MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015061	CTG	2	6	2876762	2876767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_015061	A	6	6	2876781	2876786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_015061	T	7	7	2876803	2876809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_015061	AAG	2	6	2877483	2877488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_015061	ATGG	2	8	2877504	2877511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_015061	TGTAT	2	10	2877527	2877536	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_015061	AAC	2	6	2877556	2877561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_015061	CGGG	2	8	2877587	2877594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7009	NC_015061	CATT	2	8	2877595	2877602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7010	NC_015061	CTG	2	6	2877663	2877668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_015061	A	6	6	2877742	2877747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_015061	TC	3	6	2877799	2877804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_015061	TTACA	2	10	2877821	2877830	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7014	NC_015061	A	7	7	2877873	2877879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_015061	CAA	2	6	2877896	2877901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_015061	ATC	2	6	2877930	2877935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_015061	ATT	2	6	2877986	2877991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_015061	CAAA	2	8	2878020	2878027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7019	NC_015061	AGA	2	6	2878046	2878051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_015061	TAT	2	6	2878058	2878063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_015061	C	6	6	2878074	2878079	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7022	NC_015061	TTA	2	6	2878575	2878580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_015061	A	6	6	2878672	2878677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_015061	CAG	2	6	2878686	2878691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_015061	AGA	2	6	2881198	2881203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_015061	A	7	7	2881224	2881230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_015061	ATT	2	6	2881252	2881257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_015061	ATT	2	6	2881263	2881268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_015061	TAA	2	6	2881277	2881282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_015061	TGA	2	6	2883312	2883317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_015061	GTT	2	6	2883421	2883426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_015061	A	6	6	2884863	2884868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_015061	TAT	2	6	2884884	2884889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_015061	TAT	2	6	2884924	2884929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_015061	ATC	2	6	2884966	2884971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_015061	ATG	2	6	2884982	2884987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_015061	AAG	2	6	2884997	2885002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_015061	GTA	2	6	2885006	2885011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_015061	TGG	2	6	2885028	2885033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_015061	CAC	2	6	2885106	2885111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7041	NC_015061	TCT	2	6	2885114	2885119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_015061	TAAA	2	8	2885153	2885160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_015061	GAA	2	6	2885180	2885185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_015061	CGAGC	2	10	2885203	2885212	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7045	NC_015061	GCA	2	6	2885231	2885236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_015061	CAC	2	6	2885279	2885284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7047	NC_015061	TCT	2	6	2885311	2885316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_015061	AT	3	6	2889822	2889827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_015061	AAAC	2	8	2889909	2889916	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7050	NC_015061	GAGCCA	2	12	2889954	2889965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_015061	CTC	2	6	2894328	2894333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7052	NC_015061	AGGG	2	8	2894353	2894360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_015061	ACCCC	2	10	2894421	2894430	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7054	NC_015061	GGGA	2	8	2894448	2894455	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_015061	AAC	2	6	2895028	2895033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_015061	T	7	7	2895037	2895043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_015061	AAT	2	6	2895101	2895106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_015061	AAT	2	6	2895108	2895113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_015061	CTG	2	6	2895978	2895983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_015061	TAAA	2	8	2896061	2896068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_015061	ACA	2	6	2896139	2896144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_015061	TAA	2	6	2896166	2896171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_015061	TAA	2	6	2896264	2896269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_015061	A	8	8	2896268	2896275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_015061	AG	3	6	2896277	2896282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_015061	TCA	2	6	2897706	2897711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_015061	ATAA	2	8	2897714	2897721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_015061	GCG	2	6	2897723	2897728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_015061	CGTG	2	8	2897732	2897739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7070	NC_015061	ATA	2	6	2900353	2900358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_015061	A	6	6	2902838	2902843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_015061	ATA	2	6	2903038	2903043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_015061	AAC	2	6	2903067	2903072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_015061	CA	3	6	2903086	2903091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7075	NC_015061	T	7	7	2904364	2904370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_015061	ATAA	2	8	2904391	2904398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_015061	CAGACT	2	12	2904436	2904447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_015061	A	6	6	2904478	2904483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_015061	GGA	2	6	2908000	2908005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_015061	CTCC	2	8	2908019	2908026	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7081	NC_015061	TGGGG	2	10	2908044	2908053	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_015061	CGG	2	6	2908103	2908108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_015061	CAA	2	6	2908115	2908120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_015061	GAG	2	6	2908167	2908172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_015061	CTTC	2	8	2908208	2908215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_015061	GAG	2	6	2908228	2908233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_015061	CTTC	2	8	2908269	2908276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_015061	GAG	2	6	2908289	2908294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_015061	GTT	2	6	2915432	2915437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7092	NC_015061	A	6	6	2915536	2915541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_015061	CAA	2	6	2915587	2915592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_015061	CAA	2	6	2915689	2915694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_015061	T	6	6	2915724	2915729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_015061	TAT	2	6	2915763	2915768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_015061	CGG	2	6	2915811	2915816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_015061	CCTG	2	8	2915924	2915931	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7099	NC_015061	GTC	2	6	2916009	2916014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_015061	CAGA	2	8	2916114	2916121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7101	NC_015061	ATG	2	6	2920586	2920591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_015061	GTTT	2	8	2920624	2920631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_015061	ATT	2	6	2921994	2921999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_015061	AGG	2	6	2925195	2925200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_015061	TGG	2	6	2925222	2925227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_015061	ACC	2	6	2925266	2925271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7107	NC_015061	TC	3	6	2926487	2926492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_015061	GCA	3	9	2926514	2926522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_015061	CAA	2	6	2926536	2926541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_015061	CTCCG	2	10	2926637	2926646	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7111	NC_015061	ATC	2	6	2926652	2926657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_015061	CAAT	2	8	2926685	2926692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7113	NC_015061	CGC	2	6	2926706	2926711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_015061	A	6	6	2929092	2929097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_015061	AT	3	6	2929107	2929112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_015061	ATT	3	9	2929117	2929125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_015061	AT	3	6	2929172	2929177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_015061	ATT	2	6	2932613	2932618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_015061	TGA	2	6	2932630	2932635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_015061	GTA	2	6	2932641	2932646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_015061	CAG	2	6	2932712	2932717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_015061	TCGTTT	2	12	2932733	2932744	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7123	NC_015061	CAA	2	6	2932755	2932760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_015061	GA	3	6	2932812	2932817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_015061	GAATT	2	10	2932826	2932835	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_015061	GAT	2	6	2932846	2932851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_015061	CCT	2	6	2932913	2932918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_015061	AAT	2	6	2933023	2933028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_015061	TAT	2	6	2933066	2933071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_015061	GTG	2	6	2933657	2933662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_015061	ATC	2	6	2933674	2933679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7132	NC_015061	TTG	2	6	2933680	2933685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_015061	AGC	2	6	2933724	2933729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7134	NC_015061	TGA	2	6	2933854	2933859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7135	NC_015061	GCTTT	2	10	2933865	2933874	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7136	NC_015061	CTG	2	6	2933929	2933934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7137	NC_015061	TTTC	2	8	2933941	2933948	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7138	NC_015061	ACA	2	6	2935298	2935303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7141	NC_015061	ATTT	2	8	2935353	2935360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7142	NC_015061	T	6	6	2935358	2935363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7143	NC_015061	A	6	6	2936178	2936183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7144	NC_015061	T	6	6	2936218	2936223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7145	NC_015061	AAATA	2	10	2936224	2936233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7149	NC_015061	TTC	2	6	2936451	2936456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7150	NC_015061	TG	3	6	2936465	2936470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7151	NC_015061	CCAT	2	8	2936506	2936513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7164	NC_015061	CA	3	6	2937746	2937751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7165	NC_015061	CTG	2	6	2937778	2937783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7170	NC_015061	TATC	2	8	2938986	2938993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7172	NC_015061	ATA	2	6	2939046	2939051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7173	NC_015061	AGTC	2	8	2939066	2939073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7250	NC_015061	TA	3	6	2965800	2965805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7251	NC_015061	TGG	2	6	2965818	2965823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7253	NC_015061	A	6	6	2966004	2966009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7254	NC_015061	CATT	2	8	2969922	2969929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7255	NC_015061	TAA	2	6	2969935	2969940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7256	NC_015061	A	7	7	2971355	2971361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7257	NC_015061	ACG	2	6	2971465	2971470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7259	NC_015061	CTT	2	6	2971548	2971553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7260	NC_015061	GCG	2	6	2971554	2971559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7262	NC_015061	GAT	2	6	2971581	2971586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7398	NC_015061	CCTCA	2	10	3020848	3020857	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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7401	NC_015061	CTT	2	6	3022181	3022186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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