MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 6365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015966	CTG	2	6	287719	287724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015966	CAAAA	2	10	290875	290884	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
503	NC_015966	TGGA	2	8	292762	292769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015966	GCT	3	9	293488	293496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015966	GCC	3	9	295784	295792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_015966	ATCC	2	8	297604	297611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015966	TAA	2	6	297616	297621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015966	GGA	2	6	297952	297957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015966	CGC	2	6	297959	297964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_015966	GCG	2	6	301635	301640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015966	AAT	2	6	302901	302906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015966	ACG	2	6	302939	302944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015966	ACG	2	6	302964	302969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015966	CCG	2	6	303018	303023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_015966	GGGGT	2	10	303041	303050	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015966	GTG	2	6	304050	304055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015966	TTGCA	2	10	305041	305050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
518	NC_015966	GTT	2	6	305087	305092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015966	ACC	2	6	306826	306831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_015966	TTTTG	2	10	306878	306887	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015966	AAC	2	6	310776	310781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015966	GCC	2	6	310789	310794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_015966	A	6	6	310812	310817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015966	GCT	2	6	310844	310849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015966	GAG	2	6	310861	310866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015966	AGCGAA	2	12	311876	311887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
527	NC_015966	CAG	2	6	311933	311938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015966	A	7	7	312063	312069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015966	GCAG	2	8	312078	312085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
530	NC_015966	AGG	2	6	312090	312095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015966	A	6	6	312405	312410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015966	TGG	2	6	312420	312425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015966	TTG	2	6	312453	312458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015966	A	6	6	312471	312476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015966	TTTA	2	8	313399	313406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015966	AGG	2	6	313419	313424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015966	TATT	2	8	314173	314180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015966	GC	3	6	314241	314246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015966	CGG	2	6	314258	314263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015966	CTT	2	6	315784	315789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015966	ACCA	2	8	315812	315819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_015966	G	6	6	316068	316073	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015966	GGTG	2	8	319887	319894	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015966	CCG	2	6	319922	319927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_015966	TCCC	2	8	319958	319965	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
546	NC_015966	TGTT	2	8	320015	320022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015966	CGGG	2	8	320036	320043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
548	NC_015966	CGCTT	2	10	320044	320053	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
549	NC_015966	GCC	3	9	320079	320087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_015966	GCA	2	6	323216	323221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015966	TG	3	6	323227	323232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015966	ACC	2	6	323260	323265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_015966	GCC	2	6	324265	324270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_015966	TACA	2	8	324317	324324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_015966	A	9	9	324331	324339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015966	G	6	6	324422	324427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015966	AGC	2	6	324449	324454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015966	CG	3	6	326403	326408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_015966	CGAAGC	2	12	326451	326462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015966	TGG	2	6	328775	328780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015966	A	6	6	328800	328805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015966	ACC	2	6	330228	330233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_015966	AACAGC	2	12	331980	331991	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_015966	GGA	2	6	332030	332035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015966	CGA	2	6	332742	332747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015966	GA	3	6	332768	332773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015966	TG	3	6	332810	332815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015966	GGAC	2	8	332826	332833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
569	NC_015966	CGG	2	6	332862	332867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015966	CAC	2	6	332868	332873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_015966	A	7	7	336480	336486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015966	CGG	2	6	336493	336498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015966	GGACT	2	10	336544	336553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
574	NC_015966	CAG	2	6	336727	336732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015966	TG	3	6	336800	336805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015966	CAA	2	6	337712	337717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015966	CCCG	2	8	340158	340165	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
578	NC_015966	CGGG	2	8	340171	340178	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
579	NC_015966	T	6	6	340181	340186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015966	CGCC	2	8	343382	343389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
581	NC_015966	TTG	2	6	343415	343420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015966	CATAA	2	10	343464	343473	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
583	NC_015966	CGC	2	6	343513	343518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_015966	CTTC	2	8	343633	343640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_015966	CAA	2	6	345825	345830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015966	GCG	2	6	348065	348070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015966	GGC	2	6	348075	348080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_015966	GCC	2	6	348081	348086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_015966	GCCA	2	8	357463	357470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
590	NC_015966	CA	3	6	357559	357564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_015966	CCT	2	6	358226	358231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_015966	TGG	2	6	358238	358243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015966	GGGAT	2	10	358247	358256	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015966	CGG	2	6	358837	358842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015966	AAAT	2	8	358870	358877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015966	TTCGT	2	10	358891	358900	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
597	NC_015966	ACG	2	6	358972	358977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015966	CGTAT	2	10	359007	359016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
599	NC_015966	TGC	2	6	359065	359070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015966	GTG	2	6	359093	359098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015966	TCG	2	6	359146	359151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015966	GCA	2	6	360485	360490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015966	GTT	2	6	360493	360498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015966	GAG	2	6	361117	361122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015966	CGG	2	6	361150	361155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015966	ATCAT	2	10	361274	361283	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_015966	GAC	2	6	364498	364503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015966	CTAT	2	8	364517	364524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_015966	GTT	2	6	365305	365310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015966	A	6	6	366261	366266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015966	GAT	2	6	366272	366277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015966	TTC	2	6	367477	367482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015966	GCT	2	6	367504	367509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015966	CTG	3	9	370578	370586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015966	CGAG	2	8	370592	370599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_015966	GGA	2	6	370604	370609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015966	T	8	8	374368	374375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015966	AAG	2	6	374395	374400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015966	GAC	2	6	374455	374460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015966	A	10	10	379806	379815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015966	GCGG	2	8	381310	381317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
622	NC_015966	GCA	2	6	381322	381327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015966	GCA	2	6	381379	381384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015966	TCG	2	6	381399	381404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015966	GCA	2	6	381406	381411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015966	AGC	2	6	381414	381419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015966	CGC	2	6	381430	381435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_015966	TTAA	2	8	385060	385067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015966	AGA	2	6	385089	385094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015966	GC	3	6	385311	385316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_015966	GCA	2	6	385345	385350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015966	GGT	2	6	385404	385409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015966	GAC	2	6	385417	385422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_015966	CGGA	2	8	385460	385467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_015966	CGG	2	6	385499	385504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015966	ATC	2	6	385509	385514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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638	NC_015966	GAG	2	6	385574	385579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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