MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014834	CGA	2	6	3322440	3322445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_014834	TGCC	2	8	3322459	3322466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_014834	CG	3	6	3322478	3322483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_014834	CG	3	6	3322545	3322550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_014834	CG	3	6	3322611	3322616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10006	NC_014834	CG	3	6	3322676	3322681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10007	NC_014834	GC	3	6	3322720	3322725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_014834	CG	3	6	3322742	3322747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_014834	AAC	2	6	3322762	3322767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_014834	AAG	2	6	3322790	3322795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_014834	CG	3	6	3322807	3322812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_014834	CTG	2	6	3322843	3322848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_014834	CG	3	6	3322874	3322879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10014	NC_014834	GCG	2	6	3322907	3322912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_014834	CGT	2	6	3322913	3322918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_014834	CG	3	6	3322926	3322931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10017	NC_014834	CG	3	6	3322940	3322945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_014834	GC	3	6	3322964	3322969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_014834	CG	3	6	3323006	3323011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_014834	CG	3	6	3323073	3323078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_014834	ACA	2	6	3323094	3323099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_014834	GCC	3	9	3323104	3323112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_014834	CG	3	6	3323141	3323146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10024	NC_014834	CG	3	6	3323207	3323212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_014834	CG	3	6	3323272	3323277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10026	NC_014834	CG	3	6	3323338	3323343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_014834	GC	3	6	3323347	3323352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10028	NC_014834	CCG	2	6	3323353	3323358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_014834	GCA	2	6	3323362	3323367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_014834	TC	3	6	3323427	3323432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_014834	GCG	2	6	3323468	3323473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_014834	GCG	2	6	3323510	3323515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_014834	TCA	2	6	3323524	3323529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_014834	AAC	2	6	3323597	3323602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_014834	GCTT	2	8	3323636	3323643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10036	NC_014834	GCCT	2	8	3323679	3323686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10037	NC_014834	AG	3	6	3325755	3325760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_014834	GGC	3	9	3326623	3326631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_014834	CGGC	2	8	3326637	3326644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_014834	TCGA	2	8	3326653	3326660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10041	NC_014834	CGG	2	6	3326664	3326669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_014834	CG	3	6	3326678	3326683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_014834	TCG	2	6	3326697	3326702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_014834	CGG	2	6	3326709	3326714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_014834	CGG	2	6	3326727	3326732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_014834	TCG	2	6	3326744	3326749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_014834	CGTC	2	8	3326766	3326773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_014834	ATC	2	6	3326774	3326779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_014834	CG	4	8	3326859	3326866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_014834	GCC	2	6	3326902	3326907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_014834	CCG	2	6	3326936	3326941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_014834	CGG	2	6	3328615	3328620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_014834	GCC	2	6	3328630	3328635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10054	NC_014834	ACC	2	6	3328669	3328674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_014834	CGAA	2	8	3328781	3328788	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10056	NC_014834	CGT	2	6	3328825	3328830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_014834	GTC	3	9	3328849	3328857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_014834	TCA	2	6	3328913	3328918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_014834	CAT	2	6	3328922	3328927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_014834	GC	3	6	3329019	3329024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_014834	GGCGA	2	10	3329054	3329063	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10062	NC_014834	CAG	2	6	3329104	3329109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_014834	ACA	2	6	3329979	3329984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_014834	CGG	3	9	3333427	3333435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_014834	GTT	2	6	3335421	3335426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_014834	TCGC	2	8	3335449	3335456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_014834	CG	4	8	3336375	3336382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10068	NC_014834	TCA	2	6	3336418	3336423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_014834	GTT	2	6	3336425	3336430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_014834	CGG	2	6	3336447	3336452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_014834	CGG	2	6	3336489	3336494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_014834	TG	3	6	3336509	3336514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_014834	GAA	2	6	3336549	3336554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_014834	CAT	2	6	3338889	3338894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_014834	CAT	2	6	3338910	3338915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_014834	ACG	2	6	3343327	3343332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_014834	ACC	2	6	3343339	3343344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_014834	GCGAT	2	10	3343363	3343372	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10079	NC_014834	CG	3	6	3343375	3343380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10080	NC_014834	CCGC	2	8	3343445	3343452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10081	NC_014834	AAC	2	6	3343567	3343572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_014834	CGCCC	2	10	3343990	3343999	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10083	NC_014834	CG	3	6	3345863	3345868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10084	NC_014834	ATG	2	6	3345882	3345887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_014834	C	6	6	3345920	3345925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10086	NC_014834	TGT	2	6	3348573	3348578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_014834	GT	3	6	3348577	3348582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_014834	TCC	2	6	3349014	3349019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_014834	GCG	2	6	3350181	3350186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_014834	CGT	2	6	3350202	3350207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_014834	CAGCG	2	10	3350305	3350314	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10092	NC_014834	GCG	2	6	3350351	3350356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_014834	CGCGG	2	10	3352461	3352470	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10094	NC_014834	CGC	2	6	3354189	3354194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_014834	CCG	2	6	3354203	3354208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_014834	GAT	2	6	3354210	3354215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_014834	GGT	2	6	3354271	3354276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_014834	GTTGCC	2	12	3354665	3354676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_014834	TCC	2	6	3355151	3355156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_014834	CAT	2	6	3355231	3355236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_014834	ACCG	2	8	3355286	3355293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_014834	GGAG	2	8	3355314	3355321	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014834	GC	4	8	3357447	3357454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_014834	TCC	2	6	3358159	3358164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_014834	AACA	2	8	3358958	3358965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10106	NC_014834	TGC	2	6	3359395	3359400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_014834	AGA	2	6	3359410	3359415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_014834	GCC	2	6	3359829	3359834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_014834	AAG	2	6	3359852	3359857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_014834	GC	3	6	3359867	3359872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10111	NC_014834	GC	3	6	3359884	3359889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_014834	TCC	2	6	3361477	3361482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_014834	GTT	3	9	3361486	3361494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_014834	ACC	2	6	3361509	3361514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_014834	CGC	2	6	3361520	3361525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_014834	TCA	2	6	3361528	3361533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_014834	GTC	2	6	3361593	3361598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_014834	CG	3	6	3361666	3361671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_014834	CG	3	6	3361677	3361682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_014834	GCA	2	6	3362820	3362825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_014834	AG	3	6	3362882	3362887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_014834	GCCG	2	8	3362953	3362960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_014834	CCG	2	6	3363018	3363023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_014834	GTC	2	6	3363053	3363058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_014834	TCC	2	6	3363063	3363068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10126	NC_014834	GAGG	2	8	3363076	3363083	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_014834	CG	3	6	3367116	3367121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_014834	TGA	2	6	3370467	3370472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_014834	TGA	2	6	3370476	3370481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_014834	TGC	2	6	3370502	3370507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_014834	GCG	3	9	3370533	3370541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_014834	GCC	2	6	3370606	3370611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10133	NC_014834	CGC	2	6	3372755	3372760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10134	NC_014834	CTG	2	6	3372786	3372791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_014834	CGC	2	6	3372823	3372828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10163	NC_014834	CGC	2	6	3387354	3387359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10173	NC_014834	CCGG	2	8	3389545	3389552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10222	NC_014834	CG	3	6	3415651	3415656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10223	NC_014834	CGGCG	2	10	3415712	3415721	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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10230	NC_014834	CCACC	2	10	3427430	3427439	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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10232	NC_014834	CCGG	2	8	3430132	3430139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10233	NC_014834	CGC	2	6	3430140	3430145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10236	NC_014834	ACC	2	6	3430886	3430891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10237	NC_014834	CGA	2	6	3430906	3430911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10239	NC_014834	CCG	2	6	3430997	3431002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10245	NC_014834	AGA	2	6	3436194	3436199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10247	NC_014834	CG	3	6	3436236	3436241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10248	NC_014834	CGG	3	9	3436253	3436261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10249	NC_014834	TTCGT	2	10	3436318	3436327	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10250	NC_014834	CCA	2	6	3436387	3436392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10251	NC_014834	CG	3	6	3436531	3436536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10252	NC_014834	GC	4	8	3436541	3436548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10253	NC_014834	CCT	2	6	3437255	3437260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_014834	GTC	2	6	3437261	3437266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10255	NC_014834	AAAAC	2	10	3437353	3437362	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10256	NC_014834	CGCCC	2	10	3438079	3438088	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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10258	NC_014834	GCAG	2	8	3438142	3438149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10500	NC_014834	TTG	2	6	3487107	3487112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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