MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014834	AGC	2	6	4126174	4126179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_014834	CTG	2	6	4126221	4126226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_014834	AGC	2	6	4126240	4126245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_014834	GCG	2	6	4126246	4126251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_014834	TGA	2	6	4126289	4126294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_014834	ACG	2	6	4126315	4126320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_014834	CCG	2	6	4126479	4126484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_014834	GAT	2	6	4126488	4126493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_014834	CGT	2	6	4126496	4126501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_014834	TTG	2	6	4126522	4126527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_014834	CTCCGC	2	12	4126551	4126562	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12512	NC_014834	GC	3	6	4126561	4126566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12513	NC_014834	CGGC	2	8	4126571	4126578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_014834	GCG	2	6	4126628	4126633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_014834	GCC	2	6	4126659	4126664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12516	NC_014834	TTC	2	6	4126678	4126683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_014834	CGGC	2	8	4126742	4126749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12518	NC_014834	TGT	2	6	4126769	4126774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_014834	CGC	2	6	4126812	4126817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_014834	GTAC	2	8	4126892	4126899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12521	NC_014834	TCG	2	6	4126900	4126905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_014834	GCT	2	6	4127020	4127025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_014834	ACG	2	6	4127065	4127070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_014834	GCT	2	6	4127074	4127079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_014834	CGC	2	6	4127169	4127174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12526	NC_014834	TCC	2	6	4127187	4127192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12527	NC_014834	ACGC	2	8	4127320	4127327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_014834	GAC	2	6	4127510	4127515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_014834	CG	3	6	4127526	4127531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12530	NC_014834	CGC	2	6	4127560	4127565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12531	NC_014834	CGC	2	6	4128151	4128156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12532	NC_014834	GCT	2	6	4130632	4130637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_014834	AGC	2	6	4130648	4130653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_014834	GCG	2	6	4130709	4130714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_014834	GCA	2	6	4130794	4130799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_014834	GCG	2	6	4130800	4130805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_014834	TGC	2	6	4130857	4130862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_014834	GACG	2	8	4130863	4130870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12539	NC_014834	TCT	2	6	4130913	4130918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_014834	CG	3	6	4130961	4130966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12541	NC_014834	TGCCGG	2	12	4131664	4131675	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_014834	CCCG	2	8	4131676	4131683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12543	NC_014834	CCT	2	6	4133883	4133888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12544	NC_014834	TCG	2	6	4133924	4133929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_014834	CGGCC	2	10	4133971	4133980	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12546	NC_014834	GATC	2	8	4134001	4134008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12547	NC_014834	GC	3	6	4134045	4134050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12548	NC_014834	GCG	2	6	4134541	4134546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_014834	CGC	2	6	4134552	4134557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12550	NC_014834	GCG	2	6	4134567	4134572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_014834	CAA	2	6	4134626	4134631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_014834	ACG	2	6	4137085	4137090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_014834	CGG	2	6	4138441	4138446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_014834	GC	4	8	4138468	4138475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12555	NC_014834	GC	3	6	4138480	4138485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12556	NC_014834	TCG	2	6	4138488	4138493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_014834	ATT	2	6	4138532	4138537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_014834	AGC	2	6	4138609	4138614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_014834	CGC	2	6	4138620	4138625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_014834	TTC	2	6	4138630	4138635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_014834	GCCC	2	8	4138998	4139005	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12562	NC_014834	GCCG	2	8	4139018	4139025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12563	NC_014834	GCT	2	6	4139045	4139050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_014834	GGA	2	6	4139119	4139124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_014834	CCT	2	6	4140628	4140633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12566	NC_014834	CCGGA	2	10	4140670	4140679	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12567	NC_014834	CAC	2	6	4140750	4140755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12568	NC_014834	CGCC	2	8	4140906	4140913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12569	NC_014834	GCC	4	12	4141659	4141670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12570	NC_014834	AT	3	6	4141952	4141957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_014834	GCC	2	6	4144915	4144920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12572	NC_014834	GCCC	2	8	4145635	4145642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12573	NC_014834	CTCC	2	8	4145648	4145655	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12574	NC_014834	GCG	2	6	4145664	4145669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_014834	GCC	2	6	4145675	4145680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12576	NC_014834	GAT	2	6	4145683	4145688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_014834	TCT	2	6	4145695	4145700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_014834	GCG	2	6	4146083	4146088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_014834	CGG	2	6	4146106	4146111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12580	NC_014834	GCC	2	6	4146141	4146146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12581	NC_014834	CGG	2	6	4146160	4146165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_014834	GCCG	2	8	4146179	4146186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12583	NC_014834	C	7	7	4146192	4146198	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12584	NC_014834	CGA	2	6	4146203	4146208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_014834	CGG	2	6	4146219	4146224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_014834	CGGC	2	8	4146244	4146251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12587	NC_014834	GTT	2	6	4146630	4146635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_014834	CGTC	2	8	4146690	4146697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12589	NC_014834	CGC	2	6	4146700	4146705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12590	NC_014834	TGC	2	6	4146708	4146713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12591	NC_014834	CGG	2	6	4146822	4146827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_014834	CGC	2	6	4148839	4148844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12593	NC_014834	GCG	3	9	4148854	4148862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_014834	CAACA	2	10	4148884	4148893	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12595	NC_014834	CT	3	6	4150172	4150177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12596	NC_014834	GCGA	2	8	4150186	4150193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12597	NC_014834	TCG	2	6	4150233	4150238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_014834	CTC	2	6	4150244	4150249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12599	NC_014834	GGC	2	6	4150265	4150270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_014834	GCC	3	9	4150290	4150298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12601	NC_014834	CG	3	6	4151436	4151441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12602	NC_014834	TCG	2	6	4151443	4151448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_014834	CTGC	2	8	4151449	4151456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12604	NC_014834	TCG	2	6	4151894	4151899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_014834	GCTG	2	8	4151924	4151931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12606	NC_014834	GCC	2	6	4151936	4151941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12607	NC_014834	CG	3	6	4151964	4151969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12608	NC_014834	CCT	2	6	4151983	4151988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12609	NC_014834	GCG	2	6	4152004	4152009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_014834	GC	3	6	4152033	4152038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12611	NC_014834	CGC	2	6	4152108	4152113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12612	NC_014834	TCC	2	6	4154192	4154197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12613	NC_014834	ATA	2	6	4154227	4154232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_014834	GCC	2	6	4154270	4154275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12615	NC_014834	CGC	2	6	4154357	4154362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12616	NC_014834	GGA	2	6	4157583	4157588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_014834	GGATC	2	10	4158698	4158707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12618	NC_014834	GAAC	2	8	4158748	4158755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12619	NC_014834	GCC	2	6	4159116	4159121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12620	NC_014834	CGG	2	6	4159125	4159130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_014834	GCCG	2	8	4159142	4159149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12622	NC_014834	GCC	2	6	4159153	4159158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12623	NC_014834	GGC	2	6	4160153	4160158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12625	NC_014834	GCC	2	6	4161739	4161744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12626	NC_014834	ATC	2	6	4161764	4161769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12628	NC_014834	GGT	2	6	4161839	4161844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12886	NC_014834	CGACA	2	10	4253323	4253332	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12887	NC_014834	CCG	2	6	4253352	4253357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12889	NC_014834	TCG	2	6	4253441	4253446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12890	NC_014834	GCG	2	6	4253456	4253461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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