MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014834	ACC	2	6	4493954	4493959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_014834	AGG	2	6	4494005	4494010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_014834	CGC	2	6	4494031	4494036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13504	NC_014834	TCT	2	6	4494047	4494052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_014834	CGG	2	6	4494092	4494097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_014834	CGT	2	6	4494108	4494113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_014834	CGA	2	6	4494117	4494122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_014834	GTC	2	6	4494141	4494146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13509	NC_014834	CCG	2	6	4494155	4494160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13510	NC_014834	CGA	2	6	4494166	4494171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_014834	GC	3	6	4494187	4494192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13512	NC_014834	CGC	3	9	4494190	4494198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13513	NC_014834	GATCGC	2	12	4494218	4494229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_014834	CG	4	8	4494285	4494292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13515	NC_014834	GCC	2	6	4494295	4494300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13516	NC_014834	GAT	2	6	4494313	4494318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_014834	CGG	2	6	4494616	4494621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_014834	GGA	2	6	4494646	4494651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_014834	GCA	2	6	4494829	4494834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_014834	CGT	2	6	4494900	4494905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_014834	GTC	2	6	4494961	4494966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13522	NC_014834	CACG	2	8	4494980	4494987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13523	NC_014834	TGT	2	6	4495009	4495014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_014834	TGT	2	6	4495024	4495029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_014834	GCG	2	6	4495071	4495076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_014834	CCT	2	6	4495135	4495140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13527	NC_014834	AGG	3	9	4495144	4495152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_014834	GGA	2	6	4495156	4495161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_014834	GA	3	6	4495160	4495165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_014834	CT	3	6	4495188	4495193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13531	NC_014834	CTG	2	6	4496621	4496626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_014834	CG	3	6	4496635	4496640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13533	NC_014834	TCC	2	6	4497006	4497011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13534	NC_014834	ACG	2	6	4500369	4500374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_014834	CGAC	2	8	4500375	4500382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13536	NC_014834	CGG	2	6	4500383	4500388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_014834	CCCG	2	8	4500399	4500406	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13538	NC_014834	TCG	2	6	4500525	4500530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_014834	ACTCA	2	10	4500849	4500858	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13540	NC_014834	CGAC	2	8	4500985	4500992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13541	NC_014834	CGG	2	6	4501016	4501021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_014834	TTGC	2	8	4503092	4503099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13543	NC_014834	CAG	2	6	4503126	4503131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_014834	TCG	2	6	4504088	4504093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_014834	CGA	2	6	4504111	4504116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_014834	TCCG	2	8	4506961	4506968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13547	NC_014834	GGA	2	6	4507004	4507009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_014834	CGC	2	6	4507031	4507036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13549	NC_014834	GAC	2	6	4507077	4507082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_014834	GCTC	2	8	4507084	4507091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13551	NC_014834	GCA	2	6	4507105	4507110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_014834	TCG	2	6	4507491	4507496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_014834	GCG	2	6	4507591	4507596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_014834	GGT	2	6	4507597	4507602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_014834	CGG	2	6	4507609	4507614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_014834	GCAACC	2	12	4507624	4507635	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13557	NC_014834	GACC	2	8	4507658	4507665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13558	NC_014834	GC	3	6	4507702	4507707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13559	NC_014834	CGG	2	6	4507712	4507717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_014834	CAT	2	6	4508555	4508560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_014834	GAG	2	6	4508564	4508569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_014834	CGT	2	6	4508589	4508594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_014834	CGA	2	6	4508611	4508616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_014834	GCTTC	2	10	4508654	4508663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13565	NC_014834	ATG	2	6	4508671	4508676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_014834	C	6	6	4509105	4509110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13567	NC_014834	GCA	2	6	4509139	4509144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13568	NC_014834	CAG	2	6	4509218	4509223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13569	NC_014834	GAC	2	6	4509258	4509263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_014834	CCT	2	6	4511231	4511236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13571	NC_014834	TCC	2	6	4511997	4512002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13572	NC_014834	TGGA	2	8	4514108	4514115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_014834	GGT	2	6	4514130	4514135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_014834	GGC	3	9	4514136	4514144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_014834	GC	3	6	4514143	4514148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13576	NC_014834	TCT	2	6	4514193	4514198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13577	NC_014834	GATG	2	8	4514208	4514215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_014834	ATG	2	6	4514260	4514265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_014834	CGA	2	6	4515607	4515612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_014834	CAA	2	6	4515709	4515714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_014834	CGG	2	6	4515770	4515775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_014834	GAG	2	6	4515801	4515806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_014834	CGCCC	2	10	4520107	4520116	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13584	NC_014834	GTGC	2	8	4521116	4521123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13585	NC_014834	GTC	2	6	4521170	4521175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13586	NC_014834	GTC	2	6	4521245	4521250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_014834	GTC	2	6	4521260	4521265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13588	NC_014834	CAG	2	6	4524242	4524247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13589	NC_014834	AGC	2	6	4524252	4524257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_014834	CCG	2	6	4524294	4524299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13591	NC_014834	GAC	2	6	4524396	4524401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_014834	CGG	2	6	4524410	4524415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_014834	CGC	2	6	4524432	4524437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13594	NC_014834	CGGC	2	8	4524451	4524458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13595	NC_014834	G	6	6	4524463	4524468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_014834	GGCA	2	8	4528080	4528087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13597	NC_014834	GCCG	2	8	4528127	4528134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13598	NC_014834	CGG	2	6	4528190	4528195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13599	NC_014834	GCG	2	6	4528218	4528223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_014834	CGG	3	9	4528247	4528255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13601	NC_014834	CG	5	10	4528322	4528331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13602	NC_014834	ACA	2	6	4528375	4528380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_014834	GAA	2	6	4531607	4531612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_014834	GATT	2	8	4531672	4531679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_014834	GC	3	6	4531793	4531798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13606	NC_014834	CTC	2	6	4531799	4531804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13607	NC_014834	CCG	2	6	4536724	4536729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13608	NC_014834	GATC	2	8	4536799	4536806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13609	NC_014834	TCG	2	6	4536834	4536839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_014834	CTGG	2	8	4536893	4536900	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13611	NC_014834	GCG	2	6	4536913	4536918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_014834	CTTGAT	2	12	4536923	4536934	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13613	NC_014834	GCAC	2	8	4536943	4536950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13614	NC_014834	CGC	2	6	4536976	4536981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13615	NC_014834	AC	3	6	4537012	4537017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13616	NC_014834	CCGG	2	8	4537820	4537827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13617	NC_014834	TGT	2	6	4537880	4537885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_014834	CCG	2	6	4537913	4537918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13619	NC_014834	CATG	2	8	4537946	4537953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13620	NC_014834	CGTG	2	8	4537965	4537972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13621	NC_014834	GCC	2	6	4538913	4538918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13622	NC_014834	GCC	2	6	4538928	4538933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13623	NC_014834	GCA	2	6	4538941	4538946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_014834	ACG	2	6	4538975	4538980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13625	NC_014834	CGA	2	6	4538992	4538997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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