MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015061	CTG	2	6	2687347	2687352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_015061	TAA	2	6	2689088	2689093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_015061	CTCC	2	8	2689115	2689122	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6504	NC_015061	TTG	2	6	2694227	2694232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_015061	TTC	2	6	2694243	2694248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_015061	TTA	2	6	2694313	2694318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_015061	GAAT	2	8	2694393	2694400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_015061	G	6	6	2694413	2694418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_015061	GC	3	6	2694456	2694461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_015061	ACTT	2	8	2695182	2695189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6511	NC_015061	CATGC	2	10	2695195	2695204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6512	NC_015061	TAA	2	6	2695242	2695247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_015061	TTA	2	6	2695292	2695297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_015061	CTG	2	6	2695315	2695320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_015061	TTTC	2	8	2695337	2695344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6516	NC_015061	ATT	2	6	2695389	2695394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_015061	G	7	7	2695425	2695431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_015061	GTC	2	6	2695747	2695752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_015061	T	6	6	2695783	2695788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_015061	GCG	2	6	2695793	2695798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_015061	GCT	2	6	2695821	2695826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_015061	ATT	2	6	2695848	2695853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_015061	TCC	2	6	2695882	2695887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_015061	TG	3	6	2695895	2695900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_015061	TGA	2	6	2695908	2695913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_015061	TAC	2	6	2695944	2695949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_015061	ATA	2	6	2695959	2695964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_015061	AACAA	2	10	2695992	2696001	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6529	NC_015061	ATT	2	6	2696002	2696007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_015061	ATT	2	6	2696034	2696039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_015061	T	6	6	2696064	2696069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_015061	CTA	2	6	2696112	2696117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_015061	TGC	2	6	2696140	2696145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_015061	GACA	2	8	2696166	2696173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6535	NC_015061	GTT	2	6	2696178	2696183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_015061	AAT	2	6	2696207	2696212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_015061	GCC	2	6	2697336	2697341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_015061	TGAA	2	8	2697367	2697374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_015061	AAAG	2	8	2697383	2697390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_015061	GGGA	2	8	2697418	2697425	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_015061	A	6	6	2698808	2698813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_015061	TAA	2	6	2700054	2700059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_015061	ATC	2	6	2700076	2700081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_015061	T	6	6	2700097	2700102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_015061	GAG	2	6	2700191	2700196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_015061	CTC	2	6	2701518	2701523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6547	NC_015061	GCT	2	6	2701588	2701593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_015061	ACCCC	2	10	2701609	2701618	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6549	NC_015061	GAT	2	6	2702804	2702809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_015061	AAC	2	6	2703706	2703711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_015061	T	7	7	2703801	2703807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_015061	TCAGG	2	10	2703838	2703847	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6553	NC_015061	CTT	2	6	2705420	2705425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_015061	T	6	6	2705427	2705432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_015061	TGT	2	6	2705437	2705442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_015061	CTGT	2	8	2705450	2705457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_015061	CCA	2	6	2705469	2705474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_015061	GAT	2	6	2705504	2705509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_015061	GCA	2	6	2705530	2705535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_015061	T	6	6	2705548	2705553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_015061	TG	3	6	2705570	2705575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_015061	TTATT	2	10	2705775	2705784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_015061	AGA	2	6	2705855	2705860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_015061	T	6	6	2705896	2705901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_015061	GGC	2	6	2709925	2709930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_015061	A	7	7	2709934	2709940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_015061	A	6	6	2709946	2709951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_015061	CGCA	2	8	2710092	2710099	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6569	NC_015061	GCG	2	6	2710148	2710153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_015061	CTCG	2	8	2710172	2710179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_015061	GC	3	6	2710202	2710207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6572	NC_015061	G	7	7	2710220	2710226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_015061	G	6	6	2710231	2710236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_015061	CGG	2	6	2710237	2710242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_015061	TAGT	2	8	2712596	2712603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_015061	A	6	6	2712690	2712695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_015061	AGTA	2	8	2713808	2713815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_015061	TA	3	6	2713814	2713819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_015061	A	7	7	2713854	2713860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_015061	GGA	2	6	2713870	2713875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_015061	GTCT	2	8	2713899	2713906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6582	NC_015061	AATC	2	8	2715253	2715260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6583	NC_015061	CCG	2	6	2715326	2715331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6584	NC_015061	A	6	6	2715354	2715359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_015061	A	7	7	2715438	2715444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_015061	CCG	2	6	2715447	2715452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6587	NC_015061	TCA	2	6	2716840	2716845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_015061	CGG	2	6	2716862	2716867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_015061	ATT	2	6	2716887	2716892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_015061	A	6	6	2716897	2716902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_015061	CCTT	2	8	2716929	2716936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6592	NC_015061	TGT	2	6	2716964	2716969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_015061	CGT	2	6	2716990	2716995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_015061	GCG	2	6	2717049	2717054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_015061	GAAC	2	8	2717097	2717104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6596	NC_015061	TTTG	2	8	2719399	2719406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_015061	TTTC	2	8	2719408	2719415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6598	NC_015061	AG	3	6	2719451	2719456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_015061	TC	3	6	2719478	2719483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_015061	ATT	2	6	2719544	2719549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_015061	GCA	2	6	2719556	2719561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_015061	CGT	2	6	2719575	2719580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_015061	CA	3	6	2720499	2720504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_015061	TTATT	2	10	2720546	2720555	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_015061	GAGT	2	8	2720565	2720572	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_015061	CTG	2	6	2720793	2720798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6608	NC_015061	TTG	2	6	2722083	2722088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_015061	AGG	2	6	2722115	2722120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_015061	T	6	6	2722407	2722412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_015061	GTTTT	2	10	2722443	2722452	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_015061	AATT	2	8	2722764	2722771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_015061	AT	3	6	2722782	2722787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_015061	TC	3	6	2722822	2722827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_015061	C	6	6	2722872	2722877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6616	NC_015061	CCT	2	6	2723131	2723136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_015061	TCAA	2	8	2723350	2723357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6618	NC_015061	CTT	2	6	2723557	2723562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_015061	CTGC	2	8	2723590	2723597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6620	NC_015061	AATA	2	8	2724157	2724164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_015061	TAA	2	6	2724564	2724569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_015061	GAT	2	6	2725850	2725855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_015061	TCA	2	6	2725887	2725892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_015061	ATT	2	6	2725912	2725917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_015061	CCG	2	6	2725933	2725938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6626	NC_015061	GGC	2	6	2725939	2725944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_015061	TTAAA	2	10	2726002	2726011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_015061	TAACG	2	10	2726019	2726028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6629	NC_015061	AAT	2	6	2726038	2726043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_015061	GA	3	6	2726089	2726094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_015061	TGA	2	6	2726124	2726129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_015061	GTT	2	6	2726170	2726175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6901	NC_015061	A	9	9	2845859	2845867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6902	NC_015061	ACTG	2	8	2845876	2845883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6934	NC_015061	TGT	2	6	2857501	2857506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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