A	6	6	19018	19023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016639	AGTA	2	8	19062	19069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016639	ATTA	2	8	19087	19094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016639	ATG	2	6	19109	19114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016639	AAG	2	6	19121	19126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_016639	AT	3	6	19277	19282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016639	ATA	2	6	19296	19301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_016639	ATA	2	6	19358	19363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016639	TAAA	2	8	19367	19374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016639	GCA	2	6	19379	19384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_016639	AAT	2	6	19497	19502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016639	TAA	2	6	19513	19518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_016639	ATT	2	6	19692	19697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016639	TAAA	2	8	19720	19727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016639	GATA	2	8	19800	19807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_016639	T	6	6	19930	19935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_016639	T	6	6	19959	19964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016639	AT	3	6	20151	20156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_016639	TA	3	6	26372	26377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_016639	TAT	2	6	37551	37556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016639	TATT	2	8	37567	37574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016639	GTAA	2	8	37578	37585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016639	TCA	2	6	37590	37595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_016639	T	7	7	37651	37657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_016639	TTA	2	6	37672	37677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_016639	ATC	2	6	37688	37693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_016639	TAA	2	6	37702	37707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_016639	AAAGCT	2	12	45976	45987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
440	NC_016639	TAA	2	6	46156	46161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_016639	TAC	3	9	46180	46188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_016639	AAC	2	6	49059	49064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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