MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_014834	TC	3	6	4842092	4842097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14502	NC_014834	AGG	2	6	4842098	4842103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_014834	T	6	6	4842104	4842109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_014834	CTT	2	6	4842486	4842491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14505	NC_014834	GTTTT	2	10	4842551	4842560	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_014834	CGC	2	6	4842564	4842569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14507	NC_014834	CCGC	2	8	4842725	4842732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14508	NC_014834	GC	3	6	4842787	4842792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14509	NC_014834	GAC	2	6	4842806	4842811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_014834	CGC	2	6	4843059	4843064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14511	NC_014834	CG	3	6	4843115	4843120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14512	NC_014834	ACCC	2	8	4843128	4843135	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14513	NC_014834	CGT	2	6	4843138	4843143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_014834	TGCG	2	8	4843151	4843158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14515	NC_014834	CG	3	6	4843198	4843203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14516	NC_014834	CGCC	2	8	4843312	4843319	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14517	NC_014834	GTT	2	6	4843339	4843344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_014834	GAAC	2	8	4843421	4843428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14519	NC_014834	CG	3	6	4843433	4843438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14520	NC_014834	CCG	2	6	4843450	4843455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14521	NC_014834	TGCG	2	8	4843467	4843474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14522	NC_014834	GAAG	2	8	4843509	4843516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_014834	GC	3	6	4843526	4843531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14524	NC_014834	CG	3	6	4843541	4843546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14525	NC_014834	TCGC	2	8	4843570	4843577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14526	NC_014834	GC	3	6	4846663	4846668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14527	NC_014834	CGA	2	6	4846675	4846680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14528	NC_014834	CG	3	6	4846695	4846700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14529	NC_014834	GGCAC	2	10	4846736	4846745	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14530	NC_014834	CCG	3	9	4846825	4846833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14531	NC_014834	GCA	2	6	4846846	4846851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_014834	GCG	2	6	4846863	4846868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_014834	CGT	2	6	4847256	4847261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_014834	CGA	2	6	4847304	4847309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14535	NC_014834	GCC	2	6	4847310	4847315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14536	NC_014834	CGA	2	6	4847337	4847342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_014834	AAC	2	6	4847354	4847359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_014834	CATTCA	2	12	4847432	4847443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_014834	TTC	2	6	4847561	4847566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_014834	GAC	2	6	4847607	4847612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_014834	CCG	2	6	4848445	4848450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14542	NC_014834	GC	3	6	4848453	4848458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14543	NC_014834	GTC	2	6	4848459	4848464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14544	NC_014834	AGCG	2	8	4848499	4848506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14545	NC_014834	CG	3	6	4848578	4848583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14546	NC_014834	CAG	2	6	4848621	4848626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14547	NC_014834	CG	4	8	4848628	4848635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14548	NC_014834	CAC	2	6	4848640	4848645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14549	NC_014834	AC	3	6	4848644	4848649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14550	NC_014834	GC	3	6	4848663	4848668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14551	NC_014834	TCGC	2	8	4848738	4848745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14552	NC_014834	GAG	2	6	4848774	4848779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_014834	ATG	2	6	4848782	4848787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_014834	GC	3	6	4848825	4848830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14555	NC_014834	GC	3	6	4848832	4848837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14556	NC_014834	GC	3	6	4849384	4849389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14557	NC_014834	GGC	2	6	4849453	4849458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_014834	GGCGT	2	10	4849478	4849487	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14559	NC_014834	GCC	2	6	4849490	4849495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14560	NC_014834	ACC	2	6	4849500	4849505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14561	NC_014834	TC	3	6	4850457	4850462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14562	NC_014834	GCCGC	2	10	4850958	4850967	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14563	NC_014834	CCG	2	6	4851040	4851045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14564	NC_014834	CG	3	6	4851044	4851049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14565	NC_014834	GCGACG	2	12	4854163	4854174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14566	NC_014834	CG	3	6	4854173	4854178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14567	NC_014834	TGG	2	6	4854230	4854235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14569	NC_014834	CGA	2	6	4854338	4854343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_014834	CGG	2	6	4854386	4854391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14571	NC_014834	CGC	2	6	4854392	4854397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14572	NC_014834	CGG	2	6	4854407	4854412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14573	NC_014834	GAC	2	6	4854435	4854440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14574	NC_014834	GAC	2	6	4856726	4856731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14575	NC_014834	CGA	2	6	4856754	4856759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_014834	CGG	2	6	4856764	4856769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14577	NC_014834	CG	3	6	4857876	4857881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14578	NC_014834	AGG	2	6	4857906	4857911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_014834	CGT	2	6	4859302	4859307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_014834	TGC	2	6	4859396	4859401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14582	NC_014834	CCG	2	6	4859469	4859474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14583	NC_014834	TGA	2	6	4859521	4859526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_014834	TGC	2	6	4859568	4859573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_014834	ACCA	2	8	4859632	4859639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14586	NC_014834	CCG	2	6	4859640	4859645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14587	NC_014834	TGA	2	6	4859692	4859697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_014834	GC	3	6	4859746	4859751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14589	NC_014834	GCG	2	6	4859797	4859802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14590	NC_014834	C	7	7	4860174	4860180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14591	NC_014834	CGC	2	6	4860222	4860227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14592	NC_014834	TTG	2	6	4862031	4862036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_014834	GCG	2	6	4862045	4862050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_014834	GC	3	6	4862074	4862079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14595	NC_014834	CGGC	2	8	4862151	4862158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14596	NC_014834	CGG	2	6	4863965	4863970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14597	NC_014834	A	6	6	4863978	4863983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_014834	C	6	6	4863993	4863998	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14599	NC_014834	G	6	6	4864002	4864007	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_014834	GCA	2	6	4864052	4864057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14601	NC_014834	CCG	2	6	4864072	4864077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14602	NC_014834	TGA	2	6	4864087	4864092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_014834	CCCTC	2	10	4865697	4865706	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14604	NC_014834	GGGGT	2	10	4865733	4865742	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_014834	CACCC	2	10	4865791	4865800	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14606	NC_014834	CGC	2	6	4865801	4865806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14607	NC_014834	CCCTCC	2	12	4865823	4865834	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
14608	NC_014834	CCG	2	6	4867151	4867156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14609	NC_014834	GTTCC	2	10	4867158	4867167	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14610	NC_014834	CGACCA	2	12	4867195	4867206	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14611	NC_014834	CCG	2	6	4867227	4867232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14612	NC_014834	CG	3	6	4867251	4867256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14613	NC_014834	ACG	2	6	4869142	4869147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14614	NC_014834	TCT	2	6	4869150	4869155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14615	NC_014834	CTG	2	6	4869184	4869189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_014834	ATG	2	6	4869223	4869228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_014834	CGA	2	6	4871179	4871184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_014834	GCT	2	6	4871196	4871201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14619	NC_014834	GCG	2	6	4871208	4871213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14620	NC_014834	TTC	2	6	4871224	4871229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14621	NC_014834	CCA	2	6	4872229	4872234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14622	NC_014834	TGA	2	6	4872278	4872283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_014834	CTGA	2	8	4872294	4872301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14624	NC_014834	GGC	2	6	4872312	4872317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14625	NC_014834	GAC	2	6	4872359	4872364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_014834	ACG	3	9	4872388	4872396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14627	NC_014834	ACG	2	6	4873794	4873799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14629	NC_014834	CCG	2	6	4873821	4873826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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