MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 8033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015866	CCA	2	6	823800	823805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_015866	A	6	6	824298	824303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015866	TGA	3	9	824305	824313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015866	CAT	2	6	824330	824335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_015866	GAC	2	6	824381	824386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015866	TTG	2	6	824438	824443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015866	AAT	2	6	824452	824457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015866	AGA	2	6	824487	824492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015866	TTAA	2	8	824520	824527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015866	T	7	7	824552	824558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_015866	TTTA	2	8	824626	824633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015866	TAA	2	6	824641	824646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_015866	AT	3	6	824694	824699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_015866	TAC	2	6	824749	824754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_015866	AAT	2	6	824774	824779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_015866	TAC	2	6	824799	824804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_015866	ATA	2	6	824844	824849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015866	ACT	2	6	825023	825028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_015866	CAC	2	6	825067	825072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_015866	TC	3	6	825133	825138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_015866	ATC	2	6	825153	825158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_015866	AAC	2	6	825163	825168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_015866	ATT	2	6	825228	825233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015866	TTG	2	6	825244	825249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015866	CTT	2	6	825267	825272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_015866	TATT	2	8	825317	825324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_015866	TTC	2	6	825334	825339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_015866	CAA	2	6	825393	825398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_015866	TTA	2	6	825401	825406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_015866	TCT	2	6	825416	825421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_015866	A	6	6	825422	825427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015866	A	6	6	825448	825453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015866	ATAA	2	8	825467	825474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015866	GTT	2	6	825486	825491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015866	TCTCT	2	10	825504	825513	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5036	NC_015866	AAC	2	6	825535	825540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_015866	GCAG	2	8	825569	825576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_015866	ATA	2	6	825591	825596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015866	AAT	2	6	825647	825652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015866	TAC	2	6	825664	825669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_015866	AGC	2	6	825673	825678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_015866	AGG	2	6	825745	825750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015866	TCA	2	6	825776	825781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_015866	CTAAA	2	10	825810	825819	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_015866	CAA	2	6	825831	825836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_015866	GAT	2	6	825879	825884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015866	AATA	2	8	825900	825907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_015866	TGT	2	6	825958	825963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015866	ATC	2	6	825997	826002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_015866	CTT	2	6	826008	826013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_015866	TAAT	2	8	826023	826030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015866	AGC	2	6	826082	826087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_015866	GCA	2	6	826113	826118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_015866	TCT	2	6	826248	826253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_015866	ACG	2	6	826268	826273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_015866	CAT	2	6	826361	826366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_015866	TTG	2	6	826410	826415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015866	TTC	2	6	826446	826451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015866	T	7	7	826455	826461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015866	AT	3	6	826486	826491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015866	TGC	2	6	826530	826535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_015866	AGC	2	6	826563	826568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_015866	AGC	2	6	826572	826577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_015866	TATT	2	8	826580	826587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_015866	TTTAT	2	10	826617	826626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_015866	TA	3	6	826639	826644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015866	AAC	2	6	826660	826665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_015866	ATT	2	6	826698	826703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_015866	TGTT	2	8	826715	826722	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015866	TAA	3	9	826736	826744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_015866	TAAA	2	8	826757	826764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015866	ACTT	2	8	826766	826773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_015866	GCA	2	6	826796	826801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_015866	TGG	2	6	826850	826855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_015866	CTG	2	6	826881	826886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_015866	TA	3	6	826907	826912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_015866	TCT	2	6	826933	826938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_015866	ATT	3	9	827031	827039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_015866	TTAA	2	8	827057	827064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_015866	T	7	7	827109	827115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015866	ATG	2	6	827119	827124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015866	TTA	2	6	827130	827135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015866	TTAG	2	8	827148	827155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015866	ATA	2	6	827163	827168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_015866	T	6	6	827169	827174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_015866	A	6	6	827251	827256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015866	A	6	6	827458	827463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015866	TAA	2	6	827508	827513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_015866	TTA	2	6	827516	827521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_015866	TA	3	6	827547	827552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015866	TGA	2	6	827553	827558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015866	ATG	2	6	827573	827578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015866	AAG	2	6	827579	827584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015866	TTA	2	6	827599	827604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_015866	A	7	7	827828	827834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015866	AAT	2	6	827852	827857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015866	ATA	2	6	827950	827955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015866	TAT	2	6	828062	828067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_015866	AAT	2	6	828070	828075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015866	TAA	2	6	828103	828108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015866	TTTA	2	8	828116	828123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015866	AT	3	6	828157	828162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015866	TAA	2	6	828164	828169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_015866	ATA	2	6	828190	828195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015866	TTA	2	6	828202	828207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015866	AAT	2	6	828208	828213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_015866	CTAAT	2	10	828286	828295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5110	NC_015866	GTT	2	6	829048	829053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015866	ATA	2	6	829063	829068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015866	TCTA	2	8	829086	829093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_015866	TA	3	6	829110	829115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015866	TAA	2	6	829168	829173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015866	A	7	7	829210	829216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_015866	TGTT	2	8	829227	829234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_015866	T	6	6	829233	829238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015866	ATA	2	6	829262	829267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_015866	ATT	2	6	829318	829323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_015866	GAA	2	6	829359	829364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015866	TAA	2	6	829376	829381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015866	AAG	2	6	829677	829682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_015866	TAT	2	6	830271	830276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015866	TAC	2	6	830327	830332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_015866	TAA	2	6	831491	831496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_015866	TAT	2	6	831500	831505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015866	T	6	6	831529	831534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015866	AATA	2	8	831546	831553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015866	T	6	6	831561	831566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015866	TTAA	2	8	831590	831597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_015866	AGA	2	6	831610	831615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_015866	AT	3	6	831618	831623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_015866	AT	3	6	831672	831677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_015866	TA	5	10	831692	831701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_015866	AT	3	6	831747	831752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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