MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 17507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015703	A	7	7	213115	213121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015703	A	7	7	213164	213170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015703	A	6	6	213192	213197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015703	AAC	2	6	213209	213214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015703	GAG	2	6	213691	213696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015703	CAG	2	6	213705	213710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015703	CTC	2	6	213724	213729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_015703	A	6	6	213757	213762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015703	GAAC	2	8	216283	216290	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_015703	TCT	2	6	216319	216324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015703	TAG	2	6	216353	216358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015703	T	7	7	218703	218709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015703	ATA	2	6	218746	218751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015703	ATA	2	6	218777	218782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015703	TGT	2	6	218881	218886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015703	ATC	2	6	218903	218908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015703	TTA	2	6	218971	218976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015703	TTGG	2	8	221600	221607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015703	A	7	7	221634	221640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015703	T	6	6	221653	221658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015703	AAT	2	6	221712	221717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015703	A	7	7	222044	222050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015703	T	6	6	222075	222080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015703	AGT	2	6	222091	222096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015703	TCA	2	6	223933	223938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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527	NC_015703	TCT	2	6	224718	224723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015703	ATA	2	6	225452	225457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015703	GTTT	2	8	225467	225474	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015703	T	6	6	225482	225487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015703	TCAC	2	8	225525	225532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_015703	AAT	2	6	225636	225641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015703	AAAG	2	8	225643	225650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015703	T	8	8	225663	225670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015703	GAT	2	6	225696	225701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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538	NC_015703	GCAT	2	8	227099	227106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_015703	ATT	2	6	227109	227114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015703	GGC	2	6	227154	227159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015703	GT	3	6	227161	227166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015703	CAA	2	6	227175	227180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015703	CGG	2	6	227220	227225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015703	ATC	2	6	227229	227234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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547	NC_015703	TGA	2	6	227254	227259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_015703	CAGG	2	8	227333	227340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
550	NC_015703	AAT	2	6	228093	228098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015703	GA	3	6	228140	228145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015703	A	7	7	228196	228202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015703	GC	3	6	228214	228219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_015703	GT	4	8	228235	228242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015703	A	7	7	228267	228273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015703	AATA	2	8	228309	228316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015703	ATTT	2	8	228321	228328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015703	T	6	6	228326	228331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015703	ATT	2	6	228370	228375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015703	TACA	2	8	228412	228419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_015703	A	9	9	228430	228438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015703	T	6	6	228473	228478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015703	TAGA	2	8	228486	228493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015703	TAC	2	6	228539	228544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015703	AAAC	2	8	228552	228559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
566	NC_015703	T	6	6	231294	231299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015703	TGTTTG	2	12	231337	231348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015703	CAG	2	6	231349	231354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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571	NC_015703	GTTC	2	8	231499	231506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_015703	GGTT	2	8	231517	231524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015703	AC	3	6	233088	233093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_015703	AGA	2	6	233101	233106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015703	CTT	2	6	233127	233132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_015703	GTT	2	6	236119	236124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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584	NC_015703	AAGT	2	8	237403	237410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_015703	ATG	2	6	237466	237471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015703	A	7	7	237472	237478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015703	TAT	3	9	238061	238069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015703	CTTTG	2	10	238093	238102	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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592	NC_015703	TGTC	2	8	238130	238137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_015703	ATT	2	6	238154	238159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015703	AT	3	6	238194	238199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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604	NC_015703	GGGAG	2	10	240448	240457	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015703	CCGTC	2	10	240479	240488	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
606	NC_015703	ACC	2	6	240494	240499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_015703	ATC	2	6	240522	240527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015703	CAA	2	6	240575	240580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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610	NC_015703	ATT	2	6	240611	240616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015703	TGGAA	2	10	240622	240631	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015703	TTAA	2	8	240632	240639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015703	CAC	2	6	240690	240695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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621	NC_015703	GTA	2	6	241440	241445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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624	NC_015703	CGT	2	6	241704	241709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015703	TACGG	2	10	241886	241895	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
626	NC_015703	CTTCG	2	10	241946	241955	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
627	NC_015703	CTG	2	6	242050	242055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015703	GCCTTC	2	12	242069	242080	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
629	NC_015703	TTGA	2	8	242106	242113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015703	GT	3	6	242141	242146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015703	ACAT	2	8	242156	242163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_015703	CCA	2	6	242202	242207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_015703	ATCGC	2	10	242261	242270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
634	NC_015703	TAT	2	6	242296	242301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015703	CGCC	2	8	242305	242312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
636	NC_015703	GCT	2	6	242354	242359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015703	TA	3	6	242414	242419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015703	GTT	2	6	242446	242451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015703	CTG	2	6	242489	242494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015703	TCC	2	6	242699	242704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_015703	CTG	2	6	242760	242765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_015703	TCGCTT	2	12	242792	242803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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773	NC_015703	A	6	6	273074	273079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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