MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015061	AT	3	6	4071203	4071208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_015061	CGT	2	6	4072429	4072434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_015061	AATG	2	8	4072443	4072450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_015061	AGAC	2	8	4072462	4072469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10505	NC_015061	A	7	7	4072509	4072515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_015061	CTGG	2	8	4072532	4072539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10507	NC_015061	GTT	2	6	4072784	4072789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_015061	TGA	2	6	4072844	4072849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_015061	ATCGC	2	10	4074544	4074553	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10510	NC_015061	CGG	2	6	4074678	4074683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_015061	T	7	7	4074732	4074738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_015061	GTA	2	6	4078842	4078847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_015061	GTCC	2	8	4079024	4079031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10514	NC_015061	CTG	2	6	4079037	4079042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_015061	CGC	2	6	4079055	4079060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10516	NC_015061	AAG	2	6	4081419	4081424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_015061	ATC	2	6	4081497	4081502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_015061	CA	3	6	4081505	4081510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10519	NC_015061	CGGG	2	8	4081530	4081537	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10520	NC_015061	GAAA	2	8	4081538	4081545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_015061	CA	3	6	4081605	4081610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10522	NC_015061	AG	3	6	4081615	4081620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_015061	TTAT	2	8	4084554	4084561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_015061	ATA	2	6	4085300	4085305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_015061	TTC	2	6	4085311	4085316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_015061	ATTAC	2	10	4085338	4085347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10527	NC_015061	GTT	2	6	4085354	4085359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_015061	A	6	6	4085380	4085385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_015061	TTCCC	2	10	4085409	4085418	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10530	NC_015061	TATT	2	8	4085456	4085463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_015061	ATT	2	6	4085472	4085477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_015061	GAC	2	6	4085492	4085497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_015061	ATG	2	6	4089334	4089339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_015061	CTC	2	6	4090168	4090173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10535	NC_015061	GCA	2	6	4090238	4090243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_015061	ATG	2	6	4090277	4090282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_015061	ATG	2	6	4090312	4090317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_015061	TGA	2	6	4090322	4090327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_015061	ACG	2	6	4092751	4092756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_015061	GAA	2	6	4097269	4097274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_015061	A	6	6	4097939	4097944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_015061	AG	3	6	4098011	4098016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_015061	CGG	2	6	4098059	4098064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_015061	CCG	2	6	4098092	4098097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10545	NC_015061	T	6	6	4098132	4098137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_015061	ACA	2	6	4098158	4098163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_015061	CCGC	2	8	4099447	4099454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10548	NC_015061	A	8	8	4099455	4099462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_015061	GCC	2	6	4099503	4099508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10550	NC_015061	GAC	2	6	4099528	4099533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_015061	AGAA	2	8	4100163	4100170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_015061	A	6	6	4100169	4100174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_015061	CGG	2	6	4100207	4100212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_015061	TCA	2	6	4102644	4102649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_015061	TTA	2	6	4102667	4102672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_015061	AAG	2	6	4105357	4105362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_015061	AAT	2	6	4105425	4105430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_015061	CAT	2	6	4105443	4105448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_015061	ATA	2	6	4105485	4105490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_015061	CATA	2	8	4105525	4105532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10561	NC_015061	A	6	6	4105532	4105537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_015061	CGCC	2	8	4105605	4105612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10563	NC_015061	AGA	2	6	4105651	4105656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_015061	TCC	2	6	4110057	4110062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10565	NC_015061	AAT	2	6	4110066	4110071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_015061	GC	3	6	4110156	4110161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10567	NC_015061	ATG	2	6	4110168	4110173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_015061	GAA	2	6	4110314	4110319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_015061	A	6	6	4110357	4110362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_015061	AAAC	2	8	4110421	4110428	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10571	NC_015061	TAAA	2	8	4110443	4110450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_015061	A	6	6	4110448	4110453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_015061	CACAT	2	10	4110508	4110517	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10574	NC_015061	CT	3	6	4111357	4111362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10575	NC_015061	A	7	7	4111549	4111555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10579	NC_015061	TAT	2	6	4111810	4111815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_015061	AT	3	6	4111814	4111819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_015061	ATA	2	6	4111826	4111831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_015061	ATA	2	6	4111853	4111858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_015061	TCA	2	6	4111956	4111961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10588	NC_015061	A	7	7	4114243	4114249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_015061	CGG	2	6	4120062	4120067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10594	NC_015061	AGA	2	6	4120391	4120396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10597	NC_015061	T	7	7	4120770	4120776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_015061	CAC	2	6	4122948	4122953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10599	NC_015061	ATT	2	6	4123001	4123006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10601	NC_015061	A	6	6	4123068	4123073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_015061	CTT	2	6	4124345	4124350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10604	NC_015061	A	8	8	4126434	4126441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_015061	T	6	6	4126523	4126528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_015061	TTC	2	6	4126546	4126551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10610	NC_015061	T	7	7	4127232	4127238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_015061	A	6	6	4128600	4128605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_015061	GTG	2	6	4128672	4128677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10614	NC_015061	GGT	2	6	4129367	4129372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_015061	A	7	7	4129387	4129393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_015061	TGCCT	2	10	4130432	4130441	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10617	NC_015061	TGA	2	6	4130447	4130452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_015061	AC	3	6	4130533	4130538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10619	NC_015061	GCAA	2	8	4130612	4130619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10620	NC_015061	ATG	2	6	4130630	4130635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_015061	T	6	6	4132136	4132141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_015061	CAA	2	6	4132154	4132159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_015061	A	6	6	4132995	4133000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_015061	TC	3	6	4137754	4137759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10625	NC_015061	A	9	9	4137781	4137789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_015061	T	7	7	4137813	4137819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_015061	GCCC	2	8	4137839	4137846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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