MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 10356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016050	TTA	2	6	529092	529097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016050	AGA	2	6	529157	529162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016050	A	6	6	529162	529167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016050	CAT	2	6	529273	529278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_016050	TTAATT	2	12	530152	530163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016050	AT	3	6	530183	530188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016050	GAA	2	6	530226	530231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016050	ATT	2	6	530269	530274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016050	ATC	2	6	530298	530303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_016050	GCT	2	6	530314	530319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_016050	T	6	6	530343	530348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016050	CTA	2	6	530383	530388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_016050	T	6	6	530453	530458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016050	AAT	2	6	530507	530512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016050	TAA	2	6	530515	530520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016050	T	6	6	530592	530597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016050	ATA	2	6	530599	530604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016050	CCTG	2	8	530610	530617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_016050	AAAG	2	8	530690	530697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016050	TGA	2	6	530816	530821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016050	AAT	2	6	531067	531072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016050	TATT	2	8	533934	533941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016050	ATT	3	9	533943	533951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016050	GTAA	2	8	533988	533995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016050	CTC	2	6	534050	534055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_016050	TAT	2	6	535332	535337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016050	ATA	2	6	535386	535391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016050	A	7	7	535391	535397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016050	T	6	6	535407	535412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016050	AAT	2	6	535484	535489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016050	TATT	2	8	535494	535501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016050	TCG	2	6	536502	536507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_016050	CAA	2	6	536552	536557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_016050	ACT	2	6	536566	536571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_016050	CA	3	6	536586	536591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_016050	TGTT	2	8	538206	538213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016050	TAT	2	6	538214	538219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016050	ATT	2	6	538333	538338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016050	TTGT	2	8	538350	538357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016050	CGT	2	6	538366	538371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_016050	CAA	2	6	538411	538416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_016050	TAT	2	6	538455	538460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016050	ATTTA	2	10	539007	539016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016050	T	6	6	539886	539891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016050	TA	3	6	540303	540308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016050	TAA	2	6	540335	540340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016050	TTA	2	6	540364	540369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016050	ATT	2	6	540387	540392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016050	GATA	2	8	540407	540414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016050	T	7	7	540426	540432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016050	ATTTT	2	10	540441	540450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016050	CAAT	2	8	541496	541503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_016050	TAA	2	6	541508	541513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016050	AAT	2	6	541529	541534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016050	TAA	2	6	541540	541545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016050	AAT	2	6	541547	541552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016050	GTG	2	6	541588	541593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016050	TGA	2	6	542285	542290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016050	T	6	6	542357	542362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016050	AATA	2	8	542396	542403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016050	ATT	2	6	542424	542429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016050	GAG	2	6	543134	543139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016050	ACA	2	6	543182	543187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_016050	ATTAA	2	10	543216	543225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016050	CAA	2	6	544655	544660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_016050	TAG	2	6	544667	544672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016050	CAA	2	6	544699	544704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_016050	TTTTA	2	10	546691	546700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016050	AT	3	6	546711	546716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016050	AGG	2	6	546753	546758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016050	A	6	6	547847	547852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016050	TAG	2	6	547895	547900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016050	GTC	2	6	548909	548914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_016050	TTG	2	6	548935	548940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016050	GTTT	2	8	548945	548952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016050	TGA	2	6	551627	551632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016050	ATA	2	6	551673	551678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016050	AAAT	2	8	551685	551692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016050	ATT	2	6	551701	551706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016050	TTA	2	6	551713	551718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016050	AT	3	6	551730	551735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016050	AATTTA	2	12	551737	551748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016050	ATAA	2	8	551749	551756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016050	TAT	2	6	551773	551778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016050	ATT	2	6	551779	551784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016050	TAT	2	6	551788	551793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016050	TAA	2	6	551821	551826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016050	ATA	2	6	551853	551858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016050	AAC	2	6	551868	551873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_016050	TAT	2	6	551929	551934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016050	AGA	2	6	552037	552042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_016050	TGT	2	6	552092	552097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016050	ATA	2	6	552117	552122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016050	ATG	2	6	552147	552152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016050	TAT	2	6	552909	552914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016050	TTC	2	6	552934	552939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_016050	T	7	7	553012	553018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016050	CGT	2	6	553041	553046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_016050	CTC	2	6	553058	553063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_016050	ATG	2	6	553067	553072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016050	GCA	2	6	553086	553091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_016050	ATT	3	9	554701	554709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016050	CAA	2	6	554740	554745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_016050	TCA	2	6	554820	554825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_016050	ACA	2	6	554862	554867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_016050	ATACT	2	10	554868	554877	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4107	NC_016050	ATAGCA	2	12	554885	554896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4108	NC_016050	CTC	2	6	554931	554936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_016050	TAA	2	6	554981	554986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016050	TAT	2	6	555001	555006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016050	TTTC	2	8	555042	555049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_016050	A	6	6	555100	555105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016050	TAGTTT	2	12	555116	555127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016050	CTT	2	6	555157	555162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_016050	CTG	2	6	555166	555171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_016050	ATC	2	6	555173	555178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_016050	ACT	2	6	555179	555184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_016050	AAT	2	6	555186	555191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016050	TAT	2	6	555254	555259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016050	TTAT	2	8	556248	556255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016050	TTA	2	6	556281	556286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016050	TAA	2	6	556327	556332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016050	TTA	2	6	556402	556407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016050	ATTT	2	8	556419	556426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016050	TTTAG	2	10	556508	556517	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016050	CAA	2	6	556536	556541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_016050	T	6	6	556597	556602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016050	TAA	2	6	556608	556613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016050	T	6	6	556657	556662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016050	TAA	2	6	556696	556701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016050	AAC	2	6	556707	556712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_016050	CTA	2	6	556716	556721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_016050	TTTA	2	8	556750	556757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_016050	ATA	2	6	556771	556776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4136	NC_016050	TAA	2	6	556840	556845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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