MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015061	TGA	2	6	4262469	4262474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_015061	TAA	2	6	4263494	4263499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_015061	AAC	2	6	4263532	4263537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_015061	TTAT	2	8	4263562	4263569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_015061	CTC	2	6	4272314	4272319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_015061	AGCC	2	8	4273651	4273658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_015061	A	8	8	4273698	4273705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_015061	TCCCTT	2	12	4275414	4275425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11009	NC_015061	GGAA	2	8	4275496	4275503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_015061	ATT	3	9	4275526	4275534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_015061	A	6	6	4275583	4275588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_015061	CGT	2	6	4279262	4279267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_015061	GTT	2	6	4279282	4279287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_015061	CGT	2	6	4279331	4279336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_015061	TCA	2	6	4280779	4280784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_015061	A	7	7	4280894	4280900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_015061	AAT	2	6	4280919	4280924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_015061	TCA	2	6	4280935	4280940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_015061	GCT	2	6	4280941	4280946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_015061	TTA	2	6	4280952	4280957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_015061	GC	3	6	4281052	4281057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_015061	CAG	2	6	4281109	4281114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_015061	GGC	2	6	4281141	4281146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_015061	ATCA	2	8	4281288	4281295	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11025	NC_015061	A	6	6	4281340	4281345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_015061	CA	3	6	4281356	4281361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_015061	TGT	2	6	4281469	4281474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_015061	TAA	2	6	4281582	4281587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_015061	ATC	2	6	4281608	4281613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_015061	GGC	2	6	4281615	4281620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_015061	GGT	2	6	4281671	4281676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_015061	TGT	2	6	4281701	4281706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_015061	ATT	2	6	4281716	4281721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_015061	GA	3	6	4281728	4281733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_015061	CT	3	6	4283055	4283060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_015061	TAA	2	6	4283156	4283161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_015061	ACT	2	6	4283201	4283206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_015061	AGT	2	6	4284083	4284088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_015061	GTTATT	2	12	4284170	4284181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_015061	T	7	7	4284200	4284206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_015061	ATG	2	6	4284360	4284365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_015061	ACA	2	6	4284373	4284378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_015061	CAC	2	6	4285472	4285477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_015061	TCA	2	6	4285521	4285526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_015061	CTTTT	2	10	4287143	4287152	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11046	NC_015061	ATTT	2	8	4287178	4287185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_015061	CAGA	2	8	4287194	4287201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11048	NC_015061	TTA	2	6	4287233	4287238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_015061	TCA	2	6	4287244	4287249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_015061	GACCG	2	10	4287281	4287290	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11051	NC_015061	CAC	2	6	4287317	4287322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11052	NC_015061	AGC	2	6	4287747	4287752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_015061	T	6	6	4287820	4287825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_015061	GGC	2	6	4287871	4287876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_015061	GGA	2	6	4287879	4287884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_015061	AGG	2	6	4287894	4287899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_015061	TTCG	2	8	4288889	4288896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11058	NC_015061	AG	3	6	4289930	4289935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_015061	GAA	2	6	4290664	4290669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_015061	CGC	2	6	4290677	4290682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11061	NC_015061	T	6	6	4290703	4290708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_015061	ATT	2	6	4290724	4290729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_015061	TAA	2	6	4290755	4290760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_015061	CAG	2	6	4290774	4290779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_015061	ACTC	2	8	4290794	4290801	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_015061	A	6	6	4290803	4290808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_015061	A	6	6	4290827	4290832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_015061	A	6	6	4290860	4290865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_015061	TA	5	10	4290936	4290945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_015061	TCA	2	6	4290950	4290955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_015061	TTA	3	9	4290964	4290972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_015061	TAT	2	6	4291023	4291028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_015061	T	8	8	4291041	4291048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_015061	GATT	2	8	4291078	4291085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_015061	T	6	6	4291084	4291089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_015061	ACT	2	6	4291109	4291114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_015061	AAC	2	6	4291132	4291137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_015061	TA	3	6	4291153	4291158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_015061	TTAT	2	8	4291163	4291170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_015061	TAC	2	6	4291203	4291208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_015061	ATTT	2	8	4291221	4291228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_015061	TTA	2	6	4291968	4291973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_015061	ATT	2	6	4291992	4291997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_015061	ATG	2	6	4292027	4292032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_015061	AT	3	6	4293720	4293725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_015061	ATT	2	6	4294213	4294218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_015061	TA	3	6	4303257	4303262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11089	NC_015061	CG	3	6	4303433	4303438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11090	NC_015061	CGG	2	6	4303493	4303498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_015061	CT	3	6	4303503	4303508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11092	NC_015061	TCC	2	6	4303577	4303582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11093	NC_015061	CCT	2	6	4303583	4303588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_015061	GCG	2	6	4303619	4303624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_015061	CGG	2	6	4303643	4303648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_015061	ATA	2	6	4303649	4303654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_015061	A	7	7	4304575	4304581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_015061	ACG	2	6	4307074	4307079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_015061	ACTG	2	8	4307080	4307087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11100	NC_015061	AAT	2	6	4308283	4308288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_015061	T	7	7	4308328	4308334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_015061	CAT	2	6	4308343	4308348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_015061	AATC	2	8	4309108	4309115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11104	NC_015061	AAT	2	6	4309118	4309123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_015061	TGC	2	6	4309149	4309154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_015061	T	6	6	4309271	4309276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_015061	A	6	6	4309298	4309303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_015061	CAA	2	6	4309325	4309330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_015061	AGTGAA	2	12	4309363	4309374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11111	NC_015061	ATT	2	6	4309388	4309393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_015061	ACA	2	6	4309423	4309428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_015061	A	6	6	4309441	4309446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_015061	CAG	2	6	4309448	4309453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_015061	A	6	6	4309476	4309481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_015061	T	6	6	4309501	4309506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_015061	AAAT	2	8	4309513	4309520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_015061	GA	3	6	4309542	4309547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_015061	AT	3	6	4309576	4309581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_015061	ACA	2	6	4309583	4309588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_015061	ACA	2	6	4309706	4309711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_015061	AATG	2	8	4309802	4309809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_015061	GTC	2	6	4312333	4312338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_015061	TAT	2	6	4312463	4312468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_015061	ATT	2	6	4312479	4312484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_015061	CGGC	2	8	4312490	4312497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11127	NC_015061	T	6	6	4312540	4312545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_015061	TCC	2	6	4312553	4312558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11130	NC_015061	ATT	2	6	4312603	4312608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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