MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 6365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015966	T	7	7	2775797	2775803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_015966	CTT	2	6	2782842	2782847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_015966	TTTC	2	8	2784203	2784210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_015966	CGCC	2	8	2784257	2784264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5505	NC_015966	GTG	2	6	2784324	2784329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_015966	T	6	6	2784761	2784766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_015966	A	7	7	2784770	2784776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_015966	AAC	2	6	2787286	2787291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_015966	A	6	6	2787323	2787328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_015966	A	6	6	2787334	2787339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_015966	T	9	9	2787349	2787357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_015966	GAC	2	6	2787427	2787432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_015966	GACAC	2	10	2787463	2787472	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5514	NC_015966	TCGT	2	8	2787513	2787520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_015966	ATG	2	6	2787581	2787586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_015966	AGC	2	6	2791958	2791963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_015966	AGC	2	6	2792001	2792006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_015966	GCT	2	6	2792040	2792045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_015966	CCT	2	6	2794751	2794756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_015966	GAT	2	6	2794773	2794778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_015966	TA	3	6	2797880	2797885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_015966	CAA	2	6	2797948	2797953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_015966	ACC	2	6	2797954	2797959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_015966	ACG	2	6	2797972	2797977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_015966	A	7	7	2807482	2807488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_015966	CAAA	2	8	2808031	2808038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5527	NC_015966	AAAG	2	8	2808043	2808050	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_015966	AAC	2	6	2811408	2811413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_015966	GCC	2	6	2811429	2811434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_015966	CG	3	6	2811882	2811887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_015966	GCG	3	9	2811885	2811893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_015966	CG	3	6	2811892	2811897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_015966	CG	3	6	2811902	2811907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_015966	GAA	2	6	2818160	2818165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015966	GGC	2	6	2818211	2818216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_015966	AGA	2	6	2823220	2823225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_015966	CTT	2	6	2823269	2823274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_015966	ATT	2	6	2823285	2823290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_015966	ATGAT	2	10	2823314	2823323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_015966	ATA	2	6	2823327	2823332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_015966	GTCG	2	8	2825789	2825796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_015966	TCC	2	6	2828547	2828552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_015966	T	6	6	2828579	2828584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_015966	AGCA	2	8	2828609	2828616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_015966	CAA	2	6	2828696	2828701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_015966	CGG	2	6	2829120	2829125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_015966	CAG	2	6	2829141	2829146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_015966	C	6	6	2829163	2829168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5549	NC_015966	CCAG	2	8	2829173	2829180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_015966	GCC	2	6	2829214	2829219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_015966	GGCC	2	8	2829237	2829244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_015966	AGC	2	6	2829250	2829255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_015966	GC	3	6	2829346	2829351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_015966	A	7	7	2829400	2829406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_015966	CCG	2	6	2829410	2829415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_015966	CGT	2	6	2829468	2829473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015966	CAGC	2	8	2829534	2829541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_015966	AAGG	2	8	2829567	2829574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_015966	CCA	2	6	2829575	2829580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_015966	ACA	2	6	2829599	2829604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_015966	AAACAG	2	12	2829624	2829635	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5562	NC_015966	GCCC	2	8	2829663	2829670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5563	NC_015966	GCC	2	6	2829739	2829744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_015966	GGGT	2	8	2829755	2829762	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_015966	AC	3	6	2829788	2829793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_015966	CAG	2	6	2829801	2829806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_015966	GAC	2	6	2829890	2829895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_015966	CGG	2	6	2829932	2829937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_015966	GGA	2	6	2830028	2830033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_015966	TGG	2	6	2830130	2830135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_015966	CGA	2	6	2830139	2830144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_015966	TGC	2	6	2830156	2830161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_015966	CAC	2	6	2830182	2830187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_015966	TTC	2	6	2830191	2830196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_015966	CAT	2	6	2830200	2830205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_015966	CGGC	2	8	2830217	2830224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_015966	TGG	2	6	2830292	2830297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_015966	AAG	2	6	2830357	2830362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_015966	G	7	7	2830378	2830384	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015966	CGCGC	2	10	2833933	2833942	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5581	NC_015966	GAT	2	6	2835148	2835153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_015966	TCC	2	6	2836980	2836985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_015966	GGTT	2	8	2836986	2836993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_015966	AGC	2	6	2840041	2840046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_015966	CAC	2	6	2840049	2840054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_015966	GGT	2	6	2840061	2840066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_015966	TTTC	2	8	2840072	2840079	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_015966	CCT	2	6	2840155	2840160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_015966	TGAA	2	8	2840190	2840197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015966	CGG	2	6	2840249	2840254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_015966	CCG	2	6	2840326	2840331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_015966	AGG	2	6	2840427	2840432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015966	GCT	2	6	2840503	2840508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_015966	CTG	2	6	2844114	2844119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_015966	A	6	6	2844145	2844150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_015966	CGC	2	6	2844158	2844163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_015966	ACG	2	6	2844197	2844202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_015966	ATG	2	6	2845272	2845277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_015966	TCC	2	6	2851788	2851793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_015966	TCT	2	6	2851800	2851805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_015966	T	6	6	2851843	2851848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015966	AC	3	6	2851874	2851879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_015966	AAG	2	6	2853448	2853453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_015966	T	11	11	2854744	2854754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_015966	GAA	3	9	2854763	2854771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_015966	CCG	2	6	2854773	2854778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_015966	CGCC	2	8	2854788	2854795	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5608	NC_015966	GCCG	2	8	2855458	2855465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_015966	GCGAA	2	10	2855469	2855478	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5610	NC_015966	CAC	2	6	2855488	2855493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_015966	TAC	3	9	2855516	2855524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_015966	GGT	2	6	2855571	2855576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015966	CACC	2	8	2855643	2855650	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5614	NC_015966	ACGT	2	8	2855718	2855725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5615	NC_015966	CAG	2	6	2855746	2855751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_015966	CG	3	6	2855752	2855757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_015966	CGT	2	6	2855855	2855860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_015966	TGCT	2	8	2857009	2857016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_015966	GT	3	6	2857027	2857032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_015966	GAT	2	6	2857056	2857061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5622	NC_015966	AACC	2	8	2857228	2857235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_015966	CTG	2	6	2857246	2857251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_015966	ACG	2	6	2857261	2857266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_015966	TGGT	2	8	2857274	2857281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_015966	GCAA	2	8	2858194	2858201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5627	NC_015966	GAA	2	6	2858220	2858225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_015966	CCT	2	6	2858243	2858248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5629	NC_015966	CGG	2	6	2859071	2859076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_015966	TCT	2	6	2859133	2859138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_015966	CCG	2	6	2859151	2859156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5632	NC_015966	TGC	2	6	2867350	2867355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_015966	CTG	2	6	2867381	2867386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5634	NC_015966	AAC	2	6	2868767	2868772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5635	NC_015966	CGGGTT	2	12	2871105	2871116	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5636	NC_015966	GGTT	2	8	2872022	2872029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5637	NC_015966	AC	3	6	2873868	2873873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5638	NC_015966	GGC	2	6	2873874	2873879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5639	NC_015966	GCCG	2	8	2873885	2873892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5640	NC_015966	ACG	2	6	2873966	2873971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5641	NC_015966	GCCG	2	8	2874012	2874019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5642	NC_015966	TCT	2	6	2874024	2874029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5643	NC_015966	GTC	2	6	2875133	2875138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5644	NC_015966	GGCC	2	8	2876442	2876449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5645	NC_015966	G	6	6	2879718	2879723	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5646	NC_015966	A	7	7	2879741	2879747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5647	NC_015966	GGA	2	6	2881146	2881151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5648	NC_015966	TTGG	2	8	2884100	2884107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5649	NC_015966	TGGT	2	8	2884123	2884130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5650	NC_015966	A	6	6	2884206	2884211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5651	NC_015966	CTT	2	6	2884271	2884276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5653	NC_015966	A	6	6	2886188	2886193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_015966	CG	3	6	2887240	2887245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5655	NC_015966	ACA	2	6	2888008	2888013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5658	NC_015966	TAC	2	6	2890902	2890907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5661	NC_015966	GC	3	6	2890968	2890973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5662	NC_015966	GTGC	2	8	2891042	2891049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5663	NC_015966	CGTT	2	8	2892011	2892018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5664	NC_015966	GCG	2	6	2892071	2892076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5665	NC_015966	G	6	6	2892076	2892081	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5666	NC_015966	CCG	2	6	2892092	2892097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5667	NC_015966	T	6	6	2892098	2892103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5668	NC_015966	AGC	2	6	2892119	2892124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5670	NC_015966	GAAA	2	8	2894924	2894931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5671	NC_015966	GCTT	2	8	2894994	2895001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5672	NC_015966	GCCG	2	8	2895079	2895086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5673	NC_015966	CG	3	6	2895096	2895101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5674	NC_015966	CGA	2	6	2895115	2895120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5676	NC_015966	AGCG	2	8	2895202	2895209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5677	NC_015966	GTG	2	6	2895215	2895220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5678	NC_015966	GCTCGT	2	12	2895233	2895244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5680	NC_015966	AGC	2	6	2898746	2898751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5681	NC_015966	AG	3	6	2898752	2898757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5684	NC_015966	TCG	2	6	2901871	2901876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5686	NC_015966	T	6	6	2901949	2901954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5688	NC_015966	A	6	6	2902071	2902076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5689	NC_015966	CTG	2	6	2902125	2902130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5693	NC_015966	TCT	2	6	2902255	2902260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5763	NC_015966	CGAG	2	8	2920650	2920657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5769	NC_015966	T	6	6	2927430	2927435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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