MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014834	GCAG	2	8	4691350	4691357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14002	NC_014834	GAG	2	6	4691372	4691377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_014834	GC	3	6	4691459	4691464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14004	NC_014834	CTC	2	6	4691465	4691470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_014834	GCC	2	6	4693151	4693156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14006	NC_014834	TGC	2	6	4693190	4693195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_014834	GCA	2	6	4693204	4693209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_014834	TCC	2	6	4699307	4699312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14009	NC_014834	TGC	2	6	4699382	4699387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_014834	TC	3	6	4700327	4700332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14011	NC_014834	GCCGA	2	10	4700394	4700403	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14012	NC_014834	GTC	2	6	4702384	4702389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_014834	CGG	2	6	4702409	4702414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_014834	ATC	2	6	4702631	4702636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_014834	CA	3	6	4702638	4702643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14016	NC_014834	GCG	2	6	4702646	4702651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_014834	GCC	2	6	4702653	4702658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14018	NC_014834	CGGC	2	8	4702672	4702679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14019	NC_014834	TGC	2	6	4704096	4704101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_014834	CAC	2	6	4704143	4704148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_014834	GCC	2	6	4704225	4704230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14022	NC_014834	CGA	2	6	4706242	4706247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_014834	CTCCC	2	10	4707097	4707106	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14024	NC_014834	GGGGGT	2	12	4707124	4707135	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_014834	GCCTC	2	10	4707147	4707156	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14026	NC_014834	C	7	7	4707163	4707169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14027	NC_014834	G	6	6	4707189	4707194	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_014834	TCA	2	6	4707226	4707231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_014834	CCG	2	6	4710185	4710190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14030	NC_014834	GC	3	6	4710193	4710198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14031	NC_014834	GAT	2	6	4710245	4710250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_014834	CGGC	2	8	4710281	4710288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14033	NC_014834	TA	3	6	4710333	4710338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_014834	AGG	2	6	4710423	4710428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_014834	TC	3	6	4713239	4713244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14036	NC_014834	GGCC	2	8	4713256	4713263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14037	NC_014834	AAGA	2	8	4713300	4713307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_014834	TCA	2	6	4714118	4714123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_014834	GC	3	6	4715098	4715103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14040	NC_014834	CGG	2	6	4715110	4715115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_014834	CCA	2	6	4717789	4717794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14042	NC_014834	CGGG	2	8	4717863	4717870	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14043	NC_014834	TCA	2	6	4717889	4717894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_014834	ACCA	2	8	4717945	4717952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14045	NC_014834	ACA	2	6	4719096	4719101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_014834	TCGA	2	8	4719119	4719126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14047	NC_014834	TGC	2	6	4719147	4719152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_014834	CGG	2	6	4719173	4719178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_014834	ATC	2	6	4719182	4719187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_014834	CGG	2	6	4719288	4719293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_014834	GC	3	6	4719391	4719396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14052	NC_014834	CTT	2	6	4719450	4719455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_014834	GCC	2	6	4719599	4719604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14054	NC_014834	TTG	2	6	4719698	4719703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_014834	CCT	2	6	4719910	4719915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14056	NC_014834	GAA	2	6	4719946	4719951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_014834	TGG	2	6	4719963	4719968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_014834	CG	3	6	4719993	4719998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14059	NC_014834	ATT	2	6	4720111	4720116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_014834	CGC	2	6	4720171	4720176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_014834	TCC	2	6	4720209	4720214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14062	NC_014834	GGC	2	6	4721272	4721277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_014834	TCCGA	2	10	4723061	4723070	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14064	NC_014834	CGA	2	6	4723369	4723374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_014834	GAA	2	6	4723389	4723394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_014834	TGC	2	6	4723422	4723427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_014834	CGC	2	6	4723434	4723439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14068	NC_014834	ACA	2	6	4723456	4723461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_014834	CCA	2	6	4724345	4724350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14070	NC_014834	GGC	2	6	4724372	4724377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_014834	TTCT	2	8	4724684	4724691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14072	NC_014834	CCAA	2	8	4724708	4724715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14073	NC_014834	CGGC	2	8	4724734	4724741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14074	NC_014834	GCG	2	6	4724786	4724791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_014834	GGC	2	6	4724816	4724821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_014834	GC	3	6	4724836	4724841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14077	NC_014834	GCA	2	6	4725323	4725328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_014834	CAAA	2	8	4725382	4725389	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14079	NC_014834	CGTTT	2	10	4725412	4725421	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14080	NC_014834	CGG	2	6	4725434	4725439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14081	NC_014834	CGG	2	6	4728342	4728347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_014834	CG	3	6	4728357	4728362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14083	NC_014834	GAGC	2	8	4728364	4728371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14084	NC_014834	GC	3	6	4728379	4728384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14085	NC_014834	GC	3	6	4728421	4728426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14086	NC_014834	TTTG	2	8	4728434	4728441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_014834	GGC	2	6	4728453	4728458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_014834	GA	3	6	4728491	4728496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_014834	TC	3	6	4728685	4728690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14090	NC_014834	GCA	2	6	4728752	4728757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_014834	CCG	2	6	4728800	4728805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14092	NC_014834	CAA	2	6	4728870	4728875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_014834	CCG	2	6	4728876	4728881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14094	NC_014834	ATT	2	6	4728886	4728891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_014834	AGC	2	6	4728903	4728908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_014834	CG	3	6	4728909	4728914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14097	NC_014834	ATG	2	6	4728917	4728922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_014834	CG	3	6	4728930	4728935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14099	NC_014834	GCGAC	2	10	4728944	4728953	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14100	NC_014834	ACGTA	2	10	4729634	4729643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14101	NC_014834	CA	3	6	4729655	4729660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14102	NC_014834	CTA	2	6	4731657	4731662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_014834	CGG	2	6	4731698	4731703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_014834	GC	3	6	4731724	4731729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_014834	CCAG	2	8	4731742	4731749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14106	NC_014834	CCG	3	9	4731800	4731808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14107	NC_014834	GTG	2	6	4731851	4731856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_014834	CAT	2	6	4731900	4731905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_014834	TAT	2	6	4731906	4731911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_014834	GCC	2	6	4732638	4732643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_014834	TCG	2	6	4732667	4732672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_014834	TTGGG	2	10	4732698	4732707	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_014834	GCG	2	6	4734245	4734250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_014834	GACA	2	8	4734324	4734331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14115	NC_014834	CCA	2	6	4734370	4734375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14116	NC_014834	CG	3	6	4734480	4734485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14117	NC_014834	GAA	2	6	4734505	4734510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_014834	CGA	2	6	4736829	4736834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_014834	CGT	2	6	4736849	4736854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_014834	TCC	2	6	4736889	4736894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14121	NC_014834	AGGGTT	2	12	4736935	4736946	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_014834	GTTG	2	8	4737060	4737067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_014834	GCTG	2	8	4737095	4737102	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14124	NC_014834	CCAG	2	8	4738799	4738806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14125	NC_014834	CCG	2	6	4738818	4738823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14126	NC_014834	TCGGCC	2	12	4738854	4738865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14127	NC_014834	GGCC	2	8	4738867	4738874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14128	NC_014834	GCG	2	6	4739181	4739186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_014834	CG	3	6	4739199	4739204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14130	NC_014834	CGC	2	6	4739228	4739233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14255	NC_014834	CTGG	2	8	4768229	4768236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14256	NC_014834	CGG	2	6	4770422	4770427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14500	NC_014834	CGCA	2	8	4842074	4842081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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