MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 8033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015866	TTA	2	6	2	7	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015866	ATA	2	6	22	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015866	AT	3	6	29	34	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015866	TTA	2	6	35	40	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015866	TGT	2	6	43	48	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015866	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015866	ATT	3	9	141	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015866	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015866	TATT	2	8	269	276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015866	TAA	2	6	307	312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015866	ATA	2	6	351	356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015866	TTA	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015866	A	6	6	364	369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015866	ATT	2	6	1228	1233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015866	TTTA	2	8	1261	1268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015866	TGT	2	6	1281	1286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015866	AT	3	6	1289	1294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015866	ATTT	2	8	1643	1650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015866	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015866	TAA	2	6	6654	6659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015866	CTT	2	6	6674	6679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015866	GTT	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015866	AT	4	8	6709	6716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015866	T	6	6	6743	6748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015866	TTAT	2	8	6780	6787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015866	TCC	2	6	6829	6834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015866	TAAA	2	8	6878	6885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015866	TCT	2	6	8138	8143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015866	GAA	2	6	8168	8173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015866	AAT	2	6	8181	8186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015866	T	7	7	8235	8241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015866	GAC	2	6	8269	8274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015866	CAA	3	9	8288	8296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015866	TA	3	6	9389	9394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015866	CAA	2	6	9582	9587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015866	TTA	2	6	9636	9641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015866	AAG	2	6	9708	9713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015866	AATTA	2	10	9714	9723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015866	AT	3	6	9724	9729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015866	TAA	2	6	9774	9779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015866	TAA	2	6	9792	9797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015866	AGT	2	6	9945	9950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015866	GGT	2	6	9961	9966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015866	GCT	2	6	9973	9978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015866	GAA	2	6	10006	10011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015866	TAA	2	6	10041	10046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015866	AGA	2	6	10121	10126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015866	A	6	6	10197	10202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015866	GT	3	6	10223	10228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015866	TGA	2	6	10279	10284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015866	TA	3	6	10324	10329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015866	A	6	6	10344	10349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015866	AGT	2	6	10360	10365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015866	TGG	2	6	10381	10386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015866	AAT	2	6	10394	10399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015866	TGA	2	6	10415	10420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015866	GCA	2	6	10428	10433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015866	CCTC	2	8	10439	10446	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_015866	ATA	2	6	10453	10458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015866	CAAT	2	8	10486	10493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015866	TAC	3	9	10547	10555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015866	GTT	2	6	10612	10617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015866	TGA	2	6	10646	10651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015866	ATA	2	6	10654	10659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015866	TAA	2	6	10705	10710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015866	TAT	2	6	10804	10809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015866	AAC	2	6	10810	10815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015866	TTG	2	6	10918	10923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015866	ACT	2	6	11170	11175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015866	TTG	2	6	11185	11190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015866	TAGCT	2	10	11227	11236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015866	TAT	2	6	11317	11322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015866	T	7	7	11338	11344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015866	TTA	2	6	11360	11365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015866	AGAAT	2	10	11402	11411	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015866	A	6	6	11423	11428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015866	CAT	2	6	11436	11441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015866	ATTA	2	8	11455	11462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015866	AAC	2	6	11510	11515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015866	ATT	2	6	11548	11553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015866	TAT	2	6	11564	11569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015866	ATTA	2	8	11669	11676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015866	A	6	6	11681	11686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015866	TGG	2	6	11725	11730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015866	GAATT	2	10	11757	11766	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015866	AGA	2	6	11826	11831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015866	GAT	2	6	11837	11842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015866	CCA	2	6	11848	11853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015866	T	6	6	11877	11882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015866	CAT	2	6	11902	11907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015866	TTA	2	6	11941	11946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015866	ATA	2	6	12016	12021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015866	A	6	6	12058	12063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015866	T	6	6	12097	12102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015866	AAT	2	6	12128	12133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015866	ATT	2	6	12142	12147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015866	TTA	2	6	12153	12158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015866	TAT	3	9	12171	12179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015866	TA	3	6	12780	12785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015866	TCG	2	6	12810	12815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015866	CGCTC	2	10	12852	12861	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_015866	TTA	2	6	12922	12927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015866	TTAG	2	8	14995	15002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015866	TAA	2	6	15007	15012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015866	GTT	2	6	15028	15033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015866	GAA	2	6	15046	15051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015866	GCAA	2	8	15093	15100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015866	A	6	6	15099	15104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015866	T	6	6	15120	15125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015866	AG	3	6	15135	15140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015866	T	6	6	15147	15152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015866	TCTT	2	8	15170	15177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015866	ATG	2	6	15191	15196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015866	ATT	2	6	15210	15215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015866	TAACT	2	10	15245	15254	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015866	TAG	2	6	15259	15264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015866	A	6	6	15318	15323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015866	ATA	2	6	16484	16489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015866	GCTT	2	8	16574	16581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015866	TTG	2	6	18124	18129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015866	AGT	2	6	18141	18146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015866	ATA	2	6	18185	18190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015866	T	6	6	18198	18203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015866	CAA	2	6	18265	18270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015866	AAAACA	2	12	18290	18301	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015866	T	8	8	18363	18370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015866	A	6	6	18371	18376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015866	TTA	2	6	18380	18385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015866	TTA	2	6	18390	18395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015866	TTA	2	6	18464	18469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015866	T	6	6	18477	18482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015866	A	6	6	18942	18947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015866	AAC	2	6	18960	18965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015866	AGTA	2	8	18986	18993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015866	ATTA	2	8	19011	19018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015866	ATG	2	6	19033	19038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015866	AAG	2	6	19045	19050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015866	AATA	2	8	19055	19062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015866	CTTT	2	8	19100	19107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015866	TA	3	6	19837	19842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015866	T	6	6	19886	19891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015866	TAC	2	6	19911	19916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015866	TCC	2	6	19920	19925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015866	TGA	2	6	19970	19975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015866	AAT	2	6	20045	20050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015866	AGTA	2	8	20056	20063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015866	AT	3	6	20074	20079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015866	AAAC	2	8	20106	20113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015866	A	6	6	20116	20121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015866	ATT	2	6	20169	20174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015866	TA	3	6	20194	20199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015866	ATTT	2	8	20213	20220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015866	TA	3	6	20242	20247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015866	TTTAA	2	10	20252	20261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015866	TA	3	6	25971	25976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015866	AT	3	6	26025	26030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015866	CTTA	2	8	26039	26046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_015866	ACC	2	6	26079	26084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_015866	TATAA	2	10	26142	26151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015866	AAT	2	6	26159	26164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_015866	ATA	2	6	26201	26206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015866	ATG	2	6	26218	26223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015866	AGTTC	2	10	26251	26260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_015866	TAT	2	6	26267	26272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_015866	GAT	2	6	28793	28798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015866	GTA	2	6	28865	28870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_015866	AT	3	6	41951	41956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_015866	TCG	3	9	41966	41974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_015866	TTATT	2	10	41979	41988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_015866	GTT	2	6	42470	42475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_015866	T	7	7	42474	42480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_015866	TAA	2	6	42484	42489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015866	A	6	6	42499	42504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015866	TAA	2	6	42517	42522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015866	ATTA	2	8	42523	42530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015866	GAT	2	6	42578	42583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015866	AT	3	6	42593	42598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015866	TAT	2	6	42614	42619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015866	AAAT	2	8	42620	42627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_015866	TA	3	6	43839	43844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015866	AT	3	6	43853	43858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_015866	TTC	3	9	49950	49958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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