MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015061	TGC	2	6	1845524	1845529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_015061	TGA	2	6	1845616	1845621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015061	A	6	6	1845632	1845637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015061	ATAA	2	8	1845702	1845709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_015061	TGT	2	6	1845777	1845782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_015061	A	6	6	1845821	1845826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_015061	TTAT	2	8	1845869	1845876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015061	TCAC	2	8	1847398	1847405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_015061	T	6	6	1847436	1847441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015061	GAT	2	6	1847462	1847467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015061	ATCT	2	8	1847478	1847485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_015061	AGG	2	6	1847492	1847497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015061	TGC	2	6	1848471	1848476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_015061	CGG	2	6	1849927	1849932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_015061	TCA	2	6	1849937	1849942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_015061	TTA	2	6	1849955	1849960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_015061	CAT	2	6	1850585	1850590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_015061	AGGG	2	8	1850629	1850636	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015061	CGG	2	6	1851359	1851364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_015061	GATG	2	8	1851440	1851447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_015061	ATA	2	6	1852824	1852829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015061	T	7	7	1852830	1852836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015061	A	6	6	1855115	1855120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015061	CG	3	6	1855123	1855128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_015061	AAC	2	6	1855152	1855157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_015061	AAC	2	6	1855162	1855167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_015061	TATTG	2	10	1855178	1855187	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015061	CTG	2	6	1855240	1855245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_015061	T	6	6	1856881	1856886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_015061	TTTA	2	8	1858648	1858655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015061	GTT	2	6	1858664	1858669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015061	TGG	2	6	1858684	1858689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015061	ATG	2	6	1858701	1858706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015061	GCG	2	6	1858730	1858735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_015061	TGGG	2	8	1860596	1860603	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_015061	GA	3	6	1860674	1860679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015061	T	7	7	1861524	1861530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015061	CTG	2	6	1861543	1861548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_015061	TCTG	2	8	1861573	1861580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_015061	TCA	2	6	1861582	1861587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_015061	CCG	2	6	1861596	1861601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_015061	GCG	2	6	1862147	1862152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_015061	TTGG	2	8	1862325	1862332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_015061	AATC	2	8	1862358	1862365	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4545	NC_015061	TCC	2	6	1862632	1862637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_015061	ACG	2	6	1862648	1862653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_015061	GTGAC	2	10	1862719	1862728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4548	NC_015061	CCG	2	6	1862761	1862766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_015061	GGA	3	9	1862785	1862793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015061	GCAG	2	8	1864577	1864584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_015061	GC	3	6	1864591	1864596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_015061	GTT	2	6	1864603	1864608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_015061	TCTG	2	8	1864625	1864632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_015061	CGG	2	6	1865073	1865078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_015061	GTC	2	6	1865131	1865136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015061	CGC	2	6	1866012	1866017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_015061	GCGG	2	8	1866022	1866029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_015061	GGCA	2	8	1866032	1866039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_015061	GA	3	6	1866662	1866667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015061	GCC	2	6	1866836	1866841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_015061	T	6	6	1866842	1866847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015061	GCT	2	6	1866874	1866879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_015061	GCG	2	6	1866887	1866892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_015061	GCC	2	6	1869986	1869991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_015061	ACC	2	6	1869999	1870004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_015061	GGCT	2	8	1870005	1870012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_015061	TGT	2	6	1870017	1870022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015061	CAG	2	6	1870027	1870032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_015061	A	7	7	1870055	1870061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015061	ACA	2	6	1870064	1870069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_015061	CGC	2	6	1870610	1870615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_015061	ATCC	2	8	1870634	1870641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_015061	T	6	6	1870646	1870651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015061	GCT	2	6	1870666	1870671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_015061	A	6	6	1872343	1872348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015061	ATG	2	6	1873709	1873714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_015061	TCA	2	6	1873805	1873810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_015061	GA	3	6	1877627	1877632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_015061	AAT	2	6	1877645	1877650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015061	A	7	7	1877666	1877672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015061	T	6	6	1877761	1877766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015061	T	6	6	1877774	1877779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_015061	CGG	2	6	1877803	1877808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_015061	TGA	2	6	1878812	1878817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015061	AAT	2	6	1878860	1878865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_015061	TCA	2	6	1878901	1878906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_015061	A	6	6	1879700	1879705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_015061	TCA	2	6	1879762	1879767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_015061	TGTTTC	2	12	1879787	1879798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4590	NC_015061	TTC	2	6	1879870	1879875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_015061	T	9	9	1879905	1879913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015061	GCC	2	6	1879933	1879938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_015061	GCAAC	2	10	1879944	1879953	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4594	NC_015061	ACG	2	6	1879967	1879972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_015061	TGA	2	6	1879982	1879987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_015061	AGG	2	6	1881883	1881888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_015061	CTGA	2	8	1883351	1883358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4598	NC_015061	GGATC	2	10	1883359	1883368	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4599	NC_015061	TCA	2	6	1883377	1883382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_015061	ATC	2	6	1883416	1883421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_015061	TTTTC	2	10	1883439	1883448	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4602	NC_015061	TGC	2	6	1884329	1884334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_015061	T	8	8	1884369	1884376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_015061	A	7	7	1884438	1884444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015061	GCA	2	6	1884493	1884498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_015061	AAC	2	6	1884528	1884533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015061	GGC	2	6	1886057	1886062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_015061	A	6	6	1886083	1886088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015061	ATG	2	6	1886137	1886142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015061	TGCA	2	8	1887171	1887178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4611	NC_015061	TTCAC	2	10	1887873	1887882	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4612	NC_015061	TAA	3	9	1888786	1888794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015061	TGG	2	6	1888815	1888820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015061	T	6	6	1888839	1888844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015061	CTCC	2	8	1889332	1889339	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4616	NC_015061	G	7	7	1889348	1889354	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015061	TGGGG	2	10	1889356	1889365	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015061	GAG	2	6	1889452	1889457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_015061	A	7	7	1889485	1889491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015061	TGA	2	6	1896613	1896618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_015061	TAT	2	6	1897034	1897039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_015061	ATT	4	12	1897048	1897059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_015061	CTG	2	6	1897095	1897100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_015061	ATTC	2	8	1897137	1897144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_015061	AAAG	2	8	1899506	1899513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015061	TCA	2	6	1899548	1899553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_015061	A	7	7	1899580	1899586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_015061	GTC	2	6	1899631	1899636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_015061	CTCC	2	8	1899929	1899936	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4630	NC_015061	GGGGT	2	10	1899955	1899964	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_015061	GAG	2	6	1900050	1900055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4899	NC_015061	ATC	2	6	2024208	2024213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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