MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014834	CTGC	2	8	3487120	3487127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10502	NC_014834	GTT	2	6	3487233	3487238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_014834	CG	3	6	3487243	3487248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10504	NC_014834	GCG	2	6	3487268	3487273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_014834	ATCG	2	8	3487300	3487307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10506	NC_014834	GGC	2	6	3487353	3487358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_014834	GGC	2	6	3487394	3487399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_014834	TGG	2	6	3487423	3487428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_014834	GTC	2	6	3487434	3487439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_014834	GCA	2	6	3487459	3487464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_014834	CGA	2	6	3487489	3487494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_014834	GTC	2	6	3487537	3487542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_014834	CCT	2	6	3487952	3487957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10514	NC_014834	AAT	2	6	3487963	3487968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_014834	CG	3	6	3487979	3487984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10516	NC_014834	GTG	2	6	3488059	3488064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_014834	GAC	2	6	3488090	3488095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_014834	CGAT	2	8	3488185	3488192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10519	NC_014834	CAT	2	6	3488230	3488235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_014834	CCGA	2	8	3488342	3488349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10521	NC_014834	GCC	2	6	3488354	3488359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10522	NC_014834	AAT	2	6	3488463	3488468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_014834	CGCTT	2	10	3488479	3488488	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10524	NC_014834	TTC	2	6	3488521	3488526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_014834	CCGG	2	8	3488588	3488595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10526	NC_014834	TGC	2	6	3488610	3488615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_014834	CTTT	2	8	3488634	3488641	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10528	NC_014834	CAC	2	6	3488662	3488667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10529	NC_014834	GGGC	2	8	3488692	3488699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10530	NC_014834	TCT	2	6	3488748	3488753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_014834	AAT	2	6	3488793	3488798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_014834	GC	3	6	3489252	3489257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10533	NC_014834	GCA	2	6	3489348	3489353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_014834	CGC	2	6	3489374	3489379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10535	NC_014834	GGC	2	6	3489421	3489426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_014834	CGCC	2	8	3489509	3489516	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10537	NC_014834	TCG	2	6	3489569	3489574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_014834	CGG	2	6	3489624	3489629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_014834	GTC	2	6	3489636	3489641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_014834	TGGC	2	8	3489645	3489652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10541	NC_014834	GCTG	2	8	3489688	3489695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10542	NC_014834	CGC	2	6	3489745	3489750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10543	NC_014834	GGC	2	6	3489987	3489992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_014834	ACGG	2	8	3490015	3490022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10545	NC_014834	AGC	2	6	3490083	3490088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_014834	TCA	2	6	3492169	3492174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_014834	GCG	2	6	3492193	3492198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_014834	CGGC	2	8	3492235	3492242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10549	NC_014834	GA	3	6	3493595	3493600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_014834	ACT	2	6	3493700	3493705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_014834	CGGC	2	8	3493738	3493745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10552	NC_014834	CAG	2	6	3493817	3493822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_014834	AGCA	2	8	3493847	3493854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_014834	CTT	2	6	3493896	3493901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_014834	GTC	2	6	3493907	3493912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_014834	GTC	2	6	3493922	3493927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_014834	TTG	2	6	3493933	3493938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_014834	CGA	2	6	3494011	3494016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_014834	GGC	2	6	3494018	3494023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_014834	CCG	3	9	3494044	3494052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10561	NC_014834	GAT	2	6	3494102	3494107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_014834	ATCGG	2	10	3494134	3494143	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10563	NC_014834	GTT	2	6	3496355	3496360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_014834	GCG	3	9	3496377	3496385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_014834	AC	3	6	3496427	3496432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10566	NC_014834	AT	3	6	3496441	3496446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_014834	A	6	6	3496529	3496534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_014834	CTT	2	6	3496563	3496568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_014834	ATC	2	6	3496649	3496654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_014834	CAG	2	6	3496666	3496671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_014834	A	6	6	3496702	3496707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_014834	ACT	2	6	3496903	3496908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10574	NC_014834	TCA	2	6	3496923	3496928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10577	NC_014834	GGA	2	6	3497103	3497108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10580	NC_014834	GCG	2	6	3497224	3497229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_014834	CAT	2	6	3497463	3497468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10584	NC_014834	CAT	2	6	3497651	3497656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10587	NC_014834	GC	3	6	3497693	3497698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10591	NC_014834	CG	3	6	3497796	3497801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_014834	CTT	2	6	3497816	3497821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_014834	CG	3	6	3497873	3497878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10594	NC_014834	CGGC	2	8	3497900	3497907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10595	NC_014834	CGA	2	6	3497922	3497927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10597	NC_014834	TCG	2	6	3498032	3498037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_014834	GTC	2	6	3498064	3498069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_014834	CTTT	2	8	3498138	3498145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10600	NC_014834	CG	3	6	3498147	3498152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10601	NC_014834	ACA	2	6	3498238	3498243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_014834	CT	3	6	3498350	3498355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10603	NC_014834	ACA	3	9	3498356	3498364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_014834	GCA	2	6	3507905	3507910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_014834	GAT	2	6	3507928	3507933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_014834	AGCA	2	8	3507941	3507948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10607	NC_014834	CAA	2	6	3507960	3507965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_014834	GTA	2	6	3507979	3507984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10610	NC_014834	GC	3	6	3508047	3508052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10611	NC_014834	GC	3	6	3508138	3508143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10612	NC_014834	GGC	2	6	3508145	3508150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_014834	GAC	2	6	3508265	3508270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_014834	GCA	2	6	3508351	3508356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10615	NC_014834	CG	3	6	3508422	3508427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10616	NC_014834	ACG	2	6	3508434	3508439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10617	NC_014834	CGG	2	6	3508449	3508454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_014834	ACG	3	9	3508533	3508541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_014834	GAA	2	6	3508621	3508626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_014834	GCC	2	6	3508630	3508635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10621	NC_014834	ACG	2	6	3508638	3508643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_014834	CCCGG	2	10	3508714	3508723	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10623	NC_014834	GC	3	6	3508745	3508750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10624	NC_014834	CGGCC	2	10	3508776	3508785	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10625	NC_014834	GAGG	2	8	3510022	3510029	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_014834	GCA	2	6	3510069	3510074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10628	NC_014834	GCCCT	2	10	3510149	3510158	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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