MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014834	TCA	2	6	3613969	3613974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_014834	GCGA	2	8	3614000	3614007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11003	NC_014834	GCG	2	6	3614070	3614075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_014834	CTTCG	2	10	3618580	3618589	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11005	NC_014834	CGC	2	6	3618667	3618672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_014834	GCG	2	6	3618676	3618681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_014834	GAC	2	6	3618692	3618697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_014834	GCT	2	6	3620345	3620350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_014834	GCG	2	6	3620394	3620399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_014834	CG	3	6	3620453	3620458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11011	NC_014834	TGC	2	6	3621365	3621370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_014834	CGC	2	6	3621373	3621378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_014834	GCG	2	6	3621387	3621392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_014834	ATG	2	6	3621411	3621416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_014834	TCC	2	6	3622292	3622297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11016	NC_014834	GCG	2	6	3622332	3622337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_014834	CCG	2	6	3622354	3622359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_014834	CGGG	2	8	3622416	3622423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11019	NC_014834	GGA	2	6	3622448	3622453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_014834	GAG	2	6	3623162	3623167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_014834	GC	3	6	3623177	3623182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_014834	CGG	2	6	3623226	3623231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_014834	CTC	2	6	3623239	3623244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_014834	CGC	2	6	3624450	3624455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_014834	TTC	2	6	3624492	3624497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_014834	GC	4	8	3624528	3624535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_014834	CGC	2	6	3625781	3625786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11028	NC_014834	TCT	2	6	3626126	3626131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_014834	GGC	2	6	3626136	3626141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_014834	CCG	2	6	3626147	3626152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11031	NC_014834	GCG	2	6	3626190	3626195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_014834	CCG	2	6	3626233	3626238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_014834	GCCG	2	8	3626253	3626260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_014834	TTC	2	6	3626266	3626271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_014834	ATT	2	6	3626287	3626292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_014834	GAC	2	6	3631231	3631236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_014834	GGA	2	6	3631267	3631272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_014834	TGC	2	6	3631309	3631314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_014834	TGG	2	6	3631373	3631378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_014834	CGG	2	6	3631384	3631389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_014834	CGG	3	9	3631398	3631406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_014834	ACG	2	6	3631408	3631413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_014834	ATC	2	6	3631440	3631445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_014834	CGC	2	6	3631489	3631494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11045	NC_014834	GC	3	6	3631493	3631498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_014834	ACCTGC	2	12	3631508	3631519	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11047	NC_014834	TCG	2	6	3631554	3631559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_014834	CGA	2	6	3631573	3631578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_014834	CGC	2	6	3631588	3631593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11050	NC_014834	CGC	3	9	3631609	3631617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11051	NC_014834	GC	3	6	3631623	3631628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11052	NC_014834	GCG	2	6	3631660	3631665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_014834	GTG	2	6	3631740	3631745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_014834	GGC	2	6	3631769	3631774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_014834	CGA	2	6	3631829	3631834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_014834	GAA	2	6	3631938	3631943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_014834	CGG	2	6	3632004	3632009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_014834	TGGC	2	8	3632034	3632041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11059	NC_014834	CCG	2	6	3632060	3632065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11060	NC_014834	CAG	2	6	3632119	3632124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_014834	GCG	2	6	3632202	3632207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_014834	CGA	2	6	3632251	3632256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_014834	CG	3	6	3632267	3632272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_014834	TCG	2	6	3633479	3633484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_014834	AT	3	6	3633571	3633576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_014834	GTC	2	6	3633577	3633582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_014834	CG	4	8	3633584	3633591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_014834	CGG	2	6	3633598	3633603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_014834	TCC	2	6	3633793	3633798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11070	NC_014834	CCG	2	6	3633839	3633844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11071	NC_014834	CG	4	8	3633843	3633850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11072	NC_014834	GGT	2	6	3633880	3633885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_014834	CG	3	6	3633898	3633903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11074	NC_014834	G	6	6	3633929	3633934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_014834	CG	3	6	3633944	3633949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11076	NC_014834	CGCAG	2	10	3633957	3633966	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11077	NC_014834	CAG	2	6	3633998	3634003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_014834	TC	3	6	3636660	3636665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11079	NC_014834	CTTC	2	8	3636666	3636673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11080	NC_014834	TC	3	6	3637010	3637015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11081	NC_014834	TTG	2	6	3637025	3637030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_014834	TTG	2	6	3637040	3637045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_014834	TCG	2	6	3637053	3637058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_014834	CGG	2	6	3639468	3639473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_014834	CTGG	2	8	3639474	3639481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11086	NC_014834	GCA	2	6	3639495	3639500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11087	NC_014834	CGAG	2	8	3639593	3639600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11088	NC_014834	GCA	3	9	3639619	3639627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_014834	ACG	2	6	3639638	3639643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_014834	TCA	2	6	3639661	3639666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_014834	GCG	2	6	3639691	3639696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_014834	CG	5	10	3639698	3639707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11093	NC_014834	GC	3	6	3639714	3639719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11094	NC_014834	CGC	2	6	3641782	3641787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11095	NC_014834	ACC	2	6	3641821	3641826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11096	NC_014834	TGA	2	6	3641834	3641839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_014834	CCGC	2	8	3641904	3641911	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11098	NC_014834	GCA	2	6	3641929	3641934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_014834	CG	4	8	3641943	3641950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_014834	GGCG	2	8	3642036	3642043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11101	NC_014834	GCTG	2	8	3642060	3642067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_014834	GCGA	2	8	3642068	3642075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11103	NC_014834	GCC	2	6	3642088	3642093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11104	NC_014834	ACG	2	6	3642108	3642113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_014834	CCG	2	6	3642142	3642147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11106	NC_014834	ACC	2	6	3645300	3645305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11107	NC_014834	CTAA	2	8	3645338	3645345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_014834	CCG	2	6	3645346	3645351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11109	NC_014834	CG	3	6	3645396	3645401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11110	NC_014834	GCG	2	6	3645439	3645444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_014834	CAC	2	6	3645453	3645458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_014834	TCA	2	6	3645470	3645475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_014834	CGG	2	6	3646382	3646387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_014834	CGC	2	6	3646396	3646401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11115	NC_014834	CGT	2	6	3646524	3646529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_014834	GAC	2	6	3646579	3646584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_014834	GGTC	2	8	3647111	3647118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11118	NC_014834	CGG	2	6	3648920	3648925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_014834	CG	3	6	3648940	3648945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11120	NC_014834	GCAGC	2	10	3648951	3648960	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11121	NC_014834	CGG	2	6	3648984	3648989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_014834	AGC	2	6	3649034	3649039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_014834	CCT	2	6	3650443	3650448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11124	NC_014834	TCG	2	6	3650490	3650495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_014834	TTG	2	6	3650534	3650539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_014834	GC	4	8	3652544	3652551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11127	NC_014834	AGC	2	6	3652552	3652557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_014834	CGC	2	6	3653355	3653360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11129	NC_014834	GCG	2	6	3654969	3654974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_014834	GCT	2	6	3655007	3655012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_014834	CAT	2	6	3655017	3655022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11132	NC_014834	ACG	2	6	3656915	3656920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11133	NC_014834	GCG	3	9	3656924	3656932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11134	NC_014834	GTTC	2	8	3656956	3656963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11135	NC_014834	CGA	2	6	3656967	3656972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11136	NC_014834	CGG	2	6	3657008	3657013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11137	NC_014834	CTT	2	6	3657035	3657040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11138	NC_014834	GC	3	6	3657204	3657209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11139	NC_014834	CGAA	2	8	3657235	3657242	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11140	NC_014834	GCAG	2	8	3657253	3657260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11141	NC_014834	GCC	2	6	3657278	3657283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11142	NC_014834	CCA	2	6	3657330	3657335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11143	NC_014834	CCCT	2	8	3657343	3657350	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11144	NC_014834	CGA	2	6	3657364	3657369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11147	NC_014834	GTCCT	2	10	3659950	3659959	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11148	NC_014834	GCCGA	2	10	3660004	3660013	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11149	NC_014834	CGA	2	6	3660087	3660092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11150	NC_014834	ATG	2	6	3660125	3660130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11151	NC_014834	CGT	2	6	3660132	3660137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11152	NC_014834	CGGG	2	8	3660140	3660147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11153	NC_014834	CGG	2	6	3660166	3660171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11154	NC_014834	CGA	2	6	3660225	3660230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11156	NC_014834	GC	3	6	3668154	3668159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11159	NC_014834	CCGG	2	8	3669190	3669197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11160	NC_014834	CCGCA	2	10	3669319	3669328	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11161	NC_014834	CGC	2	6	3669381	3669386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11162	NC_014834	CCG	2	6	3669411	3669416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11163	NC_014834	GCC	2	6	3669461	3669466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11239	NC_014834	AT	3	6	3708264	3708269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11240	NC_014834	CCG	2	6	3708287	3708292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11243	NC_014834	CCT	2	6	3710999	3711004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11244	NC_014834	CGC	2	6	3711005	3711010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11245	NC_014834	CTCCC	2	10	3711031	3711040	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11246	NC_014834	GGGGGT	2	12	3711058	3711069	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11247	NC_014834	CCCCA	2	10	3711098	3711107	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11248	NC_014834	GC	3	6	3711131	3711136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11249	NC_014834	CACG	2	8	3711137	3711144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11250	NC_014834	CAA	2	6	3711183	3711188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11251	NC_014834	TGCT	2	8	3712023	3712030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11252	NC_014834	CGC	2	6	3712043	3712048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11253	NC_014834	GC	3	6	3712047	3712052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11254	NC_014834	TGC	2	6	3712096	3712101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11255	NC_014834	GCTC	2	8	3715319	3715326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11257	NC_014834	CG	3	6	3715420	3715425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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