MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_014834	CGC	2	6	5116538	5116543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15502	NC_014834	GCC	2	6	5116618	5116623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15503	NC_014834	CG	3	6	5120199	5120204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15504	NC_014834	GAGAG	2	10	5121367	5121376	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_014834	CG	4	8	5121430	5121437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15506	NC_014834	TGG	2	6	5121500	5121505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_014834	AG	3	6	5122627	5122632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_014834	CCTT	2	8	5122655	5122662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15509	NC_014834	CGA	2	6	5122680	5122685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_014834	CCG	2	6	5122707	5122712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15511	NC_014834	GCG	2	6	5122766	5122771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_014834	CCA	2	6	5122830	5122835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15513	NC_014834	GCG	2	6	5122842	5122847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15514	NC_014834	GCG	2	6	5122854	5122859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_014834	TGC	2	6	5122866	5122871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_014834	CGC	2	6	5122875	5122880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15517	NC_014834	CTG	2	6	5122900	5122905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_014834	TCC	2	6	5122912	5122917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15519	NC_014834	CTG	2	6	5122928	5122933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_014834	CGCA	2	8	5122965	5122972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15521	NC_014834	CCG	2	6	5123048	5123053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15522	NC_014834	GCCG	2	8	5123074	5123081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15523	NC_014834	CG	3	6	5123086	5123091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15524	NC_014834	GCC	2	6	5125506	5125511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15525	NC_014834	TTG	2	6	5125578	5125583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15526	NC_014834	TCG	2	6	5125596	5125601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_014834	ATCG	2	8	5125646	5125653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15528	NC_014834	TGA	2	6	5125657	5125662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_014834	CGGA	2	8	5128957	5128964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15530	NC_014834	CGAT	2	8	5128980	5128987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15531	NC_014834	GTC	2	6	5129008	5129013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15532	NC_014834	CGC	2	6	5131260	5131265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15533	NC_014834	TCC	2	6	5131313	5131318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15534	NC_014834	TTA	2	6	5131363	5131368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_014834	AG	3	6	5134177	5134182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_014834	ACG	2	6	5134590	5134595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_014834	TCA	2	6	5134609	5134614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_014834	GTT	2	6	5134688	5134693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_014834	GC	3	6	5134697	5134702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15540	NC_014834	CGG	3	9	5134708	5134716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_014834	GTG	2	6	5134730	5134735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_014834	GCC	2	6	5134754	5134759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15543	NC_014834	CGGT	2	8	5134790	5134797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15544	NC_014834	TGA	2	6	5134809	5134814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_014834	GGT	2	6	5136180	5136185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_014834	GCT	3	9	5137386	5137394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_014834	CGT	2	6	5137414	5137419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_014834	GCGA	2	8	5137436	5137443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15549	NC_014834	GCC	2	6	5137516	5137521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15550	NC_014834	CGA	2	6	5137543	5137548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15551	NC_014834	TCG	2	6	5137633	5137638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_014834	GCA	3	9	5137712	5137720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_014834	TGC	2	6	5137751	5137756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_014834	GCA	2	6	5137761	5137766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15555	NC_014834	AGC	2	6	5137781	5137786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_014834	CAA	2	6	5137825	5137830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_014834	CAG	2	6	5137836	5137841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15558	NC_014834	CGG	2	6	5138354	5138359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_014834	CG	3	6	5138362	5138367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15560	NC_014834	CCG	2	6	5138373	5138378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15561	NC_014834	TTCG	2	8	5138381	5138388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15562	NC_014834	GATT	2	8	5138408	5138415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_014834	AAG	2	6	5138423	5138428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_014834	TCC	2	6	5139095	5139100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15565	NC_014834	CGC	2	6	5139152	5139157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15566	NC_014834	CA	3	6	5139237	5139242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15567	NC_014834	AACGCC	2	12	5139270	5139281	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15568	NC_014834	TG	4	8	5139300	5139307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_014834	CGG	2	6	5139346	5139351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_014834	CTG	2	6	5139361	5139366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15571	NC_014834	CG	4	8	5139369	5139376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15572	NC_014834	CCG	2	6	5139377	5139382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15573	NC_014834	CCT	2	6	5141041	5141046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15574	NC_014834	CT	3	6	5142163	5142168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15575	NC_014834	GAC	2	6	5143056	5143061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_014834	GC	3	6	5143098	5143103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15577	NC_014834	CAG	2	6	5143207	5143212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15578	NC_014834	TGT	2	6	5143730	5143735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_014834	CGC	2	6	5143736	5143741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15580	NC_014834	TCG	2	6	5147620	5147625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15581	NC_014834	CG	3	6	5147674	5147679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15582	NC_014834	CGAAG	2	10	5147731	5147740	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15583	NC_014834	GGGGT	3	15	5147749	5147763	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_014834	CGG	2	6	5147776	5147781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15585	NC_014834	CACCC	2	10	5147795	5147804	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
15586	NC_014834	ACCCTC	2	12	5147822	5147833	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15587	NC_014834	AGC	2	6	5147849	5147854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15588	NC_014834	GC	3	6	5148915	5148920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15589	NC_014834	CGC	2	6	5148925	5148930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15590	NC_014834	TCG	2	6	5150095	5150100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15591	NC_014834	GCG	2	6	5152952	5152957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15592	NC_014834	CGG	2	6	5154589	5154594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_014834	GCC	2	6	5156109	5156114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15594	NC_014834	TGA	2	6	5156152	5156157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_014834	TC	3	6	5157059	5157064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15596	NC_014834	CTT	2	6	5157108	5157113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15597	NC_014834	GAC	2	6	5157320	5157325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15598	NC_014834	GGC	2	6	5157335	5157340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15599	NC_014834	GAAAC	2	10	5157346	5157355	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15600	NC_014834	CCGG	2	8	5157365	5157372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15601	NC_014834	CGT	2	6	5157418	5157423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_014834	GCGA	2	8	5157425	5157432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15603	NC_014834	CG	4	8	5157525	5157532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15604	NC_014834	GCGAA	2	10	5157549	5157558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15605	NC_014834	GTT	2	6	5157606	5157611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_014834	TGA	2	6	5157626	5157631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_014834	GCG	2	6	5157642	5157647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_014834	CGCA	2	8	5157679	5157686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15609	NC_014834	GCC	2	6	5157745	5157750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15610	NC_014834	GGT	2	6	5159179	5159184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_014834	GCC	2	6	5159195	5159200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15612	NC_014834	GCG	2	6	5159201	5159206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15613	NC_014834	TCG	2	6	5161657	5161662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15614	NC_014834	CGC	2	6	5163245	5163250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15615	NC_014834	GGC	2	6	5163257	5163262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_014834	GGTG	2	8	5163268	5163275	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_014834	TGC	2	6	5163280	5163285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15618	NC_014834	GCG	2	6	5163322	5163327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15619	NC_014834	TGC	2	6	5163602	5163607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15620	NC_014834	T	6	6	5163663	5163668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_014834	GACA	2	8	5163789	5163796	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15622	NC_014834	CG	3	6	5163799	5163804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15623	NC_014834	GAG	2	6	5163810	5163815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_014834	CG	3	6	5163819	5163824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15625	NC_014834	GAT	2	6	5163832	5163837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_014834	CG	3	6	5163847	5163852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15627	NC_014834	ACC	2	6	5165744	5165749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15628	NC_014834	TAC	2	6	5165776	5165781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15630	NC_014834	GGC	2	6	5166734	5166739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15633	NC_014834	ACATC	2	10	5166975	5166984	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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15757	NC_014834	GCC	2	6	5192498	5192503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15758	NC_014834	ACGG	2	8	5192552	5192559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15759	NC_014834	C	6	6	5192560	5192565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15760	NC_014834	CGG	2	6	5192589	5192594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15761	NC_014834	CGG	2	6	5193389	5193394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15762	NC_014834	CGA	3	9	5193459	5193467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15765	NC_014834	CG	3	6	5193576	5193581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15885	NC_014834	CCGAAT	2	12	5231319	5231330	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15999	NC_014834	T	7	7	5268486	5268492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16000	NC_014834	CGAT	2	8	5271669	5271676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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