MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015061	GGT	2	6	1641946	1641951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015061	GGT	2	6	1641972	1641977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015061	TAAT	2	8	1641986	1641993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015061	GA	3	6	1642039	1642044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015061	TAA	2	6	1642091	1642096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015061	TAT	2	6	1642183	1642188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015061	CG	3	6	1642191	1642196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_015061	CAG	3	9	1642245	1642253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_015061	A	7	7	1642295	1642301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015061	TG	3	6	1644201	1644206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015061	ATT	2	6	1644270	1644275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015061	AGG	2	6	1644295	1644300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015061	GTC	2	6	1644340	1644345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015061	GAT	2	6	1644376	1644381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_015061	ACT	2	6	1644400	1644405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015061	GTG	2	6	1644425	1644430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_015061	AGA	2	6	1645610	1645615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015061	T	7	7	1646958	1646964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015061	GAA	2	6	1647827	1647832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015061	T	8	8	1647858	1647865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015061	CGC	2	6	1647871	1647876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_015061	AAC	2	6	1647901	1647906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015061	CAG	2	6	1647913	1647918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015061	G	6	6	1649641	1649646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015061	T	8	8	1650046	1650053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015061	CTT	2	6	1650143	1650148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_015061	TGA	2	6	1650184	1650189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_015061	GCT	2	6	1650229	1650234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_015061	TTTC	2	8	1652512	1652519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_015061	AAT	2	6	1655383	1655388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015061	TATG	2	8	1655458	1655465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015061	TCC	2	6	1655484	1655489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_015061	GAT	2	6	1655509	1655514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015061	TCC	2	6	1655541	1655546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_015061	TGA	2	6	1655845	1655850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015061	AAC	2	6	1655856	1655861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_015061	CAG	2	6	1655880	1655885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_015061	CCG	2	6	1655894	1655899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_015061	AGT	2	6	1655966	1655971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015061	T	6	6	1655999	1656004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015061	A	7	7	1656007	1656013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015061	AAT	2	6	1656044	1656049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015061	A	6	6	1656050	1656055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015061	GT	3	6	1656056	1656061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015061	AAAG	2	8	1656075	1656082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015061	TGT	2	6	1656315	1656320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015061	GTTGA	2	10	1656326	1656335	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_015061	TGC	2	6	1656382	1656387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_015061	GAT	2	6	1657668	1657673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015061	GAT	2	6	1657718	1657723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015061	A	7	7	1657785	1657791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015061	CTC	2	6	1657822	1657827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_015061	T	6	6	1657836	1657841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_015061	CTT	2	6	1657858	1657863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_015061	GGA	2	6	1657876	1657881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015061	TGAG	2	8	1657882	1657889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015061	GCG	2	6	1657904	1657909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015061	TGT	2	6	1657934	1657939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015061	T	6	6	1657951	1657956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015061	GGA	2	6	1657996	1658001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015061	CA	3	6	1658945	1658950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_015061	TCA	2	6	1658997	1659002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_015061	TTTG	2	8	1659059	1659066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015061	TCA	2	6	1659099	1659104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_015061	A	6	6	1660836	1660841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015061	GAT	2	6	1660869	1660874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015061	CAT	2	6	1660930	1660935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_015061	ATAA	2	8	1668241	1668248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015061	TGC	2	6	1668372	1668377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_015061	TTTA	2	8	1668430	1668437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015061	A	7	7	1668501	1668507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015061	TA	3	6	1668518	1668523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_015061	TCAGA	2	10	1670574	1670583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4074	NC_015061	CT	3	6	1670596	1670601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_015061	TG	3	6	1671174	1671179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015061	TAAT	2	8	1671180	1671187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015061	CAA	2	6	1671890	1671895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_015061	A	6	6	1671894	1671899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015061	T	6	6	1671929	1671934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015061	TCA	2	6	1673185	1673190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_015061	AAT	2	6	1674548	1674553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015061	GTG	2	6	1674615	1674620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015061	CTA	2	6	1674643	1674648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015061	CAG	2	6	1674666	1674671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_015061	ATCT	2	8	1674720	1674727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_015061	TAT	2	6	1674772	1674777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015061	TTAA	2	8	1674779	1674786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015061	TC	3	6	1676208	1676213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_015061	TA	3	6	1676220	1676225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015061	TCG	2	6	1676306	1676311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_015061	AG	3	6	1676341	1676346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015061	GA	3	6	1676362	1676367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015061	TA	3	6	1676401	1676406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015061	GAAA	2	8	1676410	1676417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015061	GATT	2	8	1676435	1676442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015061	ACAA	2	8	1677710	1677717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_015061	A	8	8	1677727	1677734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_015061	TAT	2	6	1677773	1677778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015061	TCA	2	6	1677794	1677799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_015061	CAT	2	6	1677800	1677805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015061	A	7	7	1677881	1677887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015061	AATC	2	8	1677911	1677918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_015061	GAA	2	6	1677929	1677934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015061	A	6	6	1677933	1677938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_015061	T	8	8	1678031	1678038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015061	CAA	2	6	1678204	1678209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_015061	GTC	2	6	1678261	1678266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_015061	TCA	2	6	1678308	1678313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_015061	ACT	2	6	1678329	1678334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_015061	ACC	2	6	1678336	1678341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_015061	T	6	6	1678356	1678361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015061	GCAAA	2	10	1680990	1680999	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4113	NC_015061	T	6	6	1681021	1681026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015061	AG	3	6	1681046	1681051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015061	GCG	2	6	1683830	1683835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015061	GCAG	2	8	1685490	1685497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_015061	GGC	2	6	1685499	1685504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015061	TGC	2	6	1685567	1685572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015061	G	6	6	1685581	1685586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015061	A	6	6	1685616	1685621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015061	ATT	2	6	1685645	1685650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015061	GCG	2	6	1685683	1685688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015061	ATA	2	6	1685697	1685702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015061	TTTA	2	8	1686779	1686786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015061	TCGTT	2	10	1686849	1686858	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4126	NC_015061	CCTG	2	8	1687486	1687493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_015061	AAG	2	6	1688647	1688652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015061	CAA	2	6	1688697	1688702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_015061	GAG	2	6	1692827	1692832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015061	T	7	7	1696318	1696324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_015061	T	6	6	1696335	1696340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_015061	A	6	6	1696352	1696357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_015061	CTGAC	2	10	1696367	1696376	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4280	NC_015061	ATA	2	6	1756759	1756764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4393	NC_015061	CGCGA	2	10	1798301	1798310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4394	NC_015061	GTTT	2	8	1798327	1798334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4397	NC_015061	TCAC	2	8	1802354	1802361	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4398	NC_015061	GAT	2	6	1802418	1802423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_015061	CTT	2	6	1803460	1803465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4400	NC_015061	TGA	2	6	1803508	1803513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4402	NC_015061	ACT	2	6	1803698	1803703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4480	NC_015061	T	6	6	1838524	1838529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4497	NC_015061	TGG	2	6	1845414	1845419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4499	NC_015061	AC	3	6	1845459	1845464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4500	NC_015061	GTC	2	6	1845505	1845510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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