MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	ATTG	2	8	26	33	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015705	T	6	6	65	70	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015705	TAC	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015705	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015705	GCC	2	6	203	208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015705	T	6	6	1528	1533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015705	GCA	2	6	1567	1572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015705	TCAA	2	8	1574	1581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015705	TCCA	2	8	1606	1613	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015705	AAG	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015705	TTTC	2	8	1696	1703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015705	A	6	6	1718	1723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015705	GTTT	2	8	1760	1767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015705	TAATG	2	10	1829	1838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015705	A	6	6	1885	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015705	GCC	2	6	1893	1898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015705	T	6	6	1958	1963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015705	CGC	2	6	1969	1974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015705	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015705	TGTAT	2	10	3492	3501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015705	ATACA	2	10	3522	3531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015705	TTC	2	6	3975	3980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015705	ATC	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015705	AGAAAC	2	12	4060	4071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_015705	GCG	2	6	4205	4210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015705	CTG	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015705	GCCGAT	2	12	4295	4306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015705	T	6	6	4316	4321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015705	GGC	2	6	4334	4339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015705	GTT	2	6	4390	4395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015705	A	7	7	4441	4447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015705	CGTG	2	8	4453	4460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015705	GCT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015705	TAC	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015705	CTG	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015705	TTTC	2	8	4607	4614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015705	TCT	2	6	4747	4752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015705	TGA	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015705	GCT	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015705	ATT	2	6	4898	4903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015705	TAG	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015705	TA	3	6	4952	4957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015705	ACA	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015705	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015705	TAT	2	6	5084	5089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015705	A	6	6	5094	5099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015705	ATTC	2	8	5112	5119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015705	TAC	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015705	T	6	6	6193	6198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015705	CAAC	2	8	6199	6206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015705	TAC	2	6	6216	6221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015705	A	6	6	6245	6250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015705	T	6	6	6278	6283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015705	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015705	A	7	7	6301	6307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015705	TGT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015705	AAT	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015705	ACTG	2	8	6373	6380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015705	TAT	2	6	6403	6408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015705	TAC	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015705	TAC	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015705	TAT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015705	TAC	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015705	TAC	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015705	TAT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015705	TAC	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015705	TAC	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015705	A	7	7	6621	6627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015705	T	6	6	6642	6647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015705	T	6	6	8067	8072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015705	AAC	2	6	8179	8184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015705	ACC	2	6	8216	8221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015705	CGTA	2	8	8229	8236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015705	CCA	2	6	8243	8248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015705	ATT	2	6	8263	8268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015705	CTT	2	6	8292	8297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015705	CAT	2	6	8320	8325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015705	GCTTC	2	10	8330	8339	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015705	T	6	6	8346	8351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015705	CAGG	2	8	8384	8391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015705	TAG	2	6	8396	8401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015705	CCG	2	6	8409	8414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015705	ATG	2	6	8420	8425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015705	GCC	3	9	8485	8493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015705	TGA	3	9	8507	8515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015705	ATA	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015705	TGC	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015705	AGGC	2	8	11661	11668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015705	TTA	2	6	15980	15985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015705	CAA	2	6	16009	16014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015705	A	6	6	17024	17029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015705	T	7	7	18517	18523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015705	CAG	2	6	18585	18590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015705	A	6	6	18618	18623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015705	TCAG	2	8	18631	18638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015705	T	8	8	18685	18692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015705	CTTTT	2	10	18983	18992	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015705	A	8	8	19049	19056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015705	ACCG	2	8	19089	19096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015705	A	6	6	19160	19165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015705	TGT	2	6	20642	20647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015705	ATGA	2	8	20660	20667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015705	GTAAAG	2	12	20672	20683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015705	TGA	2	6	21558	21563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015705	TCCGT	2	10	21599	21608	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015705	T	6	6	21642	21647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015705	GTA	2	6	21651	21656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015705	GA	3	6	21676	21681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015705	TTA	2	6	21750	21755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015705	CAA	2	6	21873	21878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015705	ATC	2	6	21879	21884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015705	GAA	2	6	21925	21930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015705	TCC	2	6	21946	21951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015705	T	6	6	21983	21988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015705	CGA	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015705	ATA	2	6	22071	22076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015705	T	6	6	22243	22248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015705	AAAAG	2	10	22350	22359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015705	ATG	2	6	22411	22416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015705	A	6	6	22470	22475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015705	T	6	6	22552	22557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015705	CTTT	2	8	22590	22597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015705	T	6	6	22723	22728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015705	ATT	2	6	22774	22779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015705	AT	3	6	23192	23197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015705	A	6	6	23238	23243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015705	TCTT	2	8	23270	23277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015705	A	6	6	23370	23375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015705	TCAA	2	8	23380	23387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015705	AGT	2	6	24217	24222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015705	TC	3	6	26789	26794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015705	GGC	2	6	26804	26809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015705	CCT	2	6	26812	26817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015705	TTC	2	6	26824	26829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015705	A	7	7	26847	26853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015705	TTTA	2	8	29997	30004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015705	T	6	6	32464	32469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015705	TCG	2	6	35544	35549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015705	AACT	2	8	35568	35575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015705	T	6	6	35586	35591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015705	AC	3	6	35593	35598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015705	CTTTG	2	10	35619	35628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015705	AAC	2	6	35677	35682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015705	CTG	2	6	35690	35695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015705	AT	5	10	35700	35709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015705	GTT	2	6	35712	35717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015705	ACTT	2	8	37307	37314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015705	A	6	6	37994	37999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015705	TAAAA	2	10	38025	38034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015705	ACT	2	6	41832	41837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015705	ATTGAA	2	12	41840	41851	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015705	GTGAAT	2	12	43237	43248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015705	AAC	2	6	43324	43329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015705	CAA	2	6	43658	43663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015705	T	6	6	43733	43738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015705	AAT	2	6	43769	43774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015705	TAAT	2	8	43816	43823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015705	TAA	2	6	43826	43831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015705	AATA	2	8	44468	44475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015705	A	6	6	44529	44534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015705	TTTC	2	8	44550	44557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_015705	CTTTT	2	10	44585	44594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_015705	ATT	2	6	44597	44602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015705	TTC	2	6	44603	44608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015705	GAA	3	9	44634	44642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015705	ATAA	2	8	44746	44753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.