MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015061	ATG	2	6	3165291	3165296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_015061	G	6	6	3165347	3165352	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_015061	CAT	2	6	3165414	3165419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_015061	GCA	2	6	3165423	3165428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_015061	A	6	6	3165435	3165440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_015061	CAG	2	6	3165441	3165446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_015061	TAAA	2	8	3165458	3165465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_015061	TGA	2	6	3165490	3165495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_015061	AGC	2	6	3165518	3165523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_015061	GTT	2	6	3166131	3166136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_015061	TAA	2	6	3166233	3166238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_015061	ATT	2	6	3166249	3166254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_015061	ATC	2	6	3166262	3166267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_015061	ATT	2	6	3166274	3166279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_015061	AGA	2	6	3166373	3166378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_015061	AGA	2	6	3166396	3166401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_015061	CAA	2	6	3166454	3166459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_015061	TC	3	6	3167834	3167839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_015061	GTT	2	6	3168932	3168937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_015061	GCA	2	6	3168959	3168964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_015061	CT	3	6	3169022	3169027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_015061	GC	3	6	3169072	3169077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_015061	AATT	2	8	3169129	3169136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_015061	CGA	2	6	3175077	3175082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_015061	ATT	2	6	3175086	3175091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_015061	A	6	6	3175134	3175139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_015061	AAGC	2	8	3175238	3175245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8028	NC_015061	CAT	2	6	3175247	3175252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_015061	AAATCA	2	12	3175253	3175264	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8030	NC_015061	A	6	6	3175272	3175277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_015061	T	6	6	3175293	3175298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_015061	ATT	2	6	3177629	3177634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_015061	CTCTT	2	10	3177732	3177741	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8034	NC_015061	TTA	3	9	3178918	3178926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_015061	ATTA	2	8	3178951	3178958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_015061	AT	3	6	3178968	3178973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_015061	TTA	2	6	3178977	3178982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_015061	AT	3	6	3179049	3179054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_015061	TTA	2	6	3179073	3179078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_015061	TTC	2	6	3179092	3179097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_015061	GTT	2	6	3179103	3179108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_015061	A	7	7	3179113	3179119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_015061	TAA	2	6	3179243	3179248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_015061	TTATT	2	10	3179327	3179336	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_015061	A	6	6	3179343	3179348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_015061	AACT	2	8	3179380	3179387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8047	NC_015061	AT	3	6	3179432	3179437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_015061	TCT	2	6	3179448	3179453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_015061	T	7	7	3179480	3179486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_015061	TGA	2	6	3179512	3179517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_015061	GA	3	6	3179548	3179553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_015061	CCA	2	6	3179564	3179569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_015061	AGTT	2	8	3179600	3179607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_015061	AAC	2	6	3179644	3179649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_015061	TGG	2	6	3179657	3179662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_015061	A	6	6	3179665	3179670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_015061	AT	3	6	3179733	3179738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_015061	AT	3	6	3179785	3179790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_015061	CGT	2	6	3179795	3179800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_015061	ATG	2	6	3179824	3179829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_015061	TCA	2	6	3179917	3179922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_015061	AATT	2	8	3181021	3181028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_015061	AGGG	2	8	3181060	3181067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_015061	CGA	2	6	3181178	3181183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_015061	ACAG	2	8	3181846	3181853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8066	NC_015061	A	7	7	3181864	3181870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_015061	AT	3	6	3181896	3181901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_015061	ATA	2	6	3181948	3181953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_015061	GGC	2	6	3183256	3183261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_015061	TAT	2	6	3183269	3183274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_015061	GCA	2	6	3183277	3183282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_015061	A	8	8	3183372	3183379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_015061	CT	3	6	3184230	3184235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8074	NC_015061	ATA	2	6	3187478	3187483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_015061	GCC	2	6	3187626	3187631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8076	NC_015061	A	7	7	3191117	3191123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_015061	TCC	2	6	3191716	3191721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_015061	GCGT	2	8	3191790	3191797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8079	NC_015061	AAC	2	6	3191895	3191900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_015061	C	6	6	3191908	3191913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8081	NC_015061	A	7	7	3192045	3192051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_015061	TA	3	6	3193402	3193407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_015061	TA	3	6	3193427	3193432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_015061	GGA	2	6	3193469	3193474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_015061	GTG	2	6	3193483	3193488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_015061	CAA	2	6	3195328	3195333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_015061	A	6	6	3196826	3196831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_015061	T	6	6	3197720	3197725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_015061	TTGATT	2	12	3197732	3197743	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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8093	NC_015061	T	6	6	3197858	3197863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_015061	TCA	2	6	3197901	3197906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8097	NC_015061	TTA	2	6	3199052	3199057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_015061	ATTG	2	8	3200537	3200544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_015061	TAAC	2	8	3200593	3200600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_015061	AAT	2	6	3200674	3200679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_015061	CCA	2	6	3200745	3200750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_015061	ATTA	2	8	3200824	3200831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_015061	AAAT	2	8	3200841	3200848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_015061	TCC	2	6	3205214	3205219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8108	NC_015061	TTG	2	6	3205352	3205357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_015061	ACA	2	6	3205382	3205387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_015061	TCC	2	6	3206680	3206685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8111	NC_015061	AGGG	2	8	3206686	3206693	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_015061	A	6	6	3206694	3206699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_015061	GTA	2	6	3206700	3206705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_015061	A	8	8	3206718	3206725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_015061	TGC	2	6	3206806	3206811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_015061	AGT	2	6	3206818	3206823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8118	NC_015061	CTT	2	6	3206835	3206840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_015061	CTT	2	6	3206865	3206870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8121	NC_015061	GTC	2	6	3206917	3206922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_015061	GCA	2	6	3206933	3206938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8126	NC_015061	A	6	6	3207140	3207145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_015061	AAT	2	6	3207150	3207155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_015061	ATC	2	6	3208848	3208853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_015061	GC	3	6	3211613	3211618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8130	NC_015061	AG	3	6	3211638	3211643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_015061	ACGCT	2	10	3211727	3211736	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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8133	NC_015061	A	6	6	3212353	3212358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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