MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014834	ACG	2	6	1246024	1246029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_014834	CCG	2	6	1246037	1246042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_014834	CCG	2	6	1246279	1246284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_014834	GGC	2	6	1246332	1246337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_014834	TGG	2	6	1246353	1246358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014834	CGA	3	9	1246371	1246379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_014834	TCG	2	6	1247012	1247017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014834	TCGT	2	8	1247028	1247035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_014834	GCC	3	9	1247082	1247090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_014834	TCA	2	6	1247134	1247139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_014834	GAG	2	6	1248430	1248435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014834	GAG	2	6	1248504	1248509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014834	CTC	2	6	1248527	1248532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_014834	GCT	2	6	1248541	1248546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_014834	TGA	2	6	1248552	1248557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_014834	CAA	2	6	1248566	1248571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_014834	GGA	2	6	1250179	1250184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014834	CTG	2	6	1250218	1250223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_014834	CG	3	6	1250233	1250238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_014834	GGT	2	6	1250251	1250256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014834	CG	3	6	1250299	1250304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_014834	GCA	2	6	1251107	1251112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_014834	TCT	2	6	1252881	1252886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_014834	GC	3	6	1252934	1252939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_014834	AT	3	6	1252986	1252991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014834	ACC	2	6	1253040	1253045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_014834	TTC	2	6	1253078	1253083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014834	AT	3	6	1253118	1253123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014834	GTC	2	6	1253140	1253145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_014834	AT	3	6	1253156	1253161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014834	AGG	2	6	1253167	1253172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_014834	CGGCG	2	10	1254441	1254450	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3533	NC_014834	CCA	2	6	1254467	1254472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_014834	CG	3	6	1254512	1254517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_014834	GCC	2	6	1254518	1254523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_014834	GA	3	6	1254552	1254557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_014834	GAG	2	6	1254993	1254998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014834	GCT	2	6	1255071	1255076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_014834	TGC	2	6	1255081	1255086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_014834	TCGC	2	8	1255090	1255097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_014834	CG	3	6	1255166	1255171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_014834	CCG	2	6	1255404	1255409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_014834	AT	3	6	1255439	1255444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014834	AAT	2	6	1255448	1255453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014834	TA	3	6	1255456	1255461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014834	TCCGA	2	10	1260043	1260052	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3547	NC_014834	GGAG	3	12	1260805	1260816	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_014834	ATC	2	6	1260851	1260856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_014834	GCATC	3	15	1260888	1260902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3550	NC_014834	GCAGC	2	10	1260903	1260912	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3551	NC_014834	GC	3	6	1262905	1262910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_014834	AAC	2	6	1264145	1264150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_014834	GAAC	2	8	1264218	1264225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_014834	TC	3	6	1264241	1264246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_014834	CG	3	6	1264313	1264318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_014834	TGA	2	6	1264326	1264331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014834	CGG	2	6	1264338	1264343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_014834	TCGAT	2	10	1265510	1265519	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3559	NC_014834	GC	3	6	1266097	1266102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_014834	CAG	2	6	1266114	1266119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_014834	CGC	2	6	1266120	1266125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_014834	CAA	2	6	1266158	1266163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_014834	CGA	2	6	1266172	1266177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_014834	CTC	2	6	1269164	1269169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_014834	CG	3	6	1269188	1269193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_014834	TGC	2	6	1269197	1269202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_014834	ACG	2	6	1270013	1270018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_014834	CG	3	6	1270031	1270036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_014834	CGG	2	6	1270050	1270055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_014834	CGC	2	6	1270071	1270076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_014834	CG	3	6	1270091	1270096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_014834	CGG	2	6	1271232	1271237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_014834	ATT	2	6	1271295	1271300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014834	TAT	2	6	1271314	1271319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_014834	GCG	3	9	1271323	1271331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_014834	CGG	2	6	1271927	1271932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_014834	ACG	2	6	1271941	1271946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_014834	GC	3	6	1271953	1271958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_014834	CAT	2	6	1272009	1272014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_014834	CGT	2	6	1272023	1272028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_014834	GGT	2	6	1272046	1272051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_014834	GCA	2	6	1273348	1273353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_014834	CG	3	6	1274268	1274273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_014834	GCC	2	6	1274286	1274291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_014834	CGG	2	6	1275853	1275858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_014834	CCG	2	6	1275869	1275874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_014834	CGC	2	6	1278150	1278155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_014834	TTGG	2	8	1278157	1278164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014834	CGC	3	9	1278216	1278224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_014834	GCG	2	6	1278264	1278269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_014834	TCGA	2	8	1278282	1278289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_014834	CTC	2	6	1278326	1278331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_014834	TGC	2	6	1278373	1278378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_014834	TGG	2	6	1278401	1278406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014834	TCGC	2	8	1278411	1278418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_014834	GAG	2	6	1278435	1278440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014834	TGC	2	6	1278481	1278486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_014834	TGCTG	2	10	1278513	1278522	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3599	NC_014834	TGG	2	6	1279413	1279418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014834	GC	3	6	1279431	1279436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_014834	CAG	2	6	1279444	1279449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_014834	CTG	2	6	1279495	1279500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_014834	GCCG	2	8	1279521	1279528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_014834	GTT	2	6	1279542	1279547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014834	CTT	2	6	1279548	1279553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_014834	A	6	6	1279604	1279609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014834	GCG	2	6	1284372	1284377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_014834	GC	4	8	1284389	1284396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_014834	CGC	2	6	1284445	1284450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_014834	GCG	2	6	1284454	1284459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_014834	AGC	2	6	1284487	1284492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_014834	GCT	2	6	1285549	1285554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_014834	GCCG	2	8	1285589	1285596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_014834	CGAT	2	8	1285659	1285666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_014834	GAC	2	6	1285701	1285706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_014834	GCTGC	2	10	1286739	1286748	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3620	NC_014834	GCT	2	6	1288219	1288224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_014834	GGC	2	6	1288263	1288268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_014834	TCG	2	6	1288309	1288314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_014834	TTCT	2	8	1289324	1289331	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_014834	GGAGGG	2	12	1289343	1289354	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_014834	AGGC	2	8	1289366	1289373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_014834	GGGGT	2	10	1289374	1289383	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_014834	AGCG	2	8	1292103	1292110	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_014834	CGCA	2	8	1292207	1292214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_014834	GGAGG	2	10	1292262	1292271	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_014834	TCC	2	6	1292391	1292396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_014834	CGC	3	9	1293523	1293531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3632	NC_014834	GAT	2	6	1294839	1294844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3634	NC_014834	CGC	2	6	1294859	1294864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3635	NC_014834	GC	3	6	1294869	1294874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3636	NC_014834	CCGG	2	8	1294878	1294885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3643	NC_014834	TCC	2	6	1295097	1295102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3752	NC_014834	TCGCG	2	10	1334897	1334906	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3754	NC_014834	CAA	2	6	1338274	1338279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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