MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014834	CAG	2	6	3815760	3815765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_014834	GC	4	8	3815811	3815818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11503	NC_014834	TCG	2	6	3815859	3815864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_014834	CTTCC	2	10	3819457	3819466	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11505	NC_014834	TCT	2	6	3819500	3819505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_014834	TCT	2	6	3819511	3819516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_014834	GCC	2	6	3819529	3819534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11508	NC_014834	GCC	2	6	3819548	3819553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11509	NC_014834	CCGCG	2	10	3819603	3819612	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11510	NC_014834	CGG	2	6	3819627	3819632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_014834	GGC	2	6	3819692	3819697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_014834	TGGC	2	8	3819741	3819748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11513	NC_014834	GCC	2	6	3820919	3820924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11514	NC_014834	C	6	6	3820939	3820944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11515	NC_014834	GAG	2	6	3820952	3820957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_014834	TCG	2	6	3821245	3821250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_014834	A	6	6	3821265	3821270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_014834	GC	3	6	3821277	3821282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11519	NC_014834	GGC	2	6	3825721	3825726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_014834	A	6	6	3825868	3825873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_014834	GCC	2	6	3825882	3825887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11522	NC_014834	GAC	2	6	3825895	3825900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_014834	CCG	3	9	3825936	3825944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_014834	GCG	2	6	3825948	3825953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_014834	GGC	2	6	3827341	3827346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_014834	CCT	2	6	3828110	3828115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11527	NC_014834	GGC	2	6	3828121	3828126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_014834	G	6	6	3828145	3828150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_014834	CCGC	2	8	3828177	3828184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11530	NC_014834	G	6	6	3828202	3828207	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_014834	G	6	6	3828282	3828287	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_014834	CGA	2	6	3828288	3828293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_014834	CGC	2	6	3830041	3830046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_014834	TCCCG	2	10	3830061	3830070	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11535	NC_014834	ATCCG	2	10	3830115	3830124	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11536	NC_014834	GCC	3	9	3830137	3830145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11537	NC_014834	AACT	2	8	3830160	3830167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11538	NC_014834	CGT	2	6	3831190	3831195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_014834	GA	3	6	3831219	3831224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_014834	CGG	2	6	3831725	3831730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_014834	GCC	2	6	3831735	3831740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11542	NC_014834	GCT	2	6	3831792	3831797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_014834	CGA	2	6	3831874	3831879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_014834	ATCA	2	8	3831901	3831908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11545	NC_014834	ATGTT	2	10	3831958	3831967	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_014834	ACC	2	6	3833246	3833251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11547	NC_014834	ACG	2	6	3833283	3833288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_014834	CTG	2	6	3833296	3833301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_014834	ACG	2	6	3833322	3833327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_014834	CGG	2	6	3834417	3834422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_014834	CCA	2	6	3834441	3834446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11552	NC_014834	GGA	2	6	3834458	3834463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_014834	CCG	2	6	3834476	3834481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_014834	TCG	2	6	3838771	3838776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_014834	CGG	3	9	3838807	3838815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_014834	GAT	2	6	3838824	3838829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_014834	TC	3	6	3839360	3839365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11558	NC_014834	CGC	2	6	3841906	3841911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_014834	TCGT	2	8	3841951	3841958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11560	NC_014834	CCGGC	2	10	3843113	3843122	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11561	NC_014834	CGGG	2	8	3843135	3843142	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11562	NC_014834	GCC	2	6	3843194	3843199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_014834	AAG	2	6	3844744	3844749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_014834	CCG	2	6	3844787	3844792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11565	NC_014834	GCC	2	6	3844807	3844812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_014834	CGGC	2	8	3845410	3845417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_014834	GGT	2	6	3847513	3847518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_014834	GAC	2	6	3847550	3847555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_014834	GCG	3	9	3847575	3847583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_014834	ACG	2	6	3847601	3847606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_014834	GC	5	10	3847607	3847616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11572	NC_014834	CCG	2	6	3848968	3848973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11573	NC_014834	CGA	2	6	3848977	3848982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_014834	TGA	2	6	3848997	3849002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_014834	GA	3	6	3849005	3849010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_014834	GAT	2	6	3849028	3849033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_014834	CAG	2	6	3849043	3849048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_014834	CAA	2	6	3849169	3849174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11579	NC_014834	TAT	2	6	3849211	3849216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_014834	GAC	2	6	3849245	3849250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_014834	CG	3	6	3849270	3849275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11582	NC_014834	CG	3	6	3856975	3856980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11583	NC_014834	GC	3	6	3856986	3856991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11584	NC_014834	CG	3	6	3857004	3857009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11585	NC_014834	CGG	2	6	3857074	3857079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11587	NC_014834	GAA	2	6	3857669	3857674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_014834	GGCC	2	8	3858653	3858660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11589	NC_014834	ACG	2	6	3858668	3858673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_014834	GCG	2	6	3858685	3858690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_014834	TCG	2	6	3859229	3859234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_014834	GC	3	6	3859254	3859259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11593	NC_014834	CTCG	2	8	3860214	3860221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_014834	ATG	3	9	3860227	3860235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_014834	CGT	2	6	3860237	3860242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_014834	CG	4	8	3861183	3861190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_014834	ACG	2	6	3861191	3861196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_014834	CCG	2	6	3861200	3861205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11599	NC_014834	CGGCGA	2	12	3861247	3861258	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_014834	CGA	2	6	3861277	3861282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_014834	GTT	2	6	3863637	3863642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_014834	TTC	2	6	3866153	3866158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_014834	GTT	2	6	3866169	3866174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_014834	GCG	2	6	3866218	3866223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_014834	CGA	2	6	3866294	3866299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_014834	CG	3	6	3867299	3867304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11607	NC_014834	GAG	2	6	3867376	3867381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_014834	TCAA	2	8	3867502	3867509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11609	NC_014834	ACC	2	6	3868294	3868299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11610	NC_014834	TCGG	2	8	3868300	3868307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11611	NC_014834	GGCGC	2	10	3868308	3868317	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11612	NC_014834	GTC	2	6	3868967	3868972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_014834	CGG	3	9	3868995	3869003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_014834	GCC	2	6	3869006	3869011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11615	NC_014834	TGC	2	6	3872545	3872550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_014834	GAG	2	6	3872588	3872593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_014834	ATG	2	6	3872604	3872609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_014834	ATG	2	6	3875468	3875473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_014834	CGG	3	9	3875494	3875502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_014834	CGC	2	6	3875511	3875516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11621	NC_014834	TTA	2	6	3876320	3876325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_014834	GCGCG	2	10	3876682	3876691	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11623	NC_014834	CGC	2	6	3878919	3878924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11624	NC_014834	CGG	2	6	3879013	3879018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_014834	CA	3	6	3879440	3879445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11626	NC_014834	ATC	2	6	3882566	3882571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11628	NC_014834	GCC	2	6	3882716	3882721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11999	NC_014834	GGC	2	6	3993575	3993580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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