MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014834	CCGC	2	8	4323871	4323878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13002	NC_014834	AAGC	2	8	4323891	4323898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13003	NC_014834	TCC	2	6	4324306	4324311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13004	NC_014834	GA	3	6	4324313	4324318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_014834	GCT	2	6	4324360	4324365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_014834	GCC	2	6	4324420	4324425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13007	NC_014834	AC	3	6	4324511	4324516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_014834	CGA	2	6	4324582	4324587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_014834	TCGA	2	8	4327655	4327662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13010	NC_014834	AGC	2	6	4327689	4327694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_014834	CGGA	2	8	4329280	4329287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13012	NC_014834	ACT	2	6	4330665	4330670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_014834	CGA	2	6	4331415	4331420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_014834	CGT	2	6	4331431	4331436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_014834	TCGCT	2	10	4331457	4331466	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13016	NC_014834	CG	3	6	4331537	4331542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13017	NC_014834	GCT	2	6	4333272	4333277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_014834	CGG	3	9	4333283	4333291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_014834	GCA	2	6	4333306	4333311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_014834	GGA	2	6	4333340	4333345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_014834	ATC	2	6	4333403	4333408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_014834	CTG	2	6	4333412	4333417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_014834	TTC	2	6	4333450	4333455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_014834	GCCC	2	8	4333520	4333527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13025	NC_014834	CCGG	2	8	4333533	4333540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_014834	CCCGG	2	10	4334399	4334408	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13027	NC_014834	GC	3	6	4334569	4334574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_014834	TCGA	2	8	4334969	4334976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13029	NC_014834	TCA	2	6	4334977	4334982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_014834	CGC	2	6	4335093	4335098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13031	NC_014834	CCG	2	6	4335143	4335148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13032	NC_014834	TC	3	6	4336074	4336079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13033	NC_014834	GCCG	2	8	4338778	4338785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13034	NC_014834	GCCA	2	8	4339841	4339848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_014834	GC	3	6	4339859	4339864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_014834	CGG	2	6	4339875	4339880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_014834	GTG	2	6	4339914	4339919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_014834	GAT	2	6	4339965	4339970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_014834	CCG	2	6	4339997	4340002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_014834	CGC	3	9	4340011	4340019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_014834	CGC	2	6	4340023	4340028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13042	NC_014834	CGA	2	6	4340047	4340052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_014834	GCC	2	6	4340147	4340152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_014834	GTC	3	9	4340394	4340402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_014834	GCG	2	6	4340444	4340449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_014834	CGGCT	2	10	4340480	4340489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13047	NC_014834	CCA	2	6	4340496	4340501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13048	NC_014834	GCG	2	6	4340558	4340563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_014834	CGC	2	6	4340599	4340604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13050	NC_014834	GCGG	2	8	4340636	4340643	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13051	NC_014834	CTC	2	6	4341426	4341431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_014834	TCTCCC	2	12	4343075	4343086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_014834	CCCCGC	2	12	4343138	4343149	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
13054	NC_014834	GGGGA	2	10	4343163	4343172	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_014834	CT	3	6	4343201	4343206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13056	NC_014834	GACAC	2	10	4347015	4347024	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13057	NC_014834	G	6	6	4347046	4347051	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_014834	AGCG	2	8	4347060	4347067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_014834	ATC	2	6	4347087	4347092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_014834	GC	4	8	4347114	4347121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13061	NC_014834	GGC	2	6	4353516	4353521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_014834	CCG	2	6	4353523	4353528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_014834	CGC	2	6	4353610	4353615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_014834	GGC	2	6	4353691	4353696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_014834	TCG	2	6	4353714	4353719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_014834	GGA	2	6	4353749	4353754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_014834	GCA	3	9	4354570	4354578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_014834	GAG	2	6	4354606	4354611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_014834	CCT	2	6	4354702	4354707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_014834	TGTACT	2	12	4354719	4354730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13071	NC_014834	CA	3	6	4354762	4354767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13072	NC_014834	CGG	2	6	4354787	4354792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_014834	GC	3	6	4356680	4356685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13074	NC_014834	CGG	2	6	4356686	4356691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_014834	GC	3	6	4356715	4356720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13076	NC_014834	GCC	2	6	4356774	4356779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13077	NC_014834	GC	3	6	4356781	4356786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_014834	G	6	6	4356787	4356792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_014834	CAC	2	6	4356793	4356798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13080	NC_014834	CG	3	6	4356802	4356807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_014834	AAC	2	6	4356865	4356870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_014834	GAAGCA	2	12	4356879	4356890	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13083	NC_014834	TG	3	6	4358212	4358217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_014834	CCG	2	6	4359308	4359313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13085	NC_014834	GA	4	8	4361308	4361315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_014834	CGC	2	6	4361325	4361330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13087	NC_014834	GCG	2	6	4361334	4361339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_014834	AG	3	6	4361355	4361360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_014834	GCC	2	6	4362222	4362227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13090	NC_014834	GATGCG	2	12	4363596	4363607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13091	NC_014834	GCG	2	6	4364108	4364113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_014834	GACCG	2	10	4364140	4364149	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13093	NC_014834	CGA	2	6	4365071	4365076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_014834	GCC	2	6	4365082	4365087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13095	NC_014834	CGC	2	6	4365090	4365095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_014834	GTC	2	6	4366346	4366351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_014834	CAG	2	6	4369677	4369682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_014834	GCCG	2	8	4369712	4369719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_014834	TTGA	2	8	4371461	4371468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_014834	TC	3	6	4373339	4373344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13101	NC_014834	GCG	2	6	4373345	4373350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_014834	CGC	2	6	4377001	4377006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_014834	TCC	2	6	4377053	4377058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13104	NC_014834	CCG	2	6	4377065	4377070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_014834	CAT	2	6	4377132	4377137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_014834	CAA	2	6	4377162	4377167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_014834	CG	3	6	4377197	4377202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13108	NC_014834	GAG	2	6	4377221	4377226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_014834	CAAG	2	8	4378123	4378130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13110	NC_014834	TC	3	6	4378150	4378155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13111	NC_014834	AGC	2	6	4378307	4378312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_014834	CAT	2	6	4378393	4378398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_014834	GCC	2	6	4378457	4378462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13114	NC_014834	GCG	2	6	4378473	4378478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_014834	TCG	2	6	4378484	4378489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_014834	CT	3	6	4378499	4378504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13117	NC_014834	TGT	2	6	4378517	4378522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_014834	ACC	2	6	4378565	4378570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_014834	CAT	2	6	4378573	4378578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_014834	GCA	2	6	4378819	4378824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_014834	GCC	2	6	4378857	4378862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13122	NC_014834	CGT	2	6	4378867	4378872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_014834	CGGC	2	8	4378889	4378896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13124	NC_014834	CACGA	2	10	4378912	4378921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13125	NC_014834	TCT	2	6	4378923	4378928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_014834	CCG	2	6	4378964	4378969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13127	NC_014834	GCC	2	6	4378984	4378989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_014834	ACC	2	6	4379025	4379030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13129	NC_014834	GCC	2	6	4379852	4379857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13252	NC_014834	GCTTC	2	10	4410246	4410255	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13253	NC_014834	GGC	2	6	4412017	4412022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13254	NC_014834	GGC	2	6	4412117	4412122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13255	NC_014834	AGC	2	6	4414123	4414128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13258	NC_014834	CGC	2	6	4418868	4418873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13259	NC_014834	CGC	2	6	4418927	4418932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13260	NC_014834	CGA	2	6	4418938	4418943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13261	NC_014834	ATCAA	2	10	4418989	4418998	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13265	NC_014834	GGA	2	6	4420804	4420809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13269	NC_014834	TCG	2	6	4422027	4422032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13375	NC_014834	CG	3	6	4468619	4468624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13386	NC_014834	GC	3	6	4471166	4471171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13387	NC_014834	CCG	2	6	4472985	4472990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13388	NC_014834	CGT	2	6	4472999	4473004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13389	NC_014834	CCG	2	6	4473014	4473019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13412	NC_014834	GC	3	6	4475035	4475040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13416	NC_014834	ACC	2	6	4475328	4475333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13427	NC_014834	GA	4	8	4475936	4475943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13428	NC_014834	CG	3	6	4475977	4475982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13438	NC_014834	GC	3	6	4481727	4481732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13497	NC_014834	CG	3	6	4492948	4492953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13498	NC_014834	CTGC	2	8	4493839	4493846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13499	NC_014834	CGGCC	2	10	4493884	4493893	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13500	NC_014834	GCA	2	6	4493939	4493944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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