MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015061	TTA	2	6	813306	813311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_015061	T	6	6	813375	813380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_015061	GTTT	2	8	813991	813998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_015061	TCC	2	6	815133	815138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_015061	GCT	2	6	819028	819033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_015061	CA	3	6	819119	819124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2007	NC_015061	T	6	6	819198	819203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_015061	T	6	6	819211	819216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_015061	TAC	2	6	819743	819748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_015061	CCG	2	6	821247	821252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_015061	CAG	2	6	821257	821262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_015061	GAT	2	6	821287	821292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_015061	GC	3	6	821317	821322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2014	NC_015061	GCT	2	6	821331	821336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_015061	TGG	2	6	821351	821356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_015061	ATCAGC	2	12	821369	821380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_015061	TCT	2	6	821402	821407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_015061	A	6	6	821414	821419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_015061	GTCA	2	8	821445	821452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2020	NC_015061	CGT	2	6	821519	821524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_015061	CG	3	6	821539	821544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2022	NC_015061	TC	3	6	821939	821944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2023	NC_015061	TG	3	6	821947	821952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_015061	TGT	2	6	821955	821960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_015061	TGT	2	6	821979	821984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2033	NC_015061	TGCA	2	8	825428	825435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2036	NC_015061	CG	3	6	826569	826574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_015061	GGC	2	6	827232	827237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_015061	TA	3	6	828459	828464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_015061	A	6	6	828488	828493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2045	NC_015061	A	7	7	833357	833363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2048	NC_015061	A	7	7	836355	836361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_015061	GAC	2	6	836396	836401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_015061	A	7	7	836434	836440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_015061	CTCC	2	8	836454	836461	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2052	NC_015061	TGGGG	2	10	836479	836488	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_015061	CCCA	2	8	836544	836551	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2054	NC_015061	AGG	3	9	836566	836574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_015061	ATC	2	6	836626	836631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_015061	GTCGC	2	10	836683	836692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2057	NC_015061	GAACTC	2	12	836720	836731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2059	NC_015061	TTAG	2	8	836773	836780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2061	NC_015061	GGGCA	2	10	837137	837146	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2062	NC_015061	ATG	3	9	837153	837161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2064	NC_015061	CAA	2	6	839649	839654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_015061	TAT	2	6	839678	839683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_015061	GAC	2	6	839710	839715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2069	NC_015061	TTA	2	6	841000	841005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2072	NC_015061	TTA	2	6	841063	841068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2077	NC_015061	T	6	6	841204	841209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2094	NC_015061	AT	3	6	857660	857665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_015061	TGATC	2	10	857721	857730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2105	NC_015061	AAT	2	6	858178	858183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_015061	AAT	2	6	858185	858190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_015061	CGG	2	6	858203	858208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_015061	ATG	2	6	858239	858244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2115	NC_015061	CTCC	2	8	858797	858804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2116	NC_015061	TGGGG	2	10	858822	858831	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_015061	A	6	6	858851	858856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_015061	CCA	2	6	858860	858865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2119	NC_015061	AAT	2	6	858867	858872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_015061	TCA	2	6	858899	858904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_015061	TATC	2	8	858921	858928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2122	NC_015061	TTTA	2	8	859009	859016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2124	NC_015061	TGA	3	9	859313	859321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_015061	T	6	6	859324	859329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2131	NC_015061	TGAA	2	8	866016	866023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_015061	A	6	6	866036	866041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_015061	CAAA	2	8	866055	866062	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2134	NC_015061	TTG	2	6	866160	866165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_015061	T	8	8	866223	866230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_015061	GCCA	2	8	866242	866249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2137	NC_015061	AAT	2	6	868759	868764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2138	NC_015061	AGC	2	6	868784	868789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_015061	CA	4	8	868829	868836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2140	NC_015061	A	6	6	868836	868841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_015061	TGT	2	6	870672	870677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2142	NC_015061	ATC	2	6	870685	870690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2146	NC_015061	AAT	2	6	872558	872563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2151	NC_015061	T	7	7	875008	875014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2152	NC_015061	GCTT	2	8	877362	877369	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2153	NC_015061	CTC	2	6	877372	877377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2154	NC_015061	ACCCC	2	10	877464	877473	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2155	NC_015061	TCC	2	6	877476	877481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2156	NC_015061	TCA	2	6	877856	877861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2164	NC_015061	T	6	6	881249	881254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2165	NC_015061	GTG	2	6	883625	883630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2170	NC_015061	ATC	2	6	886164	886169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2172	NC_015061	CCT	2	6	886265	886270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2174	NC_015061	GTC	2	6	886286	886291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2180	NC_015061	GT	3	6	890941	890946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2184	NC_015061	TGT	2	6	891271	891276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2241	NC_015061	GACA	2	8	910337	910344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2255	NC_015061	TTCT	2	8	915478	915485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2256	NC_015061	GCG	2	6	915497	915502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2261	NC_015061	CAT	2	6	917095	917100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_015061	GA	3	6	917145	917150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_015061	TC	3	6	917151	917156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2264	NC_015061	AAT	2	6	917208	917213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2265	NC_015061	ATAA	2	8	917218	917225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2266	NC_015061	GTTG	2	8	917235	917242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2267	NC_015061	CGCC	2	8	917267	917274	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2268	NC_015061	GCCT	2	8	917289	917296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2269	NC_015061	GAT	2	6	917361	917366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2271	NC_015061	AG	3	6	917469	917474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2272	NC_015061	TCAG	2	8	917517	917524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2273	NC_015061	CTTC	2	8	917717	917724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2412	NC_015061	TAA	2	6	963677	963682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2413	NC_015061	CGG	2	6	963802	963807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2485	NC_015061	TTCAC	2	10	996110	996119	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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